<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<TEI xmlns="http://www.tei-c.org/ns/1.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:hal="http://hal.archives-ouvertes.fr/" xmlns:gml="http://www.opengis.net/gml/3.3/" xmlns:gmlce="http://www.opengis.net/gml/3.3/ce" version="1.1" xsi:schemaLocation="http://www.tei-c.org/ns/1.0 http://api.archives-ouvertes.fr/documents/aofr-sword.xsd">
  <teiHeader>
    <fileDesc>
      <titleStmt>
        <title>HAL TEI export of tel-04313966</title>
      </titleStmt>
      <publicationStmt>
        <distributor>CCSD</distributor>
        <availability status="restricted">
          <licence target="https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/">CC0 1.0 - Universal</licence>
        </availability>
        <date when="2026-05-25T22:57:42+02:00"/>
      </publicationStmt>
      <sourceDesc>
        <p part="N">HAL API Platform</p>
      </sourceDesc>
    </fileDesc>
  </teiHeader>
  <text>
    <body>
      <listBibl>
        <biblFull>
          <titleStmt>
            <title xml:lang="en">An integrated view of the action of antimicrobials targeting the cell wall in Bacillus subtilis</title>
            <title xml:lang="fr">Etude de l'action des antimicrobiens ciblant la paroi cellulaire chez Bacillus subtilis</title>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Charlène</forename>
                <surname>Cornilleau</surname>
              </persName>
              <email type="md5">814360febc1c1ddcb95b68a1200bbfad</email>
              <email type="domain">aol.com</email>
              <idno type="idhal" notation="string">charlene-cornilleau</idno>
              <idno type="idhal" notation="numeric">1318023</idno>
              <idno type="halauthorid" notation="string">685833-1318023</idno>
              <idno type="ORCID">https://orcid.org/0009-0005-6591-8706</idno>
              <affiliation ref="#struct-1002254"/>
            </author>
            <editor role="depositor">
              <persName>
                <forename>ABES</forename>
                <surname>STAR</surname>
              </persName>
              <email type="md5">f5aa7f563b02bb6adbba7496989af39a</email>
              <email type="domain">abes.fr</email>
            </editor>
            <funder ref="#projeurop-722226"/>
            <funder>This project has received funding from the European Research Council (ERC) under the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme (ERC Consolidator grant (CoG) BActin 772178 to R.C.L.)</funder>
          </titleStmt>
          <editionStmt>
            <edition n="v1" type="current">
              <date type="whenSubmitted">2025-03-23 01:01:22</date>
              <date type="whenModified">2026-04-07 17:16:09</date>
              <date type="whenReleased">2025-03-23 01:01:23</date>
              <date type="whenProduced">2023-03-22</date>
              <date type="whenEndEmbargoed">2025-03-23</date>
              <ref type="file" target="https://hal.science/tel-04313966v1/document">
                <date notBefore="2025-03-23"/>
              </ref>
              <ref type="file" subtype="author" n="1" target="https://hal.science/tel-04313966v1/file/108450_CORNILLEAU_2023_archivage.pdf" id="file-5002107-4334321">
                <date notBefore="2025-03-23"/>
              </ref>
            </edition>
            <respStmt>
              <resp>contributor</resp>
              <name key="131274">
                <persName>
                  <forename>ABES</forename>
                  <surname>STAR</surname>
                </persName>
                <email type="md5">f5aa7f563b02bb6adbba7496989af39a</email>
                <email type="domain">abes.fr</email>
              </name>
            </respStmt>
          </editionStmt>
          <publicationStmt>
            <distributor>CCSD</distributor>
            <idno type="halId">tel-04313966</idno>
            <idno type="halUri">https://hal.science/tel-04313966</idno>
            <idno type="halBibtex">cornilleau:tel-04313966</idno>
            <idno type="halRefHtml">Life Sciences [q-bio]. Université Paris-Saclay, 2023. English. &lt;a target="_blank" href="https://www.theses.fr/2023UPASL022"&gt;&amp;#x27E8;NNT : 2023UPASL022&amp;#x27E9;&lt;/a&gt;</idno>
            <idno type="halRef">Life Sciences [q-bio]. Université Paris-Saclay, 2023. English. &amp;#x27E8;NNT : 2023UPASL022&amp;#x27E9;</idno>
            <availability status="restricted">
              <licence target="https://about.hal.science/hal-authorisation-v1/">HAL Authorization<ref corresp="#file-5002107-4334321"/></licence>
            </availability>
          </publicationStmt>
          <seriesStmt>
            <idno type="stamp" n="AGROPARISTECH">AgroParisTech</idno>
            <idno type="stamp" n="STAR">STAR - Dépôt national des thèses électroniques</idno>
            <idno type="stamp" n="OPENAIRE">OpenAIRE</idno>
            <idno type="stamp" n="UNIV-PARIS-SACLAY">Université Paris-Saclay</idno>
            <idno type="stamp" n="AGREENIUM">Archive ouverte en agrobiosciences</idno>
            <idno type="stamp" n="INRAE">Institut National de Recherche en Agriculture, Alimentation et Environnement</idno>
            <idno type="stamp" n="UNIVERSITE-PARIS-SACLAY" corresp="UNIV-PARIS-SACLAY">Université Paris-Saclay</idno>
            <idno type="stamp" n="GS-LIFE-SCIENCES-HEALTH" corresp="UNIVERSITE-PARIS-SACLAY">Graduate School Life Sciences and Health</idno>
            <idno type="stamp" n="GS-HEALTH-DRUG-SCIENCES">Graduate School Health and Drug Sciences</idno>
            <idno type="stamp" n="MICA-UNITES">MICA-Unités </idno>
            <idno type="stamp" n="MICALIS">Micalis</idno>
            <idno type="stamp" n="RESEAU-EAU">Réseau "Systèmes Agricoles et Eau"</idno>
          </seriesStmt>
          <notesStmt/>
          <sourceDesc>
            <biblStruct>
              <analytic>
                <title xml:lang="en">An integrated view of the action of antimicrobials targeting the cell wall in Bacillus subtilis</title>
                <title xml:lang="fr">Etude de l'action des antimicrobiens ciblant la paroi cellulaire chez Bacillus subtilis</title>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Charlène</forename>
                    <surname>Cornilleau</surname>
                  </persName>
                  <email type="md5">814360febc1c1ddcb95b68a1200bbfad</email>
                  <email type="domain">aol.com</email>
                  <idno type="idhal" notation="string">charlene-cornilleau</idno>
                  <idno type="idhal" notation="numeric">1318023</idno>
                  <idno type="halauthorid" notation="string">685833-1318023</idno>
                  <idno type="ORCID">https://orcid.org/0009-0005-6591-8706</idno>
                  <affiliation ref="#struct-1002254"/>
                </author>
              </analytic>
              <monogr>
                <idno type="nnt">2023UPASL022</idno>
                <imprint>
                  <date type="dateDefended">2023-03-22</date>
                </imprint>
                <authority type="institution">Université Paris-Saclay</authority>
                <authority type="school">École doctorale Structure et dynamique des systèmes vivants (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 2015-....)</authority>
                <authority type="supervisor">Rut Carballido-López</authority>
                <authority type="jury">Paulo Tavares [Président]</authority>
                <authority type="jury">Mariana Gomes de Pinho [Rapporteur]</authority>
                <authority type="jury">Thomas Bernhardt [Rapporteur]</authority>
                <authority type="jury">Jean-Emmanuel Hugonnet</authority>
                <authority type="jury">Thierry Touzé</authority>
                <authority type="jury">Philippe Noirot</authority>
              </monogr>
            </biblStruct>
          </sourceDesc>
          <profileDesc>
            <langUsage>
              <language ident="en">English</language>
            </langUsage>
            <textClass>
              <keywords scheme="author">
                <term xml:lang="en">paradoxical growth</term>
                <term xml:lang="en">antibiotic</term>
                <term xml:lang="en">peptidoglycan</term>
                <term xml:lang="en">Cell wall</term>
                <term xml:lang="fr">Antibiotique</term>
                <term xml:lang="fr">Peptidoglycane</term>
                <term xml:lang="fr">Paroi bactérienne</term>
              </keywords>
              <classCode scheme="halDomain" n="sdv">Life Sciences [q-bio]</classCode>
              <classCode scheme="halTypology" n="THESE">Theses</classCode>
              <classCode scheme="halOldTypology" n="THESE">Theses</classCode>
              <classCode scheme="halTreeTypology" n="THESE">Theses</classCode>
            </textClass>
            <abstract xml:lang="en">
              <p>Most bacteria are encased into a rigid framework, the cell-wall (CW), conferring them shape and protection. The main constituent of the CW is the peptidoglycan (PG), a biopolymer specific to bacteria. Because it is essential for bacteria and not present in eukaryotic cells, PG and its synthesis pathway are targets of choice for antibiotics. The primary target of CW antibiotics, the enzyme they inhibit or the molecule they bind to, is generally well known. However, the resulting cascade of events leading the cells to lysis is still poorly caracterised. Understanding these mechanisms is crucial to fight antibiotic resistance, a world-wide threat and one of top priority of the WHO. This project aims at identifying the physiological consequences of CW antibiotic exposure, and the pathways leading to cell death. Two systematic analysis put into light the transcriptomic signature of CW antibiotic exposure and the chemical and structural modifications provoked. An in-depth study of PG synthesis machineries revealed that the different actors of PG synthesis are differentially affected by antibiotic treatment, pointing at differences in their regulation. Finally, a detailed analysis of Bacillus subtilis's response to moenomycin shed light on the mechanisms triggering resistance to this antibiotic and Eagle effect or paradoxical growth: a more-antibiotic-less-killing effect at high concentrations. This study helps us on one hand to understand better the essential process of CW synthesis, and on the other hand to identify new leads to tackle antibiotic resistance.</p>
            </abstract>
            <abstract xml:lang="fr">
              <p>La paroi bactérienne constitue une enveloppe protectrice essentielle à la survie des bactéries et représente leur première ligne de défense contre le milieu extérieur. Cette paroi est constituée majoritairement de peptidoglycane (PG), un biopolymère spécifique aux cellules bactériennes. Parce qu'il est nécessaire à la survie et spécifique aux bactéries, le PG ainsi que sa voie de synthèse sont des cibles privilégiées pour des antibiotiques. Bien que les cibles moléculaires des antibiotiques inhibant la synthèse de la paroi soient connues, les conséquences de leur action sur les cellules bactériennes et la cascade d'évènements menant à la lyse restent incomprises. Comprendre ces mécanismes est crucial pour lutter contre la résistance aux antibiotiques, résistance qui représente une menace de santé publique majeure, inscrite dans les priorités de l'OMS. Ce projet de thèse a pour objectif d'identifier les conséquences de l'exposition à des antibiotiques de paroi sur la physiologie bactérienne, et la manière dont cela conduit à terme à la mort cellulaire, sur la bactérie modèle Bacillus subtilis. Deux analyses systématiques ont permis de mettre en évidence d'une part la signature transcriptomique et d'autre part les modifications chimiques et structurales induites par l'exposition à des antibiotiques ciblant la paroi. Une étude plus approfondie des machineries de synthèse de la paroi a révélé que les différents acteurs de la synthèse ne répondaient pas de la même façon à des traitements antibiotiques, révélant des différences de régulation. Enfin, une analyse détaillée de la réponse de Bacillus subtilis à la moenomycine a mis en lumière des mécanismes à l'origine de la résistance à cet antibiotique et de l'effet Eagle ou croissance paradoxale (perte de la dose-dépendance de l'inhibition de croissance en présence de fortes concentrations d'antibiotique), décrit dans la littérature mais dont les mécanismes restent inconnus. Ces travaux permettent de mieux comprendre le processus essentiel qu'est la synthèse de la paroi bactérienne et d'identifier des nouvelles pistes permettant de limiter les phénomènes de résistance aux antibiotiques.</p>
            </abstract>
          </profileDesc>
        </biblFull>
      </listBibl>
    </body>
    <back>
      <listOrg type="structures">
        <org type="laboratory" xml:id="struct-1002254" status="VALID">
          <idno type="RNSR">201119643H</idno>
          <idno type="ROR">https://ror.org/0471cyx86</idno>
          <orgName>MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé</orgName>
          <orgName type="acronym">MICALIS</orgName>
          <date type="start">2020-01-01</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>Domaine de Vilvert 78352 JOUY-EN-JOSAS CEDEX</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">https://www.micalis.fr/</ref>
          </desc>
          <listRelation>
            <relation active="#struct-148117" type="direct"/>
            <relation active="#struct-419361" type="direct"/>
            <relation name="UMR1319" active="#struct-577435" type="direct"/>
          </listRelation>
        </org>
        <org type="institution" xml:id="struct-148117" status="VALID">
          <idno type="IdRef">139408088</idno>
          <idno type="ROR">https://ror.org/02kbmgc12</idno>
          <orgName>AgroParisTech</orgName>
          <date type="start">2007-01-01</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>22 place de l'Agronomie CS 20040 91123 Palaiseau cedex</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">https://www.agroparistech.fr/</ref>
          </desc>
        </org>
        <org type="institution" xml:id="struct-419361" status="VALID">
          <idno type="IdRef">241345251</idno>
          <idno type="ROR">https://ror.org/03xjwb503</idno>
          <orgName>Université Paris-Saclay</orgName>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>Bâtiment Bréguet, 3 Rue Joliot Curie 2e ét, 91190 Gif-sur-Yvette</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">https://www.universite-paris-saclay.fr/fr</ref>
          </desc>
        </org>
        <org type="institution" xml:id="struct-577435" status="VALID">
          <idno type="ROR">https://ror.org/003vg9w96</idno>
          <orgName>Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement</orgName>
          <orgName type="acronym">INRAE</orgName>
          <date type="start">2020-01-01</date>
          <desc>
            <address>
              <country key="FR"/>
            </address>
          </desc>
        </org>
      </listOrg>
      <listOrg type="projects">
        <org type="europeanProject" xml:id="projeurop-722226" status="VALID">
          <idno type="number">772178</idno>
          <idno type="program">ERC-2017-COG</idno>
          <idno type="call">ERC-2017-COG</idno>
          <orgName>BACTIN</orgName>
          <desc>Shaping the bacterial cell wall: the actin-like cytoskeleton, from single molecules to morphogenesis and antimicrobials</desc>
          <date type="start">2019-02-01</date>
          <date type="end">2026-01-31</date>
        </org>
      </listOrg>
    </back>
  </text>
</TEI>