Article Dans Une Revue Veterinary Research Année : 2016

Transmission tree of the highly pathogenic avian influenza (H5N1) epidemic in Israel, 2015

Timothée Vergne
Connectez-vous pour contacter l'auteur
Guillaume Fournié
Michal Perry Markovich
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1002966
Rolf J. F. Ypma
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1002967
Ram Katz
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1002968
Irena Shkoda
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1002969
Avishai Lublin
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1002970
Shimon Perk
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1002971
Dirk U. Pfeiffer
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 979391

Résumé

The transmission tree of the Israeli 2015 epidemic of highly pathogenic avian influenza (H5N1) was modelled by combining the spatio-temporal distribution of the outbreaks and the genetic distance between virus isolates. The most likely successions of transmission events were determined and transmission parameters were estimated. It was found that the median infectious pressure exerted at 1 km was 1.59 times (95% CI 1.04, 6.01) and 3.54 times (95% CI 1.09, 131.75) higher than that exerted at 2 and 5 km, respectively, and that three farms were responsible for all seven transmission events.

Fichier principal
Vignette du fichier
13567_2016_Article_393.pdf (1.13 Mo) Télécharger le fichier
13567_2016_393_MOESM1_ESM.pdf (150.42 Ko) Télécharger le fichier
Origine Publication financée par une institution
Licence
Origine Publication financée par une institution
Licence

Dates et versions

hal-01479391 , version 1 (28-02-2017)

Licence

Identifiants

Citer

Timothée Vergne, Guillaume Fournié, Michal Perry Markovich, Rolf J. F. Ypma, Ram Katz, et al.. Transmission tree of the highly pathogenic avian influenza (H5N1) epidemic in Israel, 2015. Veterinary Research, 2016, 47 (1), pp.109. ⟨10.1186/s13567-016-0393-2⟩. ⟨hal-01479391⟩

Collections

58 Consultations
115 Téléchargements

Altmetric

Partager

  • More