Caractérisation génétique des races locales françaises de poules : Projet Biodiva - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Poster De Conférence Année : 2017

Caractérisation génétique des races locales françaises de poules : Projet Biodiva

Résumé

The small population sizes of French local breeds raise the question of their in- or ex-situ conservation. For that goal the characterization of their genetic diversity with molecular tools appears as a preliminary key step. 22 local breeds along with 4 control widespread lines with an average of 60 individuals per breed were genotyped using a 57K DNA SNP chip leading to a total sample made of 26 breeds and 1516 individuals. Within breed genetic diversity was good but variable among them (mean F comprised between 3 and 28%), inbreeding coefficients being related to the population sizes. Among breed diversity was large (Fst=0.25) allowing for a clear genetic identification of breeds. Relationships among breeds figured out their history (origin, breeders) or usage (broilers, layers...). Finally combining these genetic analyses with morphological data could help detecting genomic region of interest in a selection perspective. To conclude, French local breeds appeared to be largely diversified genetically and morphologically making them a good example of a successful management by both breeders and selection centers. Nevertheless much attention should be paid for their long term conservation.
Les faibles effectifs observés chez les races traditionnelles, locales et/ou anciennes posent la question de leur conservation in- ou ex-situ. La caractérisation de leur diversité génétique est un des déterminants essentiels de leur maintien et les analyses moléculaires s’avèrent être l’outil idéal pour cela. 22 races locales de poules ont donc été génotypées à raison de 60 individus par population en moyenne avec une puce à ADN haute densité (57K). 4 lignées commerciales témoin ont également été intégrées, soit un total de 26 populations et 1516 individus. La diversité intra-race est bonne, avec un niveau de consanguinité correct mais variable entre races (F moyen compris entre 3 et 28%), le niveau de consanguinité d’une race étant logiquement lié avec ses effectifs. Il existe également une grande diversité entre races (Fst=0.25), qui se différencient bien les unes des autres. De plus, les relations observées entre races sont cohérentes avec leurs histoires. La structuration génétique s’explique ensuite principalement par la conduite des élevages. L’usage des races (pondeuses, de chair, commerciales) affecte aussi leur structure génétique. Finalement, ces analyses, combinées à la description morphologique des races, pourraient permettre de détecter des zones du génome d’intérêt pour la sélection. En conclusion, les races locales françaises de poules présentent une grande diversité génétique, avec des spécificités, permettant de les distinguer très clairement les unes des autres. De plus leur gestion semble bien menée par les éleveurs et centres de sélection avec le maintien d’une diversité intra et inter-population relativement importante.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01603831 , version 1 (02-10-2017)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01603831 , version 1
  • PRODINRA : 396699

Citer

Gwendal Restoux, Xavier X Rognon, Agathe Vieaud, Daniel Guemene, Geoffrey Chiron, et al.. Caractérisation génétique des races locales françaises de poules : Projet Biodiva. 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, 1124 p., 2017, 12èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras. ⟨hal-01603831⟩
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