Dans la série franc-comtoise, la dissolution des calcaires a organisé le drainage souterrain vers des sources importantes. La composition chimique des eaux est le reflet du fonctionnement hydrologique des systèmes. On observe quelques curiosités telles qu'estavelles, sources artésiennes, sources intermittentes. Douze secteurs géographiques répartis entre le Haut Jura et les plateaux de Haute-Saône sont décrits et parcourus par des itinéraires de visite.