Étudier, modéliser, moduler le vivant : apport de la bioinformatique structurale - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Hdr Année : 2023

Studying, modeling and modulating life : impact of structural bioinformatics

Étudier, modéliser, moduler le vivant : apport de la bioinformatique structurale

Résumé

The development of life has been a long process, punctuated by long evolutions and rapid transitions, sometimes shaped by major climatic changes. This history has led to the current complexity of Life, which we are beginning to understand better and better. So, after centuries of meticulous study of living things by naturalists, the scientific and technological advances of the last two centuries have enabled a paradigm shift in our understanding of living things at the molecular level. In this document, I present a brief overview of my research work, based mainly on in silico approaches, mainly molecular modeling. This work has only been possible thanks to the work of the many students I had the pleasure of supervising. I tried to show them that it was necessary firstly to model the structure of isolated proteins or complexes, and secondly to seek out and optimize small chemical ligands capable of specifically blocking a protein state. Together with these students, I have also set up a number of online services in the form of databases and web servers, providing access to data that would otherwise be difficult to gather. I conclude this dissertation with a presentation of the next steps in my research.
Le développement de la vie a été un processus long, parsemé de longues évolutions et de transitions rapides, parfois façonnés par des changements climatiques majeurs. Cette histoire a mené à la complexité actuelle du vivant que nous commençons à comprendre de mieux en mieux. Ainsi, après des siècles d’étude minutieuse du vivant par les naturalistes, les avancées scientifiques et technologiques des deux derniers siècles ont permis un changement de paradigme dans notre compréhension du vivant à l’échelle moléculaire. Je présente dans ce document une présentation rapide de mes travaux de recherche principalement basés sur des approches in silico de modélisation moléculaire. Ces travaux n’ont pu exister que par le travail de nombreux étudiants que j’ai eu le plaisir d’encadrer. J’ai cherché à leur montrer qu’il fallait dans un premier temps modéliser la structure de protéines isolées ou en complexe, puis dans un deuxième temps de rechercher et d’optimiser des petits ligands chimiques capables de bloquer spécifiquement un état d’une protéine. J’ai aussi mis en ligne avec ces étudiants, sous la forme de bases de données et de serveurs web, plusieurs services qui permettent d’accéder à des informations autrement difficiles à rassembler. Je conclus ce mémoire par une présentation de la suite envisagée pour mes recherches.
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Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

tel-04381065 , version 1 (08-01-2024)

Licence

Identifiants

  • HAL Id : tel-04381065 , version 1

Citer

Stéphane Teletchea. Étudier, modéliser, moduler le vivant : apport de la bioinformatique structurale. Sciences du Vivant [q-bio]. Nantes Université, 2023. ⟨tel-04381065⟩

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