Protocol for cellular RNA G-quadruplex profiling using G4RP.v2 - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue STAR Protocols Année : 2024

Protocol for cellular RNA G-quadruplex profiling using G4RP.v2

Résumé

The isolation of G-quadruplexes (G4s) from human cells using specific molecular tools constitutes an invaluable step forward in uncovering the biology of these higher-order DNA and RNA structures. Here, we present an improved version of the G4-RNA precipitation (G4RP) protocol developed to identify RNA G4s from human cancer cells. We describe steps for cell treatment and lysis, chemoprecipitation of G4s using TASQ tools, go/no-go steps, and quantitative reverse-transcription PCR (RT-qPCR) quantification and analysis.

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STAR Protoc - 2024 - 5 - 103480.pdf (10.56 Mo) Télécharger le fichier
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Dates et versions

hal-04830486 , version 1 (11-12-2024)

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Citer

Jérémie Mitteaux, David Monchaud. Protocol for cellular RNA G-quadruplex profiling using G4RP.v2. STAR Protocols, 2024, 5 (4), pp.103480. ⟨10.1016/j.xpro.2024.103480⟩. ⟨hal-04830486⟩
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