IL-7–dependent and –independent lineages of IL-7R–dependent human T cells
Carlos Arango-Franco
(1, 2, 3)
,
Masato Ogishi
(4)
,
Susanne Unger
(5)
,
Ottavia Delmonte
(6)
,
Julio César Orrego
(3)
,
Ahmad Yatim
(6)
,
Margarita Velasquez-Lopera
(3)
,
Andrés Zea-Vera
(6, 7, 8)
,
Jonathan Bohlen
(1, 2)
,
Marwa Chbihi
(1, 2)
,
Antoine Fayand
(1, 2)
,
Juan Pablo Sánchez
(3)
,
Julian Rojas
(3)
,
Yoann Seeleuthner
(1, 2)
,
Tom Le Voyer
(1, 2)
,
Quentin Philippot
(1, 2)
,
Kathryn Payne
(5)
,
Adrian Gervais
(1, 2)
,
Lucia Erazo-Borrás
(1, 2, 3)
,
Luis Correa-Londoño
(3)
,
Axel Cederholm
(9)
,
Alejandro Gallón-Duque
(3)
,
Pedro Gonçalves
(10)
,
Jean-Marc Doisne
(10)
,
Liran Horev
(11, 12)
,
Bénédicte Charmeteau-de Muylder
(13)
,
Jesús Á. Álvarez
(3)
,
Diana Arboleda
(3)
,
Lizet Pérez-Zapata
(3)
,
Estefanía Vásquez-Echeverri
(3)
,
Marcela Moncada-Vélez
(3, 4)
,
Juan López
(3)
,
Yolanda Caicedo
(14)
,
Boaz Palterer
(6)
,
Pablo Patiño
(3)
,
Carlos Montoya
(3)
,
Matthieu Chaldebas
(4)
,
Peng Zhang
(1, 15, 4)
,
Tina Nguyen
(16, 17)
,
Cindy Ma
(16, 17)
,
Mohamed Jeljeli
(18)
,
Juan Alzate
(3)
,
Felipe Cabarcas
(3)
,
Taushif Khan
(19, 20)
,
Darawan Rinchai
(4)
,
Jean-Luc Prétet
(21, 22)
,
Bertrand Boisson
(1, 2, 4)
,
Nico Marr
(19, 20)
,
Ruba Ibrahim
(11, 12)
,
Vered Molho-Pessach
(11, 12)
,
Stéphanie Boisson-Dupuis
(1, 2, 4)
,
Dimitra Kiritsi
(23)
,
João Barata
(24)
,
Nils Landegren
(9)
,
Bénédicte Neven
(25)
,
Laurent Abel
(1, 2, 4)
,
Andrea Lisco
(6)
,
Vivien Béziat
(1, 2, 4)
,
Emmanuelle Jouanguy
(1, 2, 4)
,
Jacinta Bustamante
(1, 2, 4)
,
James Di Santo
(10)
,
Stuart Tangye
(16, 17)
,
Luigi Notarangelo
(6)
,
Rémi Cheynier
(13)
,
Ken Natsuga
(26)
,
Andrés Arias
(3, 4)
,
José Luis Franco
(3)
,
Klaus Warnatz
(5)
,
Jean-Laurent Casanova
(1, 2, 4, 27)
,
Anne Puel
(1, 2, 4)
1
Imagine - U1163 -
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
2 Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
3 Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
4 Rockefeller University [New York]
5 Albert-Ludwigs-Universität Freiburg = University of Freiburg
6 NIH - National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
7 HUV - Hospital Universitario del Valle Evaristo García ESE [Cali, Colombia]
8 Univalle - Universidad del Valle [Cali]
9 Uppsala Universitet [Uppsala]
10 Immunité Innée - Innate Immunity
11 HUJ - The Hebrew University of Jerusalem
12 Hadassah Hebrew University Medical Center [Jerusalem]
13 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
14 CFCS - Clinica Farallones Christus Sinergia [Cali, Colombia]
15 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
16 Garvan Institute of medical research
17 UNSW - University of New South Wales [Sydney]
18 Hôpital Cochin [AP-HP]
19 Sidra Medicine [Doha, Qatar]
20 HBKU - Hamad Bin Khalifa University [Doha, Qatar]
21 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
22 CHRU Besançon - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon
23 Uniklinik - Universitäts Klinikum Freiburg = University Medical Center Freiburg
24 ULISBOA - Universidade de Lisboa = University of Lisbon = Université de Lisbonne
25 Karolinska Institute
26 Hokkaido University [Sapporo, Japan]
27 HHMI - Howard Hughes Medical Institute
2 Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
3 Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
4 Rockefeller University [New York]
5 Albert-Ludwigs-Universität Freiburg = University of Freiburg
6 NIH - National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
7 HUV - Hospital Universitario del Valle Evaristo García ESE [Cali, Colombia]
8 Univalle - Universidad del Valle [Cali]
9 Uppsala Universitet [Uppsala]
10 Immunité Innée - Innate Immunity
11 HUJ - The Hebrew University of Jerusalem
12 Hadassah Hebrew University Medical Center [Jerusalem]
13 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
14 CFCS - Clinica Farallones Christus Sinergia [Cali, Colombia]
15 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
16 Garvan Institute of medical research
17 UNSW - University of New South Wales [Sydney]
18 Hôpital Cochin [AP-HP]
19 Sidra Medicine [Doha, Qatar]
20 HBKU - Hamad Bin Khalifa University [Doha, Qatar]
21 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
22 CHRU Besançon - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon
23 Uniklinik - Universitäts Klinikum Freiburg = University Medical Center Freiburg
24 ULISBOA - Universidade de Lisboa = University of Lisbon = Université de Lisbonne
25 Karolinska Institute
26 Hokkaido University [Sapporo, Japan]
27 HHMI - Howard Hughes Medical Institute
Masato Ogishi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 798182
- ORCID : 0000-0003-2421-7389
Ottavia Delmonte
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1432112
- ORCID : 0000-0002-4772-0799
Julian Rojas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 810081
- ORCID : 0000-0002-1317-1875
Tom Le Voyer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 802716
- ORCID : 0000-0002-7253-3135
Kathryn Payne
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1191401
- ORCID : 0000-0003-3311-5210
Axel Cederholm
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1432113
- ORCID : 0009-0006-5973-9637
Pedro Gonçalves
- Fonction : Auteur
- PersonId : 982811
- IdHAL : pedrogoncalves
Jean-Marc Doisne
- Fonction : Auteur
- PersonId : 746758
- IdHAL : jean-marc-doisne
- ORCID : 0000-0001-6714-1308
Peng Zhang
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762416
- ORCID : 0000-0002-6129-567X
Cindy Ma
- Fonction : Auteur
- PersonId : 794453
- ORCID : 0000-0001-5387-8413
Juan Alzate
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1432114
- ORCID : 0000-0003-2578-4609
Taushif Khan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 802717
- ORCID : 0000-0002-7917-8965
Darawan Rinchai
- Fonction : Auteur
- PersonId : 775020
- ORCID : 0000-0001-8851-7730
Bertrand Boisson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757762
- ORCID : 0000-0001-5240-3555
- IdRef : 08188317X
Nico Marr
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762966
- ORCID : 0000-0002-1927-7072
Dimitra Kiritsi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1432115
- ORCID : 0000-0002-2331-8981
Laurent Abel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756191
- ORCID : 0000-0001-7016-6493
- IdRef : 07779432X
Andrea Lisco
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1432116
- ORCID : 0000-0002-1475-356X
Vivien Béziat
- Fonction : Auteur
- PersonId : 778044
- ORCID : 0000-0002-4020-824X
- IdRef : 149613741
Jacinta Bustamante
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757899
- ORCID : 0000-0002-3439-2482
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James Di Santo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766326
- ORCID : 0000-0002-7146-1862
- IdRef : 074625594
Luigi Notarangelo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758298
- ORCID : 0000-0002-8335-0262
Ken Natsuga
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1432117
- ORCID : 0000-0003-3865-6366
Andrés Arias
- Fonction : Auteur
- PersonId : 764637
- ORCID : 0000-0002-9478-8403
José Luis Franco
- Fonction : Auteur
- PersonId : 786438
- ORCID : 0000-0001-5664-6415
Jean-Laurent Casanova
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- PersonId : 867631
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Résumé
Infants with biallelic IL7R loss-of-function variants have severe combined immune deficiency (SCID) characterized by the absence of autologous T lymphocytes, but normal counts of circulating B and NK cells (T-B+NK+ SCID). We report 6 adults (aged 22 to 59 years) from 4 kindreds and 3 ancestries (Colombian, Israeli Arab, Japanese) carrying homozygous IL7 loss-of-function variants resulting in combined immunodeficiency (CID). Deep immunophenotyping revealed relatively normal counts and/or proportions of myeloid, B, NK, and innate lymphoid cells. By contrast, the patients had profound T cell lymphopenia, with low proportions of innate-like adaptive mucosal-associated invariant T and invariant NK T cells. They also had low blood counts of T cell receptor (TCR) excision circles, recent thymic emigrant T cells and naive CD4+ T cells, and low overall TCR repertoire diversity, collectively indicating impaired thymic output. The proportions of effector memory CD4+ and CD8+ T cells were high, indicating IL-7-independent homeostatic T cell proliferation in the periphery. Intriguingly, the proportions of other T cell subsets, including TCRγδ+ T cells and some TCRαβ+ T cell subsets (including Th1, Tfh, and Treg) were little affected. Peripheral CD4+ T cells displayed poor proliferation, but normal cytokine production upon stimulation with mitogens in vitro. Thus, inherited IL-7 deficiency impairs T cell development less severely and in a more subset-specific manner than IL-7R deficiency. These findings suggest that another IL-7R-binding cytokine, possibly thymic stromal lymphopoietin, governs an IL-7-independent pathway of human T cell development.
Domaines
Sciences du Vivant [q-bio]
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