Partant d’une analyse critique de l’évolution de l’ingénierie territoriale, qui, au cours des vingt dernières années s’est progressivement pliée au gouvernement à distance et aux préceptes du new public management dans le pilotage des dispositifs d’aménagement et de développement territorial, ce travail d’HDR propose la notion d’ingénierie de capacitation territoriale. L’enjeu, dans un contexte de changements environnementaux globaux et d’injonction à la transition écologique est de de faire du territoire un espace de capacitation favorisant l’agencéité individuelle et collective de ses habitants et de ses représentants pour définir des trajectoires de développement alternatives sous contrainte écologique forte. La construction d’une capacité collective à définir des buts et à agir de manière cohérente pour les atteindre passe par la production d’une intelligence collective au sein de communautés épistémiques transdisciplinaires. Celles-ci organisent la rencontre entre chercheurs et acteurs territoriaux afin de produire collectivement une connaissance et une façon de penser partagée et opérationnelle. Elles redéfinissent la posture des chercheurs, nécessitent la co-création de nouvelles méthodes d’enquête avec une pluralité d’acteurs pour interpeller les décideurs au sein d’un opérateur territorial de transition. Celui propose des innovations institutionnelles, susceptibles d’irriguer le territoire en idées, intuitions, découvertes collectives au service de trajectoires de développement alternatives.