Ce cours explore l'importance des marqueurs moléculaires dans l'amélioration des plantes et la conservation des ressources génétiques. Il commence par une revue de l'évolution des techniques de génotypage et de leur coût, soulignant la nécessité d'adapter le génotypage aux besoins spécifiques de chaque projet. Le cours présente l'évolution des techniques de génotypage, depuis les méthodes traditionnelles jusqu'aux technologies modernes de séquençage de nouvelle génération (NGS), mettant en lumière les avancées technologiques qui ont permis de réduire les coûts et d'augmenter l'efficacité du génotypage. L'accent est mis sur l'importance de choisir la technique de génotypage la plus appropriée en fonction des objectifs du projet et des ressources disponibles. Le cours détaille comment les marqueurs moléculaires sont utilisés dans les programmes de sélection des plantes : vérification de doublons, détection de QTLs (Quantitative Trait Loci), prédiction génomique et suivi backcross. La dernière partie du cours se concentre sur la gestion des ressources génétiques dans un Centre de Ressources Biologiques : suivi des doublons, création de core collections pour optimiser la caractérisation et réduire les coûts de gestion, et détection de loci adaptatifs pour prédire la vulnérabilité des populations et choisir les prochaines zones à prospecter. En conclusion, les marqueurs moléculaires jouent un rôle crucial dans l'amélioration des plantes et la conservation des ressources génétiques, permettant d'optimiser les programmes de sélection, de gérer efficacement les ressources génétiques et de préserver la diversité génétique pour les générations futures.