L'apport des marqueurs moléculaires et de la génomique pour l'utilisation des ressources génétiques chez la tomate
Résumé
La tomate est l'un des légumes les plus produits dans le monde et cette espèce est également un ,modèle dans le domaine scientifique pour l'étude du développement du fruit. Au cours des 60 dernières années, de nombreuses campagnes de collecte en Amérique Centrale et du Sud (zone d'origine), mais aussi dans le monde entier, ont permis de conserver plus de 83.000 accessions chez cette espèce. En parallèle, l'apport de la biologie moléculaire au travers du développement de marqueurs moléculaires a permis de cartographier de nombreux QTL pour des caractères d'intérêt tels que la qualité du fruit ou la résistance à des stress biotiques et abiotiques. Depuis 2012, date de la publication du génome séquencé de la tomate, la combinaison de ces importantes ressources génétiques et de la génomique haut-débit permet d'étendre les travaux à l'échelle du génome afin de mieux comprendre sa nature, d'identifier un grand nombre de sites polymorphes mais aussi de revisiter des questions scientifiques, telles que l'histoire évolutive de cette espèce et l'étude de l'architecture génétique de caractères quantitatifs par le biais de nouvelles approches comme la génétique d'association ou la sélection génomique. Les ressources génétiques disponibles chez cette espèce sont primordiales pour la recherche scientifique fondamentale mais aussi pour l'amélioration génétique de cette espèce.