Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNs - Archive ouverte HAL
Communication Dans Un Congrès Année : 2013

Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNs

Résumé

Nous présentons dans cet article une méthode de classification non supervisée de sommets d'un graphe qui est utilisée dans un contexte biologique particulier. La problématique est de détecter de manière non supervisée des micro-ARNs probables. Pour ce faire, nous utilisons une approche multi-noyaux permettant d'intégrer des informations sur le graphe de co-expression et des informations supplémentaires sur les sommets de ce graphe. Cette approche est rendue robuste par une technique de bagging de classifications. Les résultats obtenus donnent des groupes de miRNAs potentiels dont certains permettent de discriminer avec une bonne confiance les vrais miRNAs des faux positifs.
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Dates et versions

hal-00877561 , version 1 (28-10-2013)

Identifiants

  • HAL Id : hal-00877561 , version 1
  • PRODINRA : 315046

Citer

Florian Brunet, Jérôme J. Mariette, Christine Cierco-Ayrolles, Christine Gaspin, Philippe Bardou, et al.. Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNs. MARAMI (Modèles et l'Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatiques) 2013, Oct 2013, Saint-Étienne, France. pp.SI-1. ⟨hal-00877561⟩
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