Genomic analyses identify hundreds of variants associated with age at menarche and support a role for puberty timing in cancer risk - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Nature Genetics Année : 2017

Genomic analyses identify hundreds of variants associated with age at menarche and support a role for puberty timing in cancer risk

Felix R Day , Deborah J Thompson , Hannes Helgason , Daniel I Chasman , Hilary Finucane , Patrick Sulem , Katherine S Ruth , Sean Whalen , Abhishek K Sarkar , Eva Albrecht , Elisabeth Altmaier , Marzyeh Amini , Caterina M Barbieri , Thibaud Boutin , Archie Campbell , Ellen Demerath , Ayush Giri , Chunyan He , Jouke J Hottenga , Robert Karlsson , Ivana Kolcic , Po-Ru Loh , Kathryn L Lunetta , Massimo Mangino , Brumat Marco , George Mcmahon , Sarah E Medland , Ilja M Nolte , Raymond Noordam , Teresa Nutile , Lavinia Paternoster , Natalia Perjakova , Eleonora Porcu , Lynda M Rose , Katharina E Schraut , Ayellet V Segrè , Albert V Smith , Lisette Stolk , Alexander Teumer , Irene L Andrulis , Stefania Bandinelli , Matthias W Beckmann , Javier Benitez , Sven Bergmann , Murielle Bochud , Eric Boerwinkle , Stig E Bojesen , Manjeet K Bolla , Judith S Brand , Hiltrud Brauch , Hermann Brenner , Linda Broer , Thomas Brüning , Julie E Buring , Harry Campbell , Eulalia Catamo , Stephen Chanock , Georgia Chenevix-Trench , Tanguy Corre , Fergus J Couch , Diana L Cousminer , Angela Cox , Laura Crisponi , Kamila Czene , George Davey Smith , Eco J C N de Geus , Renée de Mutsert , Immaculata de Vivo , Joe Dennis , Peter Devilee , Isabel Dos-Santos-Silva , Alison M Dunning , Johan G Eriksson , Peter A Fasching , Lindsay Fernández-Rhodes , Luigi Ferrucci , Dieter Flesch-Janys , Lude Franke , Marike Gabrielson , Ilaria Gandin , Graham G Giles , Harald Grallert , Daniel F Gudbjartsson , Pascal Guénel (1) , Per Hall , Emily Hallberg , Ute Hamann , Tamara B Harris , Catharina A Hartman , Gerardo Heiss , Maartje J Hooning , John L Hopper , Frank Hu , David J Hunter , M Arfan Ikram , Hae Kyung Im , Marjo-Riitta Järvelin , Peter K Joshi , David Karasik , Manolis Kellis , Zoltan Kutalik , Genevieve Lachance , Diether Lambrechts , Claudia Langenberg , Lenore J Launer , Joop S E Laven , Stefania Lenarduzzi , Jingmei Li , Penelope A Lind , Sara Lindstrom , Yongmei Liu , Jian'An Luan , Reedik Mägi , Arto Mannermaa , Hamdi Mbarek , Mark I Mccarthy , Christa Meisinger , Thomas Meitinger , Cristina Menni , Andres Metspalu , Kyriaki Michailidou , Lili Milani , Roger L Milne , Grant W Montgomery , Anna M Mulligan , Mike A Nalls , Pau Navarro , Heli Nevanlinna , Dale R Nyholt , Albertine J Oldehinkel , Tracy A O'Mara , Sandosh Padmanabhan , Aarno Palotie , Nancy Pedersen , Annette Peters , Julian Peto , Paul D P Pharoah , Anneli Pouta , Paolo Radice , Iffat Rahman , Susan M Ring , Antonietta Robino , Frits R Rosendaal , Igor Rudan , Rico Rueedi , Daniela Ruggiero , Cinzia F Sala , Marjanka K Schmidt , Robert A Scott , Mitul Shah , Rossella Sorice , Melissa C Southey , Ulla Sovio , Meir Stampfer , Maristella Steri , Konstantin Strauch , Toshiko Tanaka , Emmi Tikkanen , Nicholas J Timpson , Michela Traglia , Thérèse Truong (1) , Jonathan P Tyrer , André G Uitterlinden , Digna R Velez Edwards , Veronique Vitart , Uwe Völker , Peter Vollenweider , Qin Wang , Elisabeth Widen , Ko Willems van Dijk , Gonneke Willemsen , Robert Winqvist , Bruce H R Wolffenbuttel , Jing Hua Zhao , Magdalena Zoledziewska , Marek Zygmunt , Behrooz Z Alizadeh , Dorret I Boomsma , Marina Ciullo , Francesco Cucca , Tõnu Esko , Nora Franceschini , Christian Gieger , Vilmundur Gudnason , Caroline Hayward , Peter Kraft , Debbie A Lawlor , Patrik K E Magnusson , Nicholas G Martin , Dennis O Mook-Kanamori , Ellen A Nohr , Ozren Polasek , David Porteous , Alkes L Price , Paul M Ridker , Harold Snieder , Tim D Spector , Doris Stöckl , Daniela Toniolo , Sheila Ulivi , Jenny A Visser , Henry Völzke , Nicholas J Wareham , James F Wilson , Amanda B Spurdle , Unnur Thorsteindottir , Katherine S Pollard , Douglas F Easton , Joyce Y Tung , Jenny Chang-Claude , David Hinds , Anna Murray , Joanne M Murabito , Kari Stefansson , Ken K Ong , John R B Perry
Felix R Day
  • Fonction : Auteur
Deborah J Thompson
  • Fonction : Auteur
Hannes Helgason
  • Fonction : Auteur
Daniel I Chasman
  • Fonction : Auteur
Hilary Finucane
  • Fonction : Auteur
Patrick Sulem
  • Fonction : Auteur
Katherine S Ruth
  • Fonction : Auteur
Sean Whalen
  • Fonction : Auteur
Abhishek K Sarkar
  • Fonction : Auteur
Eva Albrecht
  • Fonction : Auteur
Elisabeth Altmaier
  • Fonction : Auteur
Marzyeh Amini
  • Fonction : Auteur
Caterina M Barbieri
  • Fonction : Auteur
Thibaud Boutin
  • Fonction : Auteur
Archie Campbell
  • Fonction : Auteur
Ellen Demerath
  • Fonction : Auteur
Ayush Giri
  • Fonction : Auteur
Chunyan He
  • Fonction : Auteur
Jouke J Hottenga
  • Fonction : Auteur
Robert Karlsson
  • Fonction : Auteur
Ivana Kolcic
  • Fonction : Auteur
Po-Ru Loh
  • Fonction : Auteur
Kathryn L Lunetta
  • Fonction : Auteur
Massimo Mangino
  • Fonction : Auteur
Brumat Marco
  • Fonction : Auteur
George Mcmahon
  • Fonction : Auteur
Sarah E Medland
  • Fonction : Auteur
Ilja M Nolte
  • Fonction : Auteur
Raymond Noordam
  • Fonction : Auteur
Teresa Nutile
  • Fonction : Auteur
Lavinia Paternoster
  • Fonction : Auteur
Natalia Perjakova
  • Fonction : Auteur
Eleonora Porcu
  • Fonction : Auteur
Lynda M Rose
  • Fonction : Auteur
Katharina E Schraut
  • Fonction : Auteur
Ayellet V Segrè
  • Fonction : Auteur
Albert V Smith
  • Fonction : Auteur
Lisette Stolk
  • Fonction : Auteur
Alexander Teumer
  • Fonction : Auteur
Irene L Andrulis
  • Fonction : Auteur
Stefania Bandinelli
  • Fonction : Auteur
Matthias W Beckmann
  • Fonction : Auteur
Javier Benitez
  • Fonction : Auteur
Sven Bergmann
  • Fonction : Auteur
Murielle Bochud
  • Fonction : Auteur
Eric Boerwinkle
  • Fonction : Auteur
Stig E Bojesen
  • Fonction : Auteur
Manjeet K Bolla
  • Fonction : Auteur
Judith S Brand
  • Fonction : Auteur
Hiltrud Brauch
  • Fonction : Auteur
Hermann Brenner
  • Fonction : Auteur
Linda Broer
  • Fonction : Auteur
Thomas Brüning
  • Fonction : Auteur
Julie E Buring
  • Fonction : Auteur
Harry Campbell
  • Fonction : Auteur
Eulalia Catamo
  • Fonction : Auteur
Stephen Chanock
  • Fonction : Auteur
Georgia Chenevix-Trench
  • Fonction : Auteur
Tanguy Corre
  • Fonction : Auteur
Fergus J Couch
  • Fonction : Auteur
Diana L Cousminer
  • Fonction : Auteur
Angela Cox
  • Fonction : Auteur
Laura Crisponi
  • Fonction : Auteur
Kamila Czene
  • Fonction : Auteur
George Davey Smith
  • Fonction : Auteur
Eco J C N de Geus
  • Fonction : Auteur
Renée de Mutsert
  • Fonction : Auteur
Immaculata de Vivo
  • Fonction : Auteur
Joe Dennis
  • Fonction : Auteur
Peter Devilee
  • Fonction : Auteur
Isabel Dos-Santos-Silva
  • Fonction : Auteur
Alison M Dunning
  • Fonction : Auteur
Johan G Eriksson
  • Fonction : Auteur
Peter A Fasching
  • Fonction : Auteur
Lindsay Fernández-Rhodes
  • Fonction : Auteur
Luigi Ferrucci
  • Fonction : Auteur
Dieter Flesch-Janys
  • Fonction : Auteur
Lude Franke
  • Fonction : Auteur
Marike Gabrielson
  • Fonction : Auteur
Ilaria Gandin
  • Fonction : Auteur
Graham G Giles
  • Fonction : Auteur
Harald Grallert
  • Fonction : Auteur
Daniel F Gudbjartsson
  • Fonction : Auteur
Per Hall
  • Fonction : Auteur
Emily Hallberg
  • Fonction : Auteur
Ute Hamann
  • Fonction : Auteur
Tamara B Harris
  • Fonction : Auteur
Catharina A Hartman
  • Fonction : Auteur
Gerardo Heiss
  • Fonction : Auteur
Maartje J Hooning
  • Fonction : Auteur
John L Hopper
  • Fonction : Auteur
Frank Hu
  • Fonction : Auteur
David J Hunter
  • Fonction : Auteur
M Arfan Ikram
  • Fonction : Auteur
Hae Kyung Im
  • Fonction : Auteur
Marjo-Riitta Järvelin
  • Fonction : Auteur
Peter K Joshi
  • Fonction : Auteur
David Karasik
  • Fonction : Auteur
Manolis Kellis
  • Fonction : Auteur
Zoltan Kutalik
  • Fonction : Auteur
Genevieve Lachance
  • Fonction : Auteur
Diether Lambrechts
  • Fonction : Auteur
Claudia Langenberg
  • Fonction : Auteur
Lenore J Launer
  • Fonction : Auteur
Joop S E Laven
  • Fonction : Auteur
Stefania Lenarduzzi
  • Fonction : Auteur
Jingmei Li
  • Fonction : Auteur
Penelope A Lind
  • Fonction : Auteur
Sara Lindstrom
  • Fonction : Auteur
Yongmei Liu
  • Fonction : Auteur
Jian'An Luan
  • Fonction : Auteur
Reedik Mägi
  • Fonction : Auteur
Arto Mannermaa
  • Fonction : Auteur
Hamdi Mbarek
  • Fonction : Auteur
Mark I Mccarthy
  • Fonction : Auteur
Christa Meisinger
  • Fonction : Auteur
Thomas Meitinger
  • Fonction : Auteur
Cristina Menni
  • Fonction : Auteur
Andres Metspalu
  • Fonction : Auteur
Kyriaki Michailidou
  • Fonction : Auteur
Lili Milani
  • Fonction : Auteur
Roger L Milne
  • Fonction : Auteur
Grant W Montgomery
  • Fonction : Auteur
Anna M Mulligan
  • Fonction : Auteur
Mike A Nalls
  • Fonction : Auteur
Pau Navarro
  • Fonction : Auteur
Heli Nevanlinna
  • Fonction : Auteur
Dale R Nyholt
  • Fonction : Auteur
Albertine J Oldehinkel
  • Fonction : Auteur
Tracy A O'Mara
  • Fonction : Auteur
Sandosh Padmanabhan
  • Fonction : Auteur
Aarno Palotie
  • Fonction : Auteur
Nancy Pedersen
  • Fonction : Auteur
Annette Peters
  • Fonction : Auteur
Julian Peto
  • Fonction : Auteur
Paul D P Pharoah
  • Fonction : Auteur
Anneli Pouta
  • Fonction : Auteur
Paolo Radice
  • Fonction : Auteur
Iffat Rahman
  • Fonction : Auteur
Susan M Ring
  • Fonction : Auteur
Antonietta Robino
  • Fonction : Auteur
Frits R Rosendaal
  • Fonction : Auteur
Igor Rudan
  • Fonction : Auteur
Rico Rueedi
  • Fonction : Auteur
Daniela Ruggiero
  • Fonction : Auteur
Cinzia F Sala
  • Fonction : Auteur
Marjanka K Schmidt
  • Fonction : Auteur
Robert A Scott
  • Fonction : Auteur
Mitul Shah
  • Fonction : Auteur
Rossella Sorice
  • Fonction : Auteur
Melissa C Southey
  • Fonction : Auteur
Ulla Sovio
  • Fonction : Auteur
Meir Stampfer
  • Fonction : Auteur
Maristella Steri
  • Fonction : Auteur
Konstantin Strauch
  • Fonction : Auteur
Toshiko Tanaka
  • Fonction : Auteur
Emmi Tikkanen
  • Fonction : Auteur
Nicholas J Timpson
  • Fonction : Auteur
Michela Traglia
  • Fonction : Auteur
Jonathan P Tyrer
  • Fonction : Auteur
André G Uitterlinden
  • Fonction : Auteur
Digna R Velez Edwards
  • Fonction : Auteur
Veronique Vitart
  • Fonction : Auteur
Uwe Völker
  • Fonction : Auteur
Peter Vollenweider
  • Fonction : Auteur
Qin Wang
  • Fonction : Auteur
Elisabeth Widen
  • Fonction : Auteur
Ko Willems van Dijk
  • Fonction : Auteur
Gonneke Willemsen
  • Fonction : Auteur
Robert Winqvist
  • Fonction : Auteur
Bruce H R Wolffenbuttel
  • Fonction : Auteur
Jing Hua Zhao
  • Fonction : Auteur
Magdalena Zoledziewska
  • Fonction : Auteur
Marek Zygmunt
  • Fonction : Auteur
Behrooz Z Alizadeh
  • Fonction : Auteur
Dorret I Boomsma
  • Fonction : Auteur
Marina Ciullo
  • Fonction : Auteur
Francesco Cucca
  • Fonction : Auteur
Tõnu Esko
  • Fonction : Auteur
Nora Franceschini
  • Fonction : Auteur
Christian Gieger
  • Fonction : Auteur
Vilmundur Gudnason
  • Fonction : Auteur
Caroline Hayward
  • Fonction : Auteur
Peter Kraft
  • Fonction : Auteur
Debbie A Lawlor
  • Fonction : Auteur
Patrik K E Magnusson
  • Fonction : Auteur
Nicholas G Martin
  • Fonction : Auteur
Dennis O Mook-Kanamori
  • Fonction : Auteur
Ellen A Nohr
  • Fonction : Auteur
Ozren Polasek
  • Fonction : Auteur
David Porteous
  • Fonction : Auteur
Alkes L Price
  • Fonction : Auteur
Paul M Ridker
  • Fonction : Auteur
Harold Snieder
  • Fonction : Auteur
Tim D Spector
  • Fonction : Auteur
Doris Stöckl
  • Fonction : Auteur
Daniela Toniolo
  • Fonction : Auteur
Sheila Ulivi
  • Fonction : Auteur
Jenny A Visser
  • Fonction : Auteur
Henry Völzke
  • Fonction : Auteur
Nicholas J Wareham
  • Fonction : Auteur
James F Wilson
  • Fonction : Auteur
Amanda B Spurdle
  • Fonction : Auteur
Unnur Thorsteindottir
  • Fonction : Auteur
Katherine S Pollard
  • Fonction : Auteur
Douglas F Easton
  • Fonction : Auteur
Joyce Y Tung
  • Fonction : Auteur
Jenny Chang-Claude
  • Fonction : Auteur
David Hinds
  • Fonction : Auteur
Anna Murray
  • Fonction : Auteur
Joanne M Murabito
  • Fonction : Auteur
Kari Stefansson
  • Fonction : Auteur
Ken K Ong
  • Fonction : Auteur
John R B Perry
  • Fonction : Auteur

Résumé

The timing of puberty is a highly polygenic childhood trait that is epidemiologically associated with various adult diseases. Using 1000 Genomes Project-imputed genotype data in up to ∼370,000 women, we identify 389 independent signals (P < 5 × 10-8) for age at menarche, a milestone in female pubertal development. In Icelandic data, these signals explain ∼7.4% of the population variance in age at menarche, corresponding to ∼25% of the estimated heritability. We implicate ∼250 genes via coding variation or associated expression, demonstrating significant enrichment in neural tissues. Rare variants near the imprinted genes MKRN3 and DLK1 were identified, exhibiting large effects when paternally inherited. Mendelian randomization analyses suggest causal inverse associations, independent of body mass index (BMI), between puberty timing and risks for breast and endometrial cancers in women and prostate cancer in men. In aggregate, our findings highlight the complexity of the genetic regulation of puberty timing and support causal links with cancer susceptibility.
Fichier principal
Vignette du fichier
nihms902232.pdf (1.71 Mo) Télécharger le fichier
Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-04687071 , version 1 (04-09-2024)

Identifiants

Citer

Felix R Day, Deborah J Thompson, Hannes Helgason, Daniel I Chasman, Hilary Finucane, et al.. Genomic analyses identify hundreds of variants associated with age at menarche and support a role for puberty timing in cancer risk. Nature Genetics, 2017, 49 (6), pp.834-841. ⟨10.1038/ng.3841⟩. ⟨hal-04687071⟩
1 Consultations
2 Téléchargements

Altmetric

Partager

More