Structure, function, and evolution of the Thiomonas spp. genome.
Florence Arsène-Ploetze
(1)
,
Sandrine Koechler
(1)
,
Marie Marchal
(1)
,
Jean-Yves Coppée
(2)
,
Michael Chandler
(3)
,
Violaine Bonnefoy
(4)
,
Céline Brochier-Armanet
(4)
,
mohamed Barakat
(5)
,
Valérie Barbe
(6)
,
Fabienne Battaglia-Brunet
(7)
,
Odile Bruneel
(8)
,
Christopher G. Bryan
(1)
,
Jessica Cleiss-Arnold
(1)
,
Stéphane Cruveiller
(6)
,
Mathieu Erhardt
(9)
,
Audrey Heinrich-Salmeron
(1)
,
Florence Hommais
(10)
,
Catherine Joulian
(7)
,
Evelyne Krin
(11)
,
Aurélie Lieutaud
(4)
,
D. Lièvremont
(12)
,
Caroline Michel
(7)
,
Daniel Muller
(1, 13)
,
Philippe Ortet
(5)
,
Caroline Proux
(2)
,
P. Siguier
(3)
,
David Roche
(14)
,
Zoé Rouy
(14)
,
Grégory Salvignol
(14)
,
Djamila Slyemi
(4)
,
Emmanuel Talla
(4)
,
Stéphanie Weiss
(1)
,
Jean Weissenbach
(14)
,
Claudine Médigue
(14, 15)
,
Philippe N. Bertin
(1)
1
GMGM -
Génétique moléculaire, génomique, microbiologie
2 PF2 - Puces à ADN (Plate-Forme 2)
3 LMGM - Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires - UMR5100
4 LCB - Laboratoire de chimie bactérienne
5 BIAM - Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB)
6 IG - Institut de Génomique d'Evry
7 BRGM - Bureau de Recherches Géologiques et Minières
8 HSM - Hydrosciences Montpellier
9 IBMP - Institut de Biologie Moléculaire des Plantes
10 MAP - Microbiologie, adaptation et pathogénie
11 Génétique des Génomes Bactériens
12 DEEGM - Dynamique, évolution et expression de génomes de microorganismes
13 LEM - Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
14 UMR 8030 - Génomique métabolique
15 SEG - Structure et évolution des génomes - UMR 8030
2 PF2 - Puces à ADN (Plate-Forme 2)
3 LMGM - Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires - UMR5100
4 LCB - Laboratoire de chimie bactérienne
5 BIAM - Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB)
6 IG - Institut de Génomique d'Evry
7 BRGM - Bureau de Recherches Géologiques et Minières
8 HSM - Hydrosciences Montpellier
9 IBMP - Institut de Biologie Moléculaire des Plantes
10 MAP - Microbiologie, adaptation et pathogénie
11 Génétique des Génomes Bactériens
12 DEEGM - Dynamique, évolution et expression de génomes de microorganismes
13 LEM - Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
14 UMR 8030 - Génomique métabolique
15 SEG - Structure et évolution des génomes - UMR 8030
Florence Arsène-Ploetze
- Fonction : Auteur
- PersonId : 920738
- IdHAL : florence-arsene-ploetze
Jean-Yves Coppée
- Fonction : Auteur
- PersonId : 746349
- IdHAL : jean-yves-coppee
Michael Chandler
- Fonction : Auteur
- PersonId : 934064
- ORCID : 0000-0002-0292-6662
Céline Brochier-Armanet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178614
- IdHAL : celine-brochier-armanet
- ORCID : 0000-0003-4669-3589
- IdRef : 142968455
mohamed Barakat
- Fonction : Auteur
- PersonId : 750631
- IdHAL : mohamed-barakat
Valérie Barbe
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1187196
- IdHAL : valerie-barbe
- ORCID : 0000-0002-8162-3343
Fabienne Battaglia-Brunet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 911154
- IdHAL : fabienne-battaglia-brunet
- ORCID : 0000-0002-4005-6290
- IdRef : 196385601
Odile Bruneel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 21167
- IdHAL : odile-bruneel
- ORCID : 0000-0001-8012-0245
- IdRef : 08405672X
Christopher G. Bryan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 183539
- IdHAL : cgbryan
- ORCID : 0000-0002-8272-8155
- IdRef : 253121663
Florence Hommais
- Fonction : Auteur
- PersonId : 18734
- IdHAL : florence-hommais
- ORCID : 0000-0003-2151-3545
- IdRef : 08905850X
Catherine Joulian
- Fonction : Auteur
- PersonId : 184154
- IdHAL : catherine-joulian
- ORCID : 0000-0003-3834-2551
- IdRef : 167734458
Caroline Michel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763046
- ORCID : 0000-0002-0515-4637
Daniel Muller
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178133
- IdHAL : daniel-muller
- ORCID : 0000-0002-6619-4691
- IdRef : 090311310
Philippe Ortet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1083106
- IdHAL : philippe-ortet
- ORCID : 0000-0002-2648-8978
- IdRef : 234406569
P. Siguier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1263979
- IdHAL : patricia-siguier
- ORCID : 0000-0003-1620-6495
- IdRef : 278868541
David Roche
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1352246
- IdHAL : david-roche-78
- ORCID : 0000-0003-2366-0311
Claudine Médigue
- Fonction : Auteur
- PersonId : 909664
- IdHAL : claudine-medigue
- ORCID : 0000-0002-3905-1054
- IdRef : 08942719X
Philippe N. Bertin
Connectez-vous pour contacter l'auteur
- Fonction : Auteur correspondant
- PersonId : 17396
- IdHAL : philippe-bertin
Connectez-vous pour contacter l'auteur
Résumé
Bacteria of the Thiomonas genus are ubiquitous in extreme environments, such as arsenic-rich acid mine drainage (AMD). The genome of one of these strains, Thiomonas sp. 3As, was sequenced, annotated, and examined, revealing specific adaptations allowing this bacterium to survive and grow in its highly toxic environment. In order to explore genomic diversity as well as genetic evolution in Thiomonas spp., a comparative genomic hybridization (CGH) approach was used on eight different strains of the Thiomonas genus, including five strains of the same species. Our results suggest that the Thiomonas genome has evolved through the gain or loss of genomic islands and that this evolution is influenced by the specific environmental conditions in which the strains live.
Domaines
Biologie cellulaire| Origine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
|---|
Loading...