Article Dans Une Revue Global Ecology and Biogeography Année : 2018

BioTIME: A database of biodiversity time series for the Anthropocene

Maria Dornelas , Laura Antão , Faye Moyes , Amanda Bates , Anne Magurran , Dušan Adam , Asem Akhmetzhanova , Ward Appeltans , José Manuel Arcos , Haley Arnold , Narayanan Ayyappan (1) , Gal Badihi , Andrew Baird , Miguel Barbosa , Tiago Egydio Barreto , Claus Bässler , Alecia Bellgrove , Jonathan Belmaker , Lisandro Benedetti-Cecchi , Brian Bett , Anne Bjorkman , Magdalena Błażewicz , Shane Blowes , Christopher Bloch , Timothy Bonebrake , Susan Boyd , Matt Bradford , Andrew Brooks , James Brown , Helge Bruelheide , Phaedra Budy , Fernando Carvalho , Edward Castañeda-Moya , Chaolun Allen Chen , John Chamblee , Tory Chase , Laura Siegwart Collier , Sharon Collinge , Richard Condit , Elisabeth Cooper , J. Hans C. Cornelissen , Unai Cotano , Shannan Kyle Crow , Gabriella Damasceno , Claire Davies , Robert Davis , Frank Day , Steven Degraer , Tim Doherty , Timothy Dunn , Giselda Durigan , J. Emmett Duffy , Dor Edelist , Graham Edgar , Robin Elahi , Sarah Elmendorf , Anders Enemar , S. Ernest , Rubén Escribano , Marc Estiarte , Brian Evans , Tung‐yung Fan , Fabiano Turini Farah , Luiz Loureiro Fernandes , Fábio Farneda , Alessandra Fidelis , Robert Fitt , Anna Maria Fosaa , Geraldo Antonio Daher Correa Franco , Grace Frank , William Fraser , Hernando García , Roberto Cazzolla Gatti , Or Givan , Elizabeth Gorgone-Barbosa , William Gould , Corinna Gries , Gary Grossman , Julio Gutierréz , Stephen Hale , Mark Harmon , John Harte , Gary Haskins , Donald Henshaw , Luise Hermanutz , Pamela Hidalgo , Pedro Higuchi , Andrew Hoey , Gert van Hoey , Annika Hofgaard , Kristen Holeck , Robert Hollister , Richard Holmes , Mia Hoogenboom , Chih‐hao Hsieh , Stephen Hubbell , Falk Huettmann , Christine Huffard , Allen Hurlbert , Natália Macedo Ivanauskas , David Janík , Ute Jandt , Anna Jażdżewska , Tore Johannessen , Jill Johnstone , Julia Jones , Faith Jones , Jungwon Kang , Tasrif Kartawijaya , Erin Keeley , Douglas Kelt , Rebecca Kinnear , Kari Klanderud , Halvor Knutsen , Christopher Koenig , Alessandra Kortz , Kamil Král , Linda Kuhnz , Chao‐yang Kuo , David Kushner , Claire Laguionie-Marchais , Lesley Lancaster , Cheol Min Lee , Jonathan Lefcheck , Esther Lévesque , David Lightfoot , Francisco Lloret , John Lloyd , Adrià López-Baucells , Maite Louzao , Joshua Madin , Borgþór Magnússon , Shahar Malamud , Iain Matthews , Kent Mcfarland , Brian Mcgill , Diane Mcknight , William Mclarney , Jason Meador , Peter Meserve , Daniel Metcalfe , Christoph Meyer , Anders Michelsen , Nataliya Milchakova , Tom Moens , Even Moland , Jon Moore , Carolina Mathias Moreira , Jörg Müller , Grace Murphy , Isla Myers-Smith , Randall Myster , Andrew Naumov , Francis Neat , James Nelson , Michael Paul Nelson , Stephen Newton , Natalia Norden , Jeffrey Oliver , Esben Olsen , Vladimir Onipchenko , Krzysztof Pabis , Robert Pabst , Alain Paquette , Sinta Pardede , David Paterson , Raphaël Pélissier , Josep Peñuelas , Alejandro Pérez-Matus , Oscar Pizarro , Francesco Pomati , Eric Post , Herbert Prins , John Priscu , Pieter Provoost , Kathleen Prudic , Erkki Pulliainen , B. Ramesh , Olivia Mendivil Ramos , Andrew Rassweiler , Jose Eduardo Rebelo , Daniel Reed , Peter Reich , Suzanne Remillard , Anthony Richardson , J. Paul Richardson , Itai van Rijn , Ricardo Rocha , Victor Rivera-Monroy , Christian Rixen , Kevin Robinson , Ricardo Ribeiro Rodrigues , Denise de Cerqueira Rossa-Feres , Lars Rudstam , Henry Ruhl , Catalina Ruz , Erica Sampaio , Nancy Rybicki , Andrew Rypel , Sofia Sal , Beatriz Salgado , Flavio Santos , Ana Paula Savassi-Coutinho , Sara Scanga , Jochen Schmidt , Robert Schooley , Fakhrizal Setiawan , Kwang‐tsao Shao , Gaius Shaver , Sally Sherman , Thomas Sherry , Jacek Siciński , Caya Sievers , Ana Carolina da Silva , Fernando Rodrigues da Silva , Fabio Silveira , Jasper Slingsby , Tracey Smart , Sara Snell , Nadejda Soudzilovskaia , Gabriel Souza , Flaviana Maluf Souza , Vinícius Castro Souza , Christopher Stallings , Rowan Stanforth , Emily Stanley , José Mauro Sterza , Maarten Stevens , Rick Stuart-Smith , Yzel Rondon Suarez , Sarah Supp , Jorge Yoshio Tamashiro , Sukmaraharja Tarigan , Gary Thiede , Simon Thorn , Anne Tolvanen , Maria Teresa Zugliani Toniato , Ørjan Totland , Robert Twilley , Gediminas Vaitkus , Nelson Valdivia , Martha Isabel Vallejo , Thomas Valone , Carl van Colen , Jan Vanaverbeke , Fabio Venturoli , Hans Verheye , Marcelo Vianna , Rui Vieira , Tomáš Vrška , Con Quang Vu , Lien van Vu , Robert Waide , Conor Waldock , Dave Watts , Sara Webb , Tomasz Wesołowski , Ethan White , Claire Widdicombe , Dustin Wilgers , Richard Williams , Stefan Williams , Mark Williamson , Michael Willig , Trevor Willis , Sonja Wipf , Kerry Woods , Eric Woehler , Kyle Zawada , Michael Zettler
Maria Dornelas
Laura Antão
Faye Moyes
Amanda Bates
  • Fonction : Auteur
Anne Magurran
Dušan Adam
  • Fonction : Auteur
Asem Akhmetzhanova
  • Fonction : Auteur
Ward Appeltans
  • Fonction : Auteur
José Manuel Arcos
  • Fonction : Auteur
Haley Arnold
  • Fonction : Auteur
Gal Badihi
  • Fonction : Auteur
Andrew Baird
  • Fonction : Auteur
Miguel Barbosa
  • Fonction : Auteur
Tiago Egydio Barreto
  • Fonction : Auteur
Claus Bässler
  • Fonction : Auteur
Alecia Bellgrove
  • Fonction : Auteur
Jonathan Belmaker
  • Fonction : Auteur
Lisandro Benedetti-Cecchi
  • Fonction : Auteur
Brian Bett
  • Fonction : Auteur
Anne Bjorkman
  • Fonction : Auteur
Magdalena Błażewicz
  • Fonction : Auteur
Shane Blowes
  • Fonction : Auteur
Christopher Bloch
  • Fonction : Auteur
Timothy Bonebrake
  • Fonction : Auteur
Susan Boyd
  • Fonction : Auteur
Matt Bradford
  • Fonction : Auteur
Andrew Brooks
  • Fonction : Auteur
James Brown
  • Fonction : Auteur
Helge Bruelheide
  • Fonction : Auteur
Phaedra Budy
  • Fonction : Auteur
Fernando Carvalho
  • Fonction : Auteur
Edward Castañeda-Moya
  • Fonction : Auteur
Chaolun Allen Chen
  • Fonction : Auteur
John Chamblee
  • Fonction : Auteur
Tory Chase
  • Fonction : Auteur
Laura Siegwart Collier
  • Fonction : Auteur
Sharon Collinge
  • Fonction : Auteur
Richard Condit
  • Fonction : Auteur
Elisabeth Cooper
  • Fonction : Auteur
J. Hans C. Cornelissen
  • Fonction : Auteur
Unai Cotano
  • Fonction : Auteur
Shannan Kyle Crow
  • Fonction : Auteur
Gabriella Damasceno
  • Fonction : Auteur
Claire Davies
  • Fonction : Auteur
Robert Davis
  • Fonction : Auteur
Frank Day
  • Fonction : Auteur
Steven Degraer
  • Fonction : Auteur
Tim Doherty
  • Fonction : Auteur
Timothy Dunn
  • Fonction : Auteur
Giselda Durigan
  • Fonction : Auteur
J. Emmett Duffy
  • Fonction : Auteur
Dor Edelist
  • Fonction : Auteur
Graham Edgar
  • Fonction : Auteur
Robin Elahi
  • Fonction : Auteur
Sarah Elmendorf
  • Fonction : Auteur
Anders Enemar
  • Fonction : Auteur
S. Ernest
  • Fonction : Auteur
Rubén Escribano
  • Fonction : Auteur
Marc Estiarte
  • Fonction : Auteur
Brian Evans
  • Fonction : Auteur
Tung‐yung Fan
  • Fonction : Auteur
Fabiano Turini Farah
  • Fonction : Auteur
Luiz Loureiro Fernandes
  • Fonction : Auteur
Fábio Farneda
  • Fonction : Auteur
Alessandra Fidelis
  • Fonction : Auteur
Robert Fitt
  • Fonction : Auteur
Anna Maria Fosaa
  • Fonction : Auteur
Grace Frank
  • Fonction : Auteur
William Fraser
  • Fonction : Auteur
Hernando García
  • Fonction : Auteur
Roberto Cazzolla Gatti
  • Fonction : Auteur
Or Givan
  • Fonction : Auteur
Elizabeth Gorgone-Barbosa
  • Fonction : Auteur
William Gould
  • Fonction : Auteur
Corinna Gries
  • Fonction : Auteur
Gary Grossman
  • Fonction : Auteur
Julio Gutierréz
  • Fonction : Auteur
Stephen Hale
  • Fonction : Auteur
Mark Harmon
  • Fonction : Auteur
John Harte
  • Fonction : Auteur
Gary Haskins
  • Fonction : Auteur
Donald Henshaw
  • Fonction : Auteur
Luise Hermanutz
  • Fonction : Auteur
Pamela Hidalgo
  • Fonction : Auteur
Pedro Higuchi
  • Fonction : Auteur
Andrew Hoey
  • Fonction : Auteur
Gert van Hoey
  • Fonction : Auteur
Annika Hofgaard
  • Fonction : Auteur
Kristen Holeck
  • Fonction : Auteur
Robert Hollister
  • Fonction : Auteur
Richard Holmes
  • Fonction : Auteur
Mia Hoogenboom
  • Fonction : Auteur
Chih‐hao Hsieh
  • Fonction : Auteur
Stephen Hubbell
  • Fonction : Auteur
Falk Huettmann
  • Fonction : Auteur
Christine Huffard
  • Fonction : Auteur
Allen Hurlbert
  • Fonction : Auteur
Natália Macedo Ivanauskas
  • Fonction : Auteur
David Janík
  • Fonction : Auteur
Ute Jandt
  • Fonction : Auteur
Anna Jażdżewska
  • Fonction : Auteur
Tore Johannessen
  • Fonction : Auteur
Jill Johnstone
  • Fonction : Auteur
Julia Jones
  • Fonction : Auteur
Faith Jones
  • Fonction : Auteur
Jungwon Kang
  • Fonction : Auteur
Tasrif Kartawijaya
  • Fonction : Auteur
Erin Keeley
  • Fonction : Auteur
Douglas Kelt
  • Fonction : Auteur
Rebecca Kinnear
  • Fonction : Auteur
Kari Klanderud
  • Fonction : Auteur
Halvor Knutsen
  • Fonction : Auteur
Christopher Koenig
  • Fonction : Auteur
Alessandra Kortz
  • Fonction : Auteur
Kamil Král
  • Fonction : Auteur
Linda Kuhnz
  • Fonction : Auteur
Chao‐yang Kuo
  • Fonction : Auteur
David Kushner
  • Fonction : Auteur
Claire Laguionie-Marchais
Lesley Lancaster
  • Fonction : Auteur
Cheol Min Lee
  • Fonction : Auteur
Jonathan Lefcheck
  • Fonction : Auteur
Esther Lévesque
  • Fonction : Auteur
David Lightfoot
  • Fonction : Auteur
Francisco Lloret
  • Fonction : Auteur
John Lloyd
  • Fonction : Auteur
Adrià López-Baucells
  • Fonction : Auteur
Maite Louzao
  • Fonction : Auteur
Joshua Madin
  • Fonction : Auteur
Borgþór Magnússon
  • Fonction : Auteur
Shahar Malamud
  • Fonction : Auteur
Iain Matthews
  • Fonction : Auteur
Kent Mcfarland
  • Fonction : Auteur
Brian Mcgill
  • Fonction : Auteur
Diane Mcknight
  • Fonction : Auteur
William Mclarney
  • Fonction : Auteur
Jason Meador
  • Fonction : Auteur
Peter Meserve
  • Fonction : Auteur
Daniel Metcalfe
  • Fonction : Auteur
Christoph Meyer
  • Fonction : Auteur
Anders Michelsen
  • Fonction : Auteur
Nataliya Milchakova
  • Fonction : Auteur
Tom Moens
  • Fonction : Auteur
Even Moland
  • Fonction : Auteur
Jon Moore
  • Fonction : Auteur
Carolina Mathias Moreira
  • Fonction : Auteur
Jörg Müller
  • Fonction : Auteur
Grace Murphy
  • Fonction : Auteur
Isla Myers-Smith
  • Fonction : Auteur
Randall Myster
  • Fonction : Auteur
Andrew Naumov
  • Fonction : Auteur
Francis Neat
  • Fonction : Auteur
James Nelson
  • Fonction : Auteur
Michael Paul Nelson
  • Fonction : Auteur
Stephen Newton
  • Fonction : Auteur
Natalia Norden
  • Fonction : Auteur
Jeffrey Oliver
  • Fonction : Auteur
Esben Olsen
  • Fonction : Auteur
Vladimir Onipchenko
  • Fonction : Auteur
Krzysztof Pabis
  • Fonction : Auteur
Robert Pabst
  • Fonction : Auteur
Alain Paquette
  • Fonction : Auteur
Sinta Pardede
  • Fonction : Auteur
David Paterson
  • Fonction : Auteur
Raphaël Pélissier
Josep Peñuelas
  • Fonction : Auteur
Alejandro Pérez-Matus
  • Fonction : Auteur
Oscar Pizarro
  • Fonction : Auteur
Francesco Pomati
  • Fonction : Auteur
Eric Post
  • Fonction : Auteur
Herbert Prins
  • Fonction : Auteur
John Priscu
  • Fonction : Auteur
Pieter Provoost
  • Fonction : Auteur
Kathleen Prudic
  • Fonction : Auteur
Erkki Pulliainen
  • Fonction : Auteur
B. Ramesh
  • Fonction : Auteur
Olivia Mendivil Ramos
  • Fonction : Auteur
Andrew Rassweiler
  • Fonction : Auteur
Jose Eduardo Rebelo
  • Fonction : Auteur
Daniel Reed
  • Fonction : Auteur
Peter Reich
  • Fonction : Auteur
Suzanne Remillard
  • Fonction : Auteur
Anthony Richardson
  • Fonction : Auteur
J. Paul Richardson
  • Fonction : Auteur
Itai van Rijn
  • Fonction : Auteur
Ricardo Rocha
  • Fonction : Auteur
Victor Rivera-Monroy
  • Fonction : Auteur
Christian Rixen
  • Fonction : Auteur
Kevin Robinson
  • Fonction : Auteur
Ricardo Ribeiro Rodrigues
  • Fonction : Auteur
Lars Rudstam
  • Fonction : Auteur
Henry Ruhl
  • Fonction : Auteur
Catalina Ruz
  • Fonction : Auteur
Erica Sampaio
  • Fonction : Auteur
Nancy Rybicki
  • Fonction : Auteur
Andrew Rypel
  • Fonction : Auteur
Sofia Sal
  • Fonction : Auteur
Beatriz Salgado
  • Fonction : Auteur
Flavio Santos
  • Fonction : Auteur
Ana Paula Savassi-Coutinho
  • Fonction : Auteur
Sara Scanga
  • Fonction : Auteur
Jochen Schmidt
  • Fonction : Auteur
Robert Schooley
  • Fonction : Auteur
Fakhrizal Setiawan
  • Fonction : Auteur
Kwang‐tsao Shao
  • Fonction : Auteur
Gaius Shaver
  • Fonction : Auteur
Sally Sherman
  • Fonction : Auteur
Thomas Sherry
  • Fonction : Auteur
Jacek Siciński
  • Fonction : Auteur
Caya Sievers
  • Fonction : Auteur
Ana Carolina da Silva
  • Fonction : Auteur
Fernando Rodrigues da Silva
  • Fonction : Auteur
Fabio Silveira
  • Fonction : Auteur
Jasper Slingsby
  • Fonction : Auteur
Tracey Smart
  • Fonction : Auteur
Sara Snell
  • Fonction : Auteur
Nadejda Soudzilovskaia
  • Fonction : Auteur
Gabriel Souza
  • Fonction : Auteur
Flaviana Maluf Souza
  • Fonction : Auteur
Vinícius Castro Souza
  • Fonction : Auteur
Christopher Stallings
  • Fonction : Auteur
Rowan Stanforth
  • Fonction : Auteur
Emily Stanley
  • Fonction : Auteur
José Mauro Sterza
  • Fonction : Auteur
Maarten Stevens
  • Fonction : Auteur
Rick Stuart-Smith
  • Fonction : Auteur
Yzel Rondon Suarez
  • Fonction : Auteur
Sarah Supp
  • Fonction : Auteur
Jorge Yoshio Tamashiro
  • Fonction : Auteur
Sukmaraharja Tarigan
  • Fonction : Auteur
Gary Thiede
  • Fonction : Auteur
Simon Thorn
  • Fonction : Auteur
Anne Tolvanen
  • Fonction : Auteur
Maria Teresa Zugliani Toniato
  • Fonction : Auteur
Ørjan Totland
  • Fonction : Auteur
Robert Twilley
  • Fonction : Auteur
Gediminas Vaitkus
  • Fonction : Auteur
Nelson Valdivia
  • Fonction : Auteur
Martha Isabel Vallejo
  • Fonction : Auteur
Thomas Valone
  • Fonction : Auteur
Carl van Colen
  • Fonction : Auteur
Jan Vanaverbeke
  • Fonction : Auteur
Fabio Venturoli
  • Fonction : Auteur
Hans Verheye
  • Fonction : Auteur
Marcelo Vianna
  • Fonction : Auteur
Rui Vieira
  • Fonction : Auteur
Tomáš Vrška
  • Fonction : Auteur
Con Quang Vu
  • Fonction : Auteur
Lien van Vu
  • Fonction : Auteur
Robert Waide
  • Fonction : Auteur
Conor Waldock
  • Fonction : Auteur
Dave Watts
  • Fonction : Auteur
Sara Webb
  • Fonction : Auteur
Tomasz Wesołowski
  • Fonction : Auteur
Ethan White
  • Fonction : Auteur
Claire Widdicombe
  • Fonction : Auteur
Dustin Wilgers
  • Fonction : Auteur
Richard Williams
  • Fonction : Auteur
Stefan Williams
  • Fonction : Auteur
Mark Williamson
  • Fonction : Auteur
Michael Willig
  • Fonction : Auteur
Trevor Willis
  • Fonction : Auteur
Sonja Wipf
  • Fonction : Auteur
Kerry Woods
  • Fonction : Auteur
Eric Woehler
Kyle Zawada
  • Fonction : Auteur
Michael Zettler

Résumé

Abstract Motivation The BioTIME database contains raw data on species identities and abundances in ecological assemblages through time. These data enable users to calculate temporal trends in biodiversity within and amongst assemblages using a broad range of metrics. BioTIME is being developed as a community‐led open‐source database of biodiversity time series. Our goal is to accelerate and facilitate quantitative analysis of temporal patterns of biodiversity in the Anthropocene. Main types of variables included The database contains 8,777,413 species abundance records, from assemblages consistently sampled for a minimum of 2 years, which need not necessarily be consecutive. In addition, the database contains metadata relating to sampling methodology and contextual information about each record. Spatial location and grain BioTIME is a global database of 547,161 unique sampling locations spanning the marine, freshwater and terrestrial realms. Grain size varies across datasets from 0.0000000158 km 2 (158 cm 2 ) to 100 km 2 (1,000,000,000,000 cm 2 ). Time period and grain BioTIME records span from 1874 to 2016. The minimal temporal grain across all datasets in BioTIME is a year. Major taxa and level of measurement BioTIME includes data from 44,440 species across the plant and animal kingdoms, ranging from plants, plankton and terrestrial invertebrates to small and large vertebrates. Software format .csv and .SQL.

Dates et versions

hal-05271038 , version 1 (21-09-2025)

Identifiants

Citer

Maria Dornelas, Laura Antão, Faye Moyes, Amanda Bates, Anne Magurran, et al.. BioTIME: A database of biodiversity time series for the Anthropocene. Global Ecology and Biogeography, 2018, 27 (7), pp.760-786. ⟨10.1111/geb.12729⟩. ⟨hal-05271038⟩
83 Consultations
0 Téléchargements

Altmetric

Partager

  • More