This paper deals with the automatic detection of low-frequency Antarctic (Balaenptera musculus intermedia) and Pygmy (B. m. brevicauda) blue whale sounds produced in the Southwestern Indian Ocean. A new detection method based on a matched fi lter is introduced. Four original match templates are presented and tested against original blue whale subspecies calls. The mathematical formulas of these templates, defi ned by Gaussian curve models, are provided. The detection threshold is based on the correlation coeffi cients. The threshold was set to reduce false detections obtained on simulated signals at various signal-to-noise ratios. We focus our work on the true detections of whale calls. Moreover, to obtain a real-time system, we decrease the computational time by decimating the recorded signal (Fs=250Hz). We show that this new method enables us to effectively detect both subspecies in various ambient noises, in the Southern Ocean. *** Dans ce papier, les sons de basses fréquences émis par les baleines bleues Antarctique (Balaenoptera musculus intermedia) et pygmées (B. m. brevicauda) dans le secteur sud – ouest de l'Océan Indien ont été détecté automatiquement à partir d'une technique de fi ltrage adapté. Pour ce faire, des signaux synthétiques ont été créés à partir de signaux originaux en modélisant leurs équations mathématiques à partir de courbes gaussiennes. La détection se fait alors par la corrélation entre le signal entrant et le modèle calculé (template). Le seuil de détection a été choisi au préalable en simulant une série de signaux dans des rapports signal sur bruit différents. Au fi nal, un seuil de détection élevé a été choisi pour minimiser les fausses alarmes au risque d'augmenter les détections manquées. Pour diminuer le temps de calcul, le signal original (Fe=250Hz) a été décimé. Cette méthode originale c'est révélée très effi cace pour détecter les sons émis par ces deux sous espèces de baleines bleues dans des niveaux de bruit ambiant très variés comme c'est le cas dans cette partie de l'Océan Indien.