Population genomics of post-glacial western Eurasia - Laboratoire méditerranéen de préhistoire Europe-Afrique Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Année : 2024

Population genomics of post-glacial western Eurasia

Morten Allentoft (1, 2) , Martin Sikora (1) , Alba Refoyo-Martínez , Evan Irving-Pease , Anders Fischer , William Barrie , Andrés Ingason (3) , Jesper Stenderup , Karl-Göran Sjögren , Alice Pearson , Bárbara Sousa da Mota , Bettina Schulz Paulsson (4) , Alma Halgren , Ruairidh Macleod , Marie Louise Schjellerup Jørkov , Fabrice Demeter (5) , Lasse Sørensen , Poul Otto Nielsen , Rasmus Henriksen , Tharsika Vimala (6) , Hugh Mccoll , Ashot Margaryan , Melissa Ilardo , Andrew Vaughn , Morten Fischer Mortensen , Anne Birgitte Nielsen , Mikkel Ulfeldt Hede , Niels Nørkjær Johannsen , Peter Rasmussen , Lasse Vinner , Gabriel Renaud , Aaron Stern , Theis Zetner Trolle Jensen , Gabriele Scorrano , Hannes Schroeder , Per Lysdahl , Abigail Daisy Ramsøe , Andrei Skorobogatov , Andrew Joseph Schork , Anders Rosengren , Anthony Ruter , Alan Outram , Aleksey Timoshenko , Alexandra Buzhilova , Alfredo Coppa , Alisa Zubova , Ana Maria Silva , Anders Hansen , Andrey Gromov , Andrey Logvin , Anne Birgitte Gotfredsen , Bjarne Henning Nielsen , Borja González-Rabanal , Carles Lalueza-Fox , Catriona Mckenzie , Charleen Gaunitz , Concepción Blasco , Corina Liesau , Cristina Martinez-Labarga , Dmitri Pozdnyakov , David Cuenca-Solana (7) , David Lordkipanidze , Dmitri En'Shin , Domingo Salazar-García , T Douglas Price , Dušan Borić , Elena Kostyleva , Elizaveta Veselovskaya , Emma Usmanova , Enrico Cappellini , Erik Brinch Petersen , Esben Kannegaard , Francesca Radina , Fulya Eylem Yediay , Henri Duday (8) , Igor Gutiérrez-Zugasti , Ilya Merts , Inna Potekhina , Irina Shevnina , Isin Altinkaya , Jean Guilaine (9) , Jesper Hansen , Joan Emili Aura Tortosa , João Zilhão , Jorge Vega , Kristoffer Buck Pedersen , Krzysztof Tunia , Lei Zhao , Liudmila Mylnikova , Lars Larsson , Laure Metz (10) , Levon Yepiskoposyan , Lisbeth Pedersen , Lucia Sarti , Ludovic Orlando (11) , Ludovic Slimak (11) , Lutz Klassen , Malou Blank , Manuel González-Morales , Mara Silvestrini , Maria Vretemark , Marina Nesterova , Marina Rykun , Mario Federico Rolfo , Marzena Szmyt , Marcin Przybyła , Mauro Calattini , Mikhail Sablin , Miluše Dobisíková , Morten Meldgaard , Morten Johansen , Natalia Berezina , Nick Card , Nikolai Saveliev , Olga Poshekhonova , Olga Rickards , Olga Lozovskaya , Olivér Gábor , Otto Christian Uldum , Paola Aurino , Pavel Kosintsev , Patrice Courtaud , Patricia Ríos , Peder Mortensen , Per Lotz , Per Persson , Pernille Bangsgaard , Peter de Barros Damgaard , Peter Vang Petersen , Pilar Prieto Martinez , Piotr Włodarczak , Roman Smolyaninov , Rikke Maring , Roberto Menduiña , Ruben Badalyan , Rune Iversen , Ruslan Turin , Sergey Vasilyev , Sidsel Wåhlin , Svetlana Borutskaya , Svetlana Skochina , Søren Anker Sørensen , Søren Andersen , Thomas Jørgensen , Yuri Serikov , Vyacheslav Molodin , Vaclav Smrcka , Victor Merts , Vivek Appadurai , Vyacheslav Moiseyev , Yvonne Magnusson , Kurt Kjær , Niels Lynnerup , Daniel Lawson , Peter Sudmant , Simon Rasmussen , Thorfinn Sand Korneliussen , Richard Durbin , Rasmus Nielsen , Olivier Delaneau , Thomas Werge , Fernando Racimo , Kristian Kristiansen , Eske Willerslev (12, 1)
Alba Refoyo-Martínez
  • Fonction : Auteur
Evan Irving-Pease
Anders Fischer
William Barrie
  • Fonction : Auteur
Jesper Stenderup
  • Fonction : Auteur
Karl-Göran Sjögren
Alice Pearson
  • Fonction : Auteur
Bárbara Sousa da Mota
  • Fonction : Auteur
Alma Halgren
Ruairidh Macleod
  • Fonction : Auteur
Marie Louise Schjellerup Jørkov
Fabrice Demeter
Lasse Sørensen
  • Fonction : Auteur
Poul Otto Nielsen
  • Fonction : Auteur
Rasmus Henriksen
Hugh Mccoll
Ashot Margaryan
Melissa Ilardo
  • Fonction : Auteur
Andrew Vaughn
  • Fonction : Auteur
Morten Fischer Mortensen
Anne Birgitte Nielsen
Mikkel Ulfeldt Hede
  • Fonction : Auteur
Niels Nørkjær Johannsen
  • Fonction : Auteur
Peter Rasmussen
  • Fonction : Auteur
Lasse Vinner
  • Fonction : Auteur
Gabriel Renaud
Aaron Stern
  • Fonction : Auteur
Theis Zetner Trolle Jensen
  • Fonction : Auteur
Gabriele Scorrano
Hannes Schroeder
Per Lysdahl
  • Fonction : Auteur
Abigail Daisy Ramsøe
  • Fonction : Auteur
Andrei Skorobogatov
Andrew Joseph Schork
  • Fonction : Auteur
Anders Rosengren
Anthony Ruter
  • Fonction : Auteur
Alan Outram
Aleksey Timoshenko
Alexandra Buzhilova
Alfredo Coppa
Alisa Zubova
  • Fonction : Auteur
Ana Maria Silva
Anders Hansen
Andrey Gromov
  • Fonction : Auteur
Andrey Logvin
  • Fonction : Auteur
Anne Birgitte Gotfredsen
Bjarne Henning Nielsen
  • Fonction : Auteur
Borja González-Rabanal
Carles Lalueza-Fox
Catriona Mckenzie
Charleen Gaunitz
  • Fonction : Auteur
Concepción Blasco
  • Fonction : Auteur
Corina Liesau
  • Fonction : Auteur
Cristina Martinez-Labarga
Dmitri Pozdnyakov
  • Fonction : Auteur
David Lordkipanidze
  • Fonction : Auteur
Dmitri En'Shin
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Domingo Salazar-García
  • Fonction : Auteur
T Douglas Price
  • Fonction : Auteur
Dušan Borić
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Elena Kostyleva
  • Fonction : Auteur
Elizaveta Veselovskaya
Emma Usmanova
  • Fonction : Auteur
Enrico Cappellini
Erik Brinch Petersen
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Esben Kannegaard
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Francesca Radina
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Fulya Eylem Yediay
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Igor Gutiérrez-Zugasti
  • Fonction : Auteur
Ilya Merts
Inna Potekhina
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Irina Shevnina
  • Fonction : Auteur
Isin Altinkaya
Jean Guilaine
  • Fonction : Auteur
Jesper Hansen
  • Fonction : Auteur
Joan Emili Aura Tortosa
  • Fonction : Auteur
João Zilhão
Jorge Vega
  • Fonction : Auteur
Kristoffer Buck Pedersen
Krzysztof Tunia
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Lei Zhao
Liudmila Mylnikova
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Lars Larsson
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Levon Yepiskoposyan
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Lisbeth Pedersen
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Lucia Sarti
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Lutz Klassen
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Malou Blank
Manuel González-Morales
Mara Silvestrini
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Maria Vretemark
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Marina Nesterova
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Marina Rykun
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Mario Federico Rolfo
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Marzena Szmyt
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Marcin Przybyła
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Mauro Calattini
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Mikhail Sablin
Miluše Dobisíková
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Morten Meldgaard
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Morten Johansen
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Natalia Berezina
Nick Card
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Nikolai Saveliev
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Olga Poshekhonova
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Olga Rickards
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Olga Lozovskaya
Olivér Gábor
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Otto Christian Uldum
  • Fonction : Auteur
Paola Aurino
  • Fonction : Auteur
Pavel Kosintsev
  • Fonction : Auteur
Patrice Courtaud
  • Fonction : Auteur
Patricia Ríos
  • Fonction : Auteur
Peder Mortensen
  • Fonction : Auteur
Per Lotz
  • Fonction : Auteur
Per Persson
Pernille Bangsgaard
Peter de Barros Damgaard
  • Fonction : Auteur
Peter Vang Petersen
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Pilar Prieto Martinez
Piotr Włodarczak
Roman Smolyaninov
  • Fonction : Auteur
Rikke Maring
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Roberto Menduiña
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Ruben Badalyan
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Rune Iversen
Ruslan Turin
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Sergey Vasilyev
Sidsel Wåhlin
Svetlana Borutskaya
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Svetlana Skochina
Søren Anker Sørensen
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Søren Andersen
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Thomas Jørgensen
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Yuri Serikov
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Vyacheslav Molodin
Vaclav Smrcka
  • Fonction : Auteur
Victor Merts
  • Fonction : Auteur
Vivek Appadurai
Vyacheslav Moiseyev
  • Fonction : Auteur
Yvonne Magnusson
Kurt Kjær
Niels Lynnerup
  • Fonction : Auteur
Daniel Lawson
Peter Sudmant
Simon Rasmussen
Thorfinn Sand Korneliussen
Richard Durbin
Rasmus Nielsen
Olivier Delaneau
Thomas Werge
Fernando Racimo
Kristian Kristiansen
  • Fonction : Auteur

Résumé

Western Eurasia witnessed several large-scale human migrations during the Holocene. Here, to investigate the cross-continental effects of these migrations, we shotgun-sequenced 317 genomes-mainly from the Mesolithic and Neolithic periods-from across northern and western Eurasia. These were imputed alongside published data to obtain diploid genotypes from more than 1,600 ancient humans. Our analyses revealed a 'great divide' genomic boundary extending from the Black Sea to the Baltic. Mesolithic hunter-gatherers were highly genetically differentiated east and west of this zone, and the effect of the neolithization was equally disparate. Large-scale ancestry shifts occurred in the west as farming was introduced, including near-total replacement of hunter-gatherers in many areas, whereas no substantial ancestry shifts happened east of the zone during the same period. Similarly, relatedness decreased in the west from the Neolithic transition onwards, whereas, east of the Urals, relatedness remained high until around 4,000 BP, consistent with the persistence of localized groups of hunter-gatherers. The boundary dissolved when Yamnaya-related ancestry spread across western Eurasia around 5,000 BP, resulting in a second major turnover that reached most parts of Europe within a 1,000-year span. The genetic origin and fate of the Yamnaya have remained elusive, but we show that hunter-gatherers from the Middle Don region contributed ancestry to them. Yamnaya groups later admixed with individuals associated with the Globular Amphora culture before expanding into Europe. Similar turnovers occurred in western Siberia, where we report new genomic data from a 'Neolithic steppe' cline spanning the Siberian forest steppe to Lake Baikal. These prehistoric migrations had profound and lasting effects on the genetic diversity of Eurasian populations.
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hal-04443827 , version 1 (23-05-2024)

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Citer

Morten Allentoft, Martin Sikora, Alba Refoyo-Martínez, Evan Irving-Pease, Anders Fischer, et al.. Population genomics of post-glacial western Eurasia. Nature, 2024, 625 (7994), pp.301-311. ⟨10.1038/s41586-023-06865-0⟩. ⟨hal-04443827⟩
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