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Communication Dans Un Congrès Année : 2013

Etude, par simulations, de l'intérêt d'une sélection génomique dans une population porcine de type mâle

Résumé

Des simulations stochastiques ont été réalisées pour comparer l'efficacité de schémas de sélection porcins s'appuyant sur des évaluations génétiques BLUP-modèle animal (BLUPMA) ou sur des évaluations génomiques. La population simulée contenait 1 050 femelles reproductrices et 50 verrats, et était sélectionnée pendant 10 ans pour améliorer un objectif de sélection combinant 2 caractères d'héritabilité 0,4 et de mêmes poids économiques. Le schéma reposait sur le phénotypage annuel de 13 770 candidats pour le caractère 1 (Car1) et de 270 collatéraux par an issus de 10% des portées pour le caractère 2 (Car2). La sélection s'appuyait sur des valeurs génétiques estimées selon la méthodologie du BLUPMA ou sur des valeurs génomiques estimées à l'aide de 2 populations de référence, l'une constituée de candidats dont la taille variait entre 13 770 et 55 080 individus pour Car1, et l'autre constituée de collatéraux dont la taille variait entre 1 000 et 3 430 individus pour Car2. Les résultats montrent que des évaluations génomiques permettraient d'améliorer la précision d'estimation des valeurs génétiques des candidats et le progrès génétique réalisé annuellement pour les 2 caractères, tout en réduisant l'augmentation de la consanguinité dans la population, mais au prix d'un surcoût lié aux génotypages. Une augmentation, même très forte, dans le schéma BLUPMA du nombre de collatéraux contrôlés annuellement ne permettrait pas d'égaler l'efficacité du schéma génomique. A l'inverse, il serait possible de réduire notablement le surcoût du schéma génomique tout en préservant son efficacité en présélectionnant les portées dans lesquelles des candidats seraient génotypés.
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G2_Tribout-et-al_JRP2013_BAT.pdf (233.07 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-00939818 , version 1 (30-01-2014)
hal-00939818 , version 2 (11-03-2015)

Identifiants

  • HAL Id : hal-00939818 , version 1

Citer

Thierry Tribout, Catherine Larzul, Jean Pierre Bidanel, Florence Phocas. Etude, par simulations, de l'intérêt d'une sélection génomique dans une population porcine de type mâle. 45. Journées Recherche Porcine, Feb 2013, Paris, France. pp.1-6. ⟨hal-00939818v1⟩
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