Shared genetic predisposition in rheumatoid arthritis-interstitial lung disease and familial pulmonary fibrosis
Pierre-Antoine Juge
(1, 2, 3)
,
Raphaël Borie
(2, 3, 4, 5)
,
Caroline Kannengiesser
(6, 2, 3, 7, 8)
,
Steven Gazal
(9, 3, 8, 10)
,
Patrick Revy
(11, 8, 12)
,
Lidwine Wemeau-Stervinou
(13, 14)
,
Marie-Pierre Debray
(2, 3, 15)
,
Sébastien Ottaviani
(1, 2, 3)
,
Sylvain Marchand-Adam
(4, 16, 17)
,
Nadia Nathan
(18, 19, 20)
,
Gabriel Thabut
(2, 3, 5, 4)
,
Christophe Richez
(21, 22, 23, 24)
,
Hilario Nunes
(4, 3)
,
Isabelle Callebaut
(19, 25, 26, 23, 27, 28)
,
Aurélien Justet
(2, 3, 4)
,
Nicolas Leulliot
(29, 23, 30, 3)
,
Amélie Bonnefond
(31, 23, 32)
,
David Salgado
(33, 8)
,
Pascal Richette
(2, 3, 34, 8)
,
Jean-Pierre Desvignes
(33, 8)
,
Huguette Lioté
(4)
,
Philippe Froguel
(35, 23, 36)
,
Yannick Allanore
(30, 37, 38)
,
Olivier Sand
(31, 23, 32)
,
Claire Dromer
(39)
,
René Marc Flipo
(40)
,
Annick Clement
(18, 19, 20)
,
Christophe Béroud
(33, 8, 41)
,
Jean Sibilia
(42, 43, 8, 44)
,
Baptiste Coustet
(1, 2, 3)
,
Vincent Cottin
(45, 46)
,
Marie-Christophe Boissier
(47)
,
Benoit Wallaert
(13, 14)
,
Thierry Schaeverbeke
(21, 22, 23, 24)
,
Florence Dastot Le Moal
(18, 20)
,
Aline Frazier
(2, 42)
,
Christelle Menard
(20, 18, 19)
,
Martin Soubrier
(48, 49, 50)
,
Nathalie Saidenberg
(25, 51)
,
Dominique Valeyre
(4, 3)
,
Serge Amselem
(20, 18, 19, 20)
,
Catherine Boileau
(2, 3, 52)
,
Bruno Crestani
(2, 3, 4, 5)
,
Pierre Dieude
(6, 2, 3, 7, 8)
1
Service de Rhumathologie
2 UPD7 - Université Paris Diderot - Paris 7
3 USPC - Université Sorbonne Paris Cité
4 Service de Pneumologie
5 PHERE (UMR_S_1152 / U1152) - Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires
6 Service de Génétique
7 UMR 1149
8 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
9 EEF - Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018]
10 Plateforme de génomique constitutionnelle
11 IMAGINE - U1163 - Imagine - Institut des maladies génétiques
12 Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
13 Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie [CHU LIlle]
14 Université de Lille
15 Service de Radiologie
16 UMR 1100
17 UT - Université de Tours
18 Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique
19 UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6
20 CHU Trousseau [APHP]
21 Service de Rhumatologie
22 ImmunoConcept - Immunology from Concept and Experiments to Translation = Immunologie Conceptuelle, Expérimentale et Translationnelle
23 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
24 UB - Université de Bordeaux
25 SU - Sorbonne Université
26 IMPMC - Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie
27 IRD [France-Ouest] - Institut de Recherche pour le Développement
28 MNHN - Muséum national d'Histoire naturelle
29 LCRB - UMR 8015 - Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
30 UPD5 - Université Paris Descartes - Paris 5
31 Université de Lille, Droit et Santé
32 EGID - Institut Européen de Génomique du Diabète - European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508
33 GMGF - Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle
34 UMR 1132, Service de Rhumatologie
35 EGENODIA (GI3M) - Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283
36 Department of Genomics of Common Diseases
37 Service Rhumatologie A
38 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
39 Service Imagerie
40 service de Rhumatologie
41 LGMR - Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques
42 Service Rhumatologie
43 IRM - Immuno-Rhumatologie Moléculaire
44 Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE
45 RPC - Rétrovirus et Pathologie Comparée
46 Maladie Pulmonaires Rares
47 UMR U1125 Service rhumatologie
48 Service Rhumatologie [CHU Clermont-Ferrand]
49 UNH - Unité de Nutrition Humaine
50 CRNH d'Auvergne - Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne
51 Hôpital Avicenne [AP-HP]
52 service de génétique
2 UPD7 - Université Paris Diderot - Paris 7
3 USPC - Université Sorbonne Paris Cité
4 Service de Pneumologie
5 PHERE (UMR_S_1152 / U1152) - Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires
6 Service de Génétique
7 UMR 1149
8 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
9 EEF - Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018]
10 Plateforme de génomique constitutionnelle
11 IMAGINE - U1163 - Imagine - Institut des maladies génétiques
12 Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
13 Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie [CHU LIlle]
14 Université de Lille
15 Service de Radiologie
16 UMR 1100
17 UT - Université de Tours
18 Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique
19 UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6
20 CHU Trousseau [APHP]
21 Service de Rhumatologie
22 ImmunoConcept - Immunology from Concept and Experiments to Translation = Immunologie Conceptuelle, Expérimentale et Translationnelle
23 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
24 UB - Université de Bordeaux
25 SU - Sorbonne Université
26 IMPMC - Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie
27 IRD [France-Ouest] - Institut de Recherche pour le Développement
28 MNHN - Muséum national d'Histoire naturelle
29 LCRB - UMR 8015 - Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
30 UPD5 - Université Paris Descartes - Paris 5
31 Université de Lille, Droit et Santé
32 EGID - Institut Européen de Génomique du Diabète - European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508
33 GMGF - Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle
34 UMR 1132, Service de Rhumatologie
35 EGENODIA (GI3M) - Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283
36 Department of Genomics of Common Diseases
37 Service Rhumatologie A
38 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
39 Service Imagerie
40 service de Rhumatologie
41 LGMR - Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques
42 Service Rhumatologie
43 IRM - Immuno-Rhumatologie Moléculaire
44 Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE
45 RPC - Rétrovirus et Pathologie Comparée
46 Maladie Pulmonaires Rares
47 UMR U1125 Service rhumatologie
48 Service Rhumatologie [CHU Clermont-Ferrand]
49 UNH - Unité de Nutrition Humaine
50 CRNH d'Auvergne - Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne
51 Hôpital Avicenne [AP-HP]
52 service de génétique
Raphaël Borie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 770718
- ORCID : 0000-0002-9906-0024
- IdRef : 081295626
Patrick Revy
- Fonction : Auteur
- PersonId : 738943
- IdHAL : patrick-revy
- ORCID : 0000-0003-0758-8022
- IdRef : 154700126
Sylvain Marchand-Adam
- Fonction : Auteur
- PersonId : 989455
Nadia Nathan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1029287
- IdHAL : nadianathan
- ORCID : 0000-0001-5149-7975
- IdRef : 081559410
Christophe Richez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756184
- ORCID : 0000-0002-3029-8739
- IdRef : 114661057
Isabelle Callebaut
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178738
- IdHAL : isabelle-callebaut
- ORCID : 0000-0003-3124-887X
- IdRef : 089078500
Amélie Bonnefond
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305499
- IdHAL : amelie-bonnefond
- ORCID : 0000-0001-9976-3005
David Salgado
- Fonction : Auteur
- PersonId : 16191
- IdHAL : david-salgado
- ORCID : 0000-0002-5905-3591
- IdRef : 139792147
Pascal Richette
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762713
- ORCID : 0000-0003-2132-4074
- IdRef : 08074205X
Jean-Pierre Desvignes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 16982
- IdHAL : jean-pierre-desvignes
- ORCID : 0000-0003-3142-1994
- IdRef : 253119243
Annick Clement
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1266387
- ORCID : 0000-0003-3696-7814
- IdRef : 059789093
Christophe Béroud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 16989
- IdHAL : christophe-beroud
- ORCID : 0000-0003-2986-8738
- IdRef : 155036343
Vincent Cottin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 784269
- ORCID : 0000-0002-5591-0955
- IdRef : 166774731
Florence Dastot Le Moal
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1182834
- IdHAL : florence-dastot-le-moal
- ORCID : 0000-0001-7368-5344
Martin Soubrier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 760322
- ORCID : 0000-0001-9349-0720
- IdRef : 074723375
Serge Amselem
- Fonction : Auteur
- PersonId : 936326
- IdHAL : serge-amselem
- ORCID : 0000-0001-9506-3968
- IdRef : 066957761
Catherine Boileau
- Fonction : Auteur
- PersonId : 755735
- ORCID : 0000-0002-0371-7539
- IdRef : 057319952
Résumé
Despite its high prevalence and mortality, little is known about the pathogenesis of rheumatoid arthritis-associated interstitial lung disease (RA-ILD). Given that familial pulmonary fibrosis (FPF) and RA-ILD frequently share the usual pattern of interstitial pneumonia and common environmental risk factors, we hypothesised that the two diseases might share additional risk factors, including FPF-linked genes. Our aim was to identify coding mutations of FPF-risk genes associated with RA-ILD.We used whole exome sequencing (WES), followed by restricted analysis of a discrete number of FPF-linked genes and performed a burden test to assess the excess number of mutations in RA-ILD patients compared to controls.Among the 101 RA-ILD patients included, 12 (11.9%) had 13 WES-identified heterozygous mutations in the TERT, RTEL1, PARN or SFTPC coding regions. The burden test, based on 81 RA-ILD patients and 1010 controls of European ancestry, revealed an excess of TERT, RTEL1, PARN or SFTPC mutations in RA-ILD patients (OR 3.17, 95% CI 1.53-6.12; p=9.45x10-4). Telomeres were shorter in RA-ILD patients with a TERT, RTEL1 or PARN mutation than in controls (p=2.87x10-2).