Article Dans Une Revue Scientific Reports Année : 2022

Multicentre study on the reproducibility of MALDI-TOF MS for nontuberculous mycobacteria identification

David Rodriguez-Temporal
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Fernando Alcaide
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Ivana Mareković
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James Anthony O’connor
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Rebecca Gorton
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Jakko van Ingen
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An van den Bossche
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Dorothea Orth-Höller
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Juan-José Palacios-Gutiérrez
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Griselda Tudó
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Germán Bou
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Pieter-Jan Ceyssens
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Montserrat Garrigó
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Julià González-Martin
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Gilbert Greub
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Jaroslav Hrabak
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André Ingebretsen
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Marina Oviaño
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Begoña Palop
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Arthur B Pranada
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Lidia Quiroga
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Maria Jesús Ruiz-Serrano
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Belén Rodríguez-Sánchez
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Résumé

Abstract The ability of MALDI-TOF for the identification of nontuberculous mycobacteria (NTM) has improved recently thanks to updated databases and optimized protein extraction procedures. Few multicentre studies on the reproducibility of MALDI-TOF have been performed so far, none on mycobacteria. The aim of this study was to evaluate the reproducibility of MALDI-TOF for the identification of NTM in 15 laboratories in 9 European countries. A total of 98 NTM clinical isolates were grown on Löwenstein-Jensen. Biomass was collected in tubes with water and ethanol, anonymized and sent out to the 15 participating laboratories. Isolates were identified using MALDI Biotyper (Bruker Daltonics). Up to 1330 MALDI-TOF identifications were collected in the study. A score ≥ 1.6 was obtained for 100% of isolates in 5 laboratories (68.2–98.6% in the other). Species-level identification provided by MALDI-TOF was 100% correct in 8 centres and 100% correct to complex-level in 12 laboratories. In most cases, the misidentifications obtained were associated with closely related species. The variability observed for a few isolates could be due to variations in the protein extraction procedure or to MALDI-TOF system status in each centre. In conclusion, MALDI-TOF showed to be a highly reproducible method and suitable for its implementation for NTM identification.

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hal-04668732 , version 1 (07-08-2024)

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David Rodriguez-Temporal, Fernando Alcaide, Ivana Mareković, James Anthony O’connor, Rebecca Gorton, et al.. Multicentre study on the reproducibility of MALDI-TOF MS for nontuberculous mycobacteria identification. Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.1237. ⟨10.1038/s41598-022-05315-7⟩. ⟨hal-04668732⟩
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