Les fonctions biogéochimiques et les services écosystémiques associés aux zones humides sont souvent avancés comme un argument en faveur de leur préservation. Néanmoins les processus biogéochimiques sous-jacents liés notamment à l’engorgement des sols et les outils/indicateurs les caractérisant sont peu connus des acteurs techniques. Ainsi, les bénéfices des actions écologiques dans ce domaine restent mal identifiés (hors zones tampons en milieu agricole), empêchant une vision multifonctionnelle de ces écosystèmes et une communication efficace des services induits pour la société. Le projet BIOGEOZH a travaillé à la création d’un outil à la fois d’évaluation des enjeux biogéochimiques à l’échelle d’un bassin versant et aussi d’identification de l’expression des fonctions épuratoires des zones humides à partir d’indicateurs reposants sur la géomatique, la biogéochimie et la microbiologie, en intégrant les approches de biologie moléculaire. Sélectionnés à partir de la littérature, ces indicateurs ont ensuite été testés in situ sur 21 zones humides dans le bassin versant de la Bourbre. Les résultats sont synthétisés dans un guide et rendus accessibles aux gestionnaires en présentant les fonctions épuratoires et leurs indicateurs afin de qualifier les enjeux à l’échelle d’un bassin versant et la capacité épuratoire des ZH.