Cette communication vise à présenter les outils méthodologiques d'analyse/évaluation de la gouvernance territoriale élaborés dans le cadre du projet de recherche PSDR Gouv.Innov sur les innovations organisationnelles relatives à la gouvernance territoriale. Il s'agit d'étudier les transformations introduites par les politiques de développement durable au niveau des dispositifs de gouvernance territoriale visant à favoriser une gestion intégrée des espaces ruraux. Dans un contexte de recomposition de l'action publique où les procédures d'aménagement sont plutôt normées par des représentations urbaines, l'accent est mis sur la question des modalités de représentation des activités rurales, pour lesquelles nous faisons l'hypothèse qu'elles sont sous représentées. Les premiers résultats méthodologiques permettent, dans une première partie, de proposer une définition générique et pragmatique de la gouvernance territoriale et de préciser la notion de dispositifs de gouvernance comme objet d'observation. A partir de cette définition une grille d'analyse permettant d'appréhender l'ensemble des dimensions en jeu dans les processus de gouvernance territoriale est élaborée. Dans la deuxième partie nous explorons l'intérêt de la notion de dispositif pour observer les processus de gouvernance et proposons une grille de collecte et de structuration des informations pour constituer des chroniques des dispositifs étudiés. / This paper seeks to present the methodological tools used in the analysis/evaluation of territorial governance developed during research undertaken within the framework of the PSDR Gouv-Innov project on organisational innovations with respect to territorial governance. It involves the study of the changes resulting from the emergence of sustainable development policies in territorial governance systems aiming to implement the integrated management of rural areas. In a context of changes in the way in which public action is implemented (for instance, public-private partnerships), where development procedures are usually standardised by urban representations, the emphasis is placed on the issue of the representation of rural activities, the hypothesis being that they are under-represented. The initial methodological results lead, in the first instance, to a proposition for a generic and pragmatic definition of territorial governance and a clarification of the notion of governance systems as objects of observation. This definition can be used as the basis of a framework to address all the analytical dimensions of the territorial governance process. In the second part, the authors explore the idea of system in order to observe governance processes and suggest a matrix for the collection and structuring of information in order to report on the studied systems.