Arkitekt: streaming analysis and real-time workflows for microscopy - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Nature Methods Année : 2024

Arkitekt: streaming analysis and real-time workflows for microscopy

Johannes Roos
  • Fonction : Auteur
Centre interdisciplinaire de recherche en biologie
Interdisciplinary Institute for Neuroscience [Bordeaux]
Institut de Neurosciences des Systèmes
Bordeaux Imaging Center
Stéphane Bancelin
Interdisciplinary Institute for Neuroscience [Bordeaux]
Tom Delaire
  • Fonction : Auteur
Centre interdisciplinaire de recherche en biologie
Interdisciplinary Institute for Neuroscience [Bordeaux]
Institut de Neurosciences des Systèmes
Bordeaux Imaging Center
Alexander Wilhelmi
Florian Levet
  • Fonction : Auteur
Centre interdisciplinaire de recherche en biologie
Interdisciplinary Institute for Neuroscience [Bordeaux]
Institut de Neurosciences des Systèmes
Bordeaux Imaging Center
Maren Engelhardt
  • Fonction : Auteur
Virgile Viasnoff
National University of Singapore
Biomechanics of cellular contacts
Rémi Galland
Interdisciplinary Institute for Neuroscience [Bordeaux]
Université de Bordeaux
U. Valentin Nägerl
Centre interdisciplinaire de recherche en biologie
Interdisciplinary Institute for Neuroscience [Bordeaux]
Institut de Neurosciences des Systèmes
Bordeaux Imaging Center
Jean-Baptiste Sibarita
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1194292
Centre interdisciplinaire de recherche en biologie
Interdisciplinary Institute for Neuroscience [Bordeaux]
Institut de Neurosciences des Systèmes
Bordeaux Imaging Center

Résumé

based parellelism No Yes (through tables) Imjoy Linear Progressive web app File based WASM in browser Asynchronous worker queues Yes No BioimageIT Linear Python-based desktop app File based Container Sequential execution No No Arkitekt Node based Web server Database and object storage Container

Domaines

Physique [physics] Informatique [cs]
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Soumis le : lundi 14 octobre 2024-13:44:41

Dernière modification le : mercredi 16 octobre 2024-03:24:09

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Citer

Johannes Roos, Stéphane Bancelin, Tom Delaire, Alexander Wilhelmi, Florian Levet, et al.. Arkitekt: streaming analysis and real-time workflows for microscopy. Nature Methods, 2024, 21 (10), pp.1884-1894. ⟨10.1038/s41592-024-02404-5⟩. ⟨hal-04735193⟩

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