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Poster De Conférence Année : 2017

Analyse fonctionnelle des régions génomiques associées à la réponse à la coccidiose à Eimeria maxima chez des poulets de chair

Résumé

Coccidiosis is a parasitic disease caused by species from Eimeria genus, widespread in poultry farming, leading to important losses by its direct impact on production and the associated control measures. The integrative management against this disease should lead to include new parameters of animal’s response to coccidiosis in selection schemes. Our goal was to study the variability of broilers’ response to coccidiosis caused by Eimeria maxima, to identify associated genomic regions and to understand underlying biological mechanisms. We performed an experimental infection with 2 024 animals and measured phenotypes of animals’ response (body weight, temperature, lesions and many blood parameters). Animals have been genotyped using a 580K SNP panel, and the genome-wide association study has revealed genomic regions highly significantly associated to body weight gain, plasma colour and plasma β2-globuline concentration. The analysis of biological functions of genes has shown the major role played by biological pathways of metabolism and some innate immune parameters. The analysis of interactions has shown very significant networks centred on gut repair or cardiovascular functions. The genetic markers identified during this study can be used in selection programmes.
La coccidiose est une parasitose intestinale causée par des espèces du genre Eimeria, très répandue dans les élevages avicoles à l’origine de pertes importantes par son impact direct sur la production et les mesures de lutte associées. La gestion intégrée de cette pathologie devrait conduire à inclure dans les programmes de sélection des critères relatifs à la réponse des animaux à la coccidiose. Notre objectif a donc été d’étudier la variabilité de la réponse de poulets de chair à Eimeria maxima et d’identifier les régions génomiques associées, puis de comprendre les mécanismes biologiques sous-jacents. Pour cela, nous avons réalisé une infection expérimentale sur 2 024 animaux et mesuré des phénotypes (poids, température, lésions et de nombreux paramètres sanguins) de la réponse des animaux. Afin de comprendre les bases génétiques de cette réponse, ces animaux ont été génotypés à l’aide d’un panel de 580K marqueurs SNP. L’étude d’association génomique a permis d’identifier des régions du génome très significativement associées avec le gain de poids, la coloration plasmatique ou le taux plasmatique de β2-globuline. Une analyse des fonctions biologiques des gènes a révélé la grande importance des voies biologiques de métabolisme énergétique et de certains paramètres de réponse innée. Une analyse des interactions a identifié des réseaux très significatifs centrés sur des fonctions de réparation intestinale ou cardiovasculaires.Les marqueurs génétiques identifiés lors de cette étude peuvent être utilisés dans des programmes de sélection.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01530827 , version 1 (31-05-2017)

Licence

Paternité - Partage selon les Conditions Initiales

Identifiants

  • HAL Id : hal-01530827 , version 1
  • PRODINRA : 390414

Citer

Edin Hamzic, Marie-Hélène Pinard-van Der Laan, Bart Buitenhuis, Rachel Hawken, Bertrand Bed'Hom. Analyse fonctionnelle des régions génomiques associées à la réponse à la coccidiose à Eimeria maxima chez des poulets de chair. 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12, 2017, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras. ⟨hal-01530827⟩
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