Laboratory practices for the diagnosis and management of mucormycosis in France, 2024
Laurence Millon
(1, 2)
,
Françoise Botterel
(3)
,
Julie Bonhomme
(4, 5)
,
Stéphane Valot
(6)
,
Philippe Poirier
(7, 8)
,
Marie-Fleur Durieux
(9)
,
Jeanne Bigot
(10, 11)
,
Guillaume Desoubeaux
(12)
,
Adélaïde Chesnais
(12)
,
Florent Morio
(13, 14)
,
Marc Pihet
(15)
,
Kévin Brunet
(16, 17, 18)
,
Anne-Pauline Bellanger
(2, 1)
,
Sébastien Imbert
(19)
,
Gilles Nevez
(20, 21, 22)
,
Solène Le Gal
(21, 22, 20)
,
Nathalie Bourgeois
(23)
,
Anne Debourgogne
(24)
,
Marjorie Cornu
(25, 26)
,
Florence Persat
(27, 28)
,
Lilia Hasseine
(29)
,
Marie-Elisabeth Bougnoux
(30)
,
Sophie Brun
(31)
,
Muriel Cornet
(32, 33)
,
Loïc Favennec
(34)
,
Gilles Gargala
(34)
,
Christine Bonnal
(35)
,
Jean-Pierre Gangneux
(36)
,
Alexandre Alanio
(37)
,
Xavier Iriart
(38, 39)
,
Caroline Mahinc
(40)
,
Taieb Chouaki
(41)
,
André Paugam
(42)
,
Eric Dannaoui
(43, 44)
1
Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon]
2 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
3 Hôpital Henri Mondor
4 Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen]
5 ABTE - Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements
6 CHU Dijon - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand
7 M2iSH - Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte
8 CHU Clermont-Ferrand
9 Service de Parasitologie Mycologie [CHU Limoges]
10 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
11 CRSA - Centre de Recherche Saint-Antoine
12 CHU Trousseau [Tours]
13 IICiMed - Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - UR 1155
14 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
15 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
16 UFR Santé [Poitiers] - Université de Poitiers – UFR Santé [Faculté de Médecine et de Pharmacie]
17 Service de mycologie et de parasitologie médicale [CHU de Poitiers]
18 PHAR2 [Poitiers] - Pharmacologie des anti-infectieux et antibiorésistance [U 1070]
19 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
20 IRF - Infections Respiratoires Fongiques
21 ICAT - SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques
22 Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede [CHRU Brest]
23 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
24 CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy
25 Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU LIlle]
26 UGSF - Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576
27 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
28 HCL - Hospices Civils de Lyon
29 CHU Nice [Cimiez]
30 HEGP - Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP]
31 Hôpital Avicenne [AP-HP]
32 CHUGA - Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble]
33 TIMC - Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525
34 CHU Rouen
35 AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]
36 Hôpital Sud [CHU Rennes]
37 Laboratoire de Parasitologie-Mycologie [CHU Saint Louis, Paris]
38 Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse]
39 Infinity - Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires
40 CHU ST-E - Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne]
41 CHU Amiens-Picardie
42 Service de parasitologie-mycologie [CHU Cochin]
43 Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP]
44 UPCité - Université Paris Cité
2 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
3 Hôpital Henri Mondor
4 Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen]
5 ABTE - Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements
6 CHU Dijon - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand
7 M2iSH - Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte
8 CHU Clermont-Ferrand
9 Service de Parasitologie Mycologie [CHU Limoges]
10 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
11 CRSA - Centre de Recherche Saint-Antoine
12 CHU Trousseau [Tours]
13 IICiMed - Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - UR 1155
14 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
15 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
16 UFR Santé [Poitiers] - Université de Poitiers – UFR Santé [Faculté de Médecine et de Pharmacie]
17 Service de mycologie et de parasitologie médicale [CHU de Poitiers]
18 PHAR2 [Poitiers] - Pharmacologie des anti-infectieux et antibiorésistance [U 1070]
19 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
20 IRF - Infections Respiratoires Fongiques
21 ICAT - SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques
22 Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede [CHRU Brest]
23 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
24 CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy
25 Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU LIlle]
26 UGSF - Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576
27 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
28 HCL - Hospices Civils de Lyon
29 CHU Nice [Cimiez]
30 HEGP - Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP]
31 Hôpital Avicenne [AP-HP]
32 CHUGA - Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble]
33 TIMC - Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525
34 CHU Rouen
35 AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]
36 Hôpital Sud [CHU Rennes]
37 Laboratoire de Parasitologie-Mycologie [CHU Saint Louis, Paris]
38 Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse]
39 Infinity - Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires
40 CHU ST-E - Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne]
41 CHU Amiens-Picardie
42 Service de parasitologie-mycologie [CHU Cochin]
43 Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP]
44 UPCité - Université Paris Cité
Florent Morio
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1049989
- IdHAL : florent-morio
- ORCID : 0000-0002-5859-6105
- IdRef : 117992259
Taieb Chouaki
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1412669
- ORCID : 0009-0002-3453-1232
- IdRef : 117515043
Eric Dannaoui
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756898
- IdHAL : eric-dannaoui
- ORCID : 0000-0002-2817-3830
- IdRef : 233666184
Résumé
This study investigates the diagnostic practices for mucormycosis among 30 French University Hospital mycology laboratories, in 2024. All laboratories perform both direct examination and culture, with fluorescent brighteners being the most commonly used method for direct examination. While 77 % of the participating laboratories routinely identify Mucorales to the species level, with 70 % having adopted Mucorales-specific quantitative PCR, primarily for the diagnosis of invasive fungal infections. Antifungal susceptibility testing practices varied between centers, with 36.7 % of laboratories consistently performing these tests, primarily using gradient concentration strips. Amphotericin B, posaconazole, and isavuconazole were the most frequently tested antifungals. These findings highlight variations in laboratory practices and emphasize the importance of establishing uniform diagnostic and susceptibility testing methods to optimize mucormycosis management.