Combining various strategies to increase the coverage of the plant cell wall glycoproteome. - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Phytochemistry Année : 2011

Combining various strategies to increase the coverage of the plant cell wall glycoproteome.

Résumé

Glycoproteomics recently became a very active field, mostly in mammals. The first part of this paper consists of a mini-review on the strategies used in glycoproteomics, namely methods for enrichment in glycoproteins and mass spectrometry (MS) techniques currently used. In a second part, these strategies are applied to the cell wall glycoproteome of etiolated hypocotyls of Arabidopsis thaliana, showing their complementarity. Several sub-glycoproteomes were obtained by: (i) affinity chromatography on concanavaline A (ConA) and analysis of glycoproteins by MALDI-TOF MS; (ii) multidimensional lectin chromatography (using AIL, PNA, ConA and WGA lectins) and subsequent identification of glycoproteins by MALDI-TOF MS and LC-MS/MS; (iii) boronic acid chromatography followed by identification of glycoproteins by MALDI-TOF MS. Altogether, 127 glycoproteins were identified. Most glycoproteins were found to be putative N-glycoproteins and N-glycopeptides were predicted from MS data using the ProTerNyc bioinformatics software.

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Soumis le : vendredi 22 juillet 2011-15:29:59

Dernière modification le : lundi 20 novembre 2023-11:44:18

Archivage à long terme le : vendredi 4 novembre 2011-15:11:16

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Dates et versions

hal-00610579 , version 1 (22-07-2011)

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Citer

Yu Zhang, Aurélie Giboulot, Michel Zivy, Benoît Valot, Elisabeth Jamet, et al.. Combining various strategies to increase the coverage of the plant cell wall glycoproteome.. Phytochemistry, 2011, 72 (10), pp.1109-23. ⟨10.1016/j.phytochem.2010.10.019⟩. ⟨hal-00610579⟩

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