Cet article insiste sur les logiques de coordination du système politique et administratif de l'UE à travers l'analyse du rôle d'une organisation méconnue : le Secrétariat général du Conseil. Gardienne des procédures communautaires, cette administration d'état-major s'est affirmée au centre des configurations institutionnelles européennes et des interactions bruxelloises entre fonctionnaires, ambassadeurs et ministres des Quinze. Elle est devenue un acteur central des politiques de Justice et d'affaires intérieures et l'entrepreneur de la PESC. C'est l'autonomisation d'un nouveau pôle d'expertise, distinct de celui de la Commission, qui est analysée. L'identification du Secrétariat général au Conseil, dont la direction change tous les six mois, donne à voir une nouvelle articulation entre administration et politique.