La protection des ressources en eau vis-à-vis des pollutions d'origine agricole fait l'objet en Europe d'une réglementation renforcée comportant aujourd'hui des obligations de résultats ce qui incite les villes à agir sur les pratiques des agriculteurs dans les Aires d'Alimentation de Captages. Dans ce travail, les modalités de construction des accords entre trois collectivités (Munich et Augsburg en Allemagne, Lons-le-Saunier en France) et les agriculteurs sont analysées à partir de données secondaires et d'entretiens directs auprès d'acteurs régionaux. Examinant tout particulièrement la place qu'occupe dans ces accords l'incitation à la conversion vers l'Agriculture Biologique, nous avons identifié ainsi des facteurs favorables mais non nécessairement suffisants à son développement : systèmes de production initialement extensifs, filières biologiques structurées et demandeuses, incitations financières attractives, importance d'un facilitateur technique intermédiaire et inscription du dialogue et des contrats sur des temps suffisamment longs.