Assessment of Mendelian and risk factor genes in Alzheimer disease: a prospective nationwide clinical utility study and recommendations for genetic screening - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Genetics in Medicine Année : 2024

Assessment of Mendelian and risk factor genes in Alzheimer disease: a prospective nationwide clinical utility study and recommendations for genetic screening

Gael Nicolas (1) , Aline Zarea (1) , Morgane Lacour (1) , Olivier Quenez (1) , Stephane Rousseau (1) , Anne-Claire Richard (1) , Antoine Bonnevalle (1) , Catherine Schramm (1) , Robert Olaso (2) , Florian Sandron (2) , Anne Boland (2) , Jean-Francois Deleuze (2) , Daniela Andriuta (3, 4) , Pierre Anthony , Sophie Auriacombe (5, 6) , Anna-Chloe Balageas , Guillaume Ballan , Melanie Barbay (4, 3) , Yannick Bejot (7) , Serge Belliard (7) , Marie Benaiteau (8) , Karim Bennys (9) , Stephanie Bombois (10) , Claire Boutoleau-Bretonniere (11) , Pierre Branger (12) , Jasmine Carlier (8) , Leslie Cartz-Piver (13) , Pascaline Cassagnaud (14) , Mathieu-Pierre Ceccaldi (15) , Valerie Chauvire (16) , Yaohua Chen (17) , Julien Cogez (18) , Emmanuel Cognat (2) , Fabienne Contegal-Callier , Lea Corneille , Philippe Couratier , Benjamin Cretin , Charlotte Crinquette , Benjamin Dauriat , Sophie Dautricourt , Vincent de la Sayette , Astrid de Liege , Didier Deffond , Florence Demurger , Vincent Deramecourt , Celine Derollez , Elsa Dionet , Martine Doco Fenzy , Julien Dumurgier , Anais Dutray , Frederique Etcharry-Bouyx , Maite Formaglio , Audrey Gabelle , Anne Gainche-Salmon , Olivier Godefroy (4, 3) , Mathilde Graber , Chloe Gregoire , Stephan Grimaldi , Julien Gueniat , Claude Gueriot , Virginie Guillet-Pichon , Sophie Haffen , Cezara-Roxana Hanta , Clemence Hardy , Geoffroy Hautecloque , Camille Heitz , Claire Hourregue , Therese Jonveaux , Snejana Jurici , Lejla Koric , Pierre Krolak-Salmon , Julien Lagarde (19) , Helene-Marie Lanoiselee , Brice Laurens , Isabelle Le Ber , Gwenael Le Guyader , Amelie Leblanc , Thibaud Lebouvier , Richard Levy , Anais Lippi , Marie-Anne Mackowiak , Eloi Magnin , Cecilia Marelli , Olivier Martinaud , Aurelien Maureille , Raffaella Migliaccio , Emilie Milongo-Rigal , Sophie Mohr , Helene Mollion , Alexandre Morin , Julia Nivelle , Camille Noiray (19) , Pauline Olivieri (19) , Claire Paquet , Jeremie Pariente (20, 8) , Florence Pasquier , Alexandre Perron , Nathalie Philippi , Vincent Planche (5) , Helene Pouclet-Courtemanche , Marie Rafiq (20, 8) , Adeline Rollin-Sillaire , Carole Roue-Jagot (19) , Dario Saracino , Marie Sarazin (19) , Mathilde Sauvee , Francois Sellal , Marc Teichmann , Christel Thauvin , Quentin Thomas , Camille Tisserand , Cedric Turpinat , Laurene van Damme , Olivier Vercruysse , Nicolas Villain , Nathalie Wagemann , Camille Charbonnier , David Wallon
Pierre Anthony
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Anna-Chloe Balageas
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Guillaume Ballan
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Claire Boutoleau-Bretonniere
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Fabienne Contegal-Callier
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Lea Corneille
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Philippe Couratier
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Benjamin Cretin
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Charlotte Crinquette
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Benjamin Dauriat
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Sophie Dautricourt
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Vincent de la Sayette
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Astrid de Liege
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Didier Deffond
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Florence Demurger
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Vincent Deramecourt
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Celine Derollez
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Elsa Dionet
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Martine Doco Fenzy
Julien Dumurgier
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Anais Dutray
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Frederique Etcharry-Bouyx
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Maite Formaglio
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Audrey Gabelle
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Anne Gainche-Salmon
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Mathilde Graber
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Chloe Gregoire
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Stephan Grimaldi
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Julien Gueniat
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Claude Gueriot
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Virginie Guillet-Pichon
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Sophie Haffen
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Cezara-Roxana Hanta
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Clemence Hardy
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Geoffroy Hautecloque
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Camille Heitz
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Claire Hourregue
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Therese Jonveaux
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Pierre Krolak-Salmon
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Helene-Marie Lanoiselee
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Brice Laurens
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Isabelle Le Ber
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Gwenael Le Guyader
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Thibaud Lebouvier
Richard Levy
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Camille Tisserand
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Cedric Turpinat
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Laurene van Damme
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Olivier Vercruysse
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Nicolas Villain
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Nathalie Wagemann
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Camille Charbonnier
David Wallon
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Résumé

Purpose: To assess the likely pathogenic/pathogenic (LP/P) variants rates in Mendelian dementia genes and the moderate-to-strong risk factors rates in patients with Alzheimer disease (AD). Methods: We included 700 patients in a prospective study and performed exome sequencing. A panel of 28 Mendelian and 6 risk-factor genes was interpreted and returned to patients. We built a framework for risk variant interpretation and risk gradation and assessed the detection rates among early-onset AD (EOAD, age of onset (AOO) ≤65 years, n = 608) depending on AOO and pedigree structure and late-onset AD (66 < AOO < 75, n = 92). Results: Twenty-one patients carried a LP/P variant in a Mendelian gene (all with EOAD, 3.4%), 20 of 21 affected APP, PSEN1, or PSEN2. LP/P variant detection rates in EOAD ranged from 1.7% to 11.6% based on AOO and pedigree structure. Risk factors were found in 69.5% of the remaining 679 patients, including 83 (12.2%) being heterozygotes for rare risk variants, in decreasing order of frequency, in TREM2, ABCA7, ATP8B4, SORL1, and ABCA1, including 5 heterozygotes for multiple rare risk variants, suggesting non-monogenic inheritance, even in some autosomal-dominant-like pedigrees. Conclusion: We suggest that genetic screening should be proposed to all EOAD patients and should no longer be prioritized based on pedigree structure.

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hal-04470892 , version 1 (21-02-2024)

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Citer

Gael Nicolas, Aline Zarea, Morgane Lacour, Olivier Quenez, Stephane Rousseau, et al.. Assessment of Mendelian and risk factor genes in Alzheimer disease: a prospective nationwide clinical utility study and recommendations for genetic screening. Genetics in Medicine, 2024, 26 (5), pp.101082. ⟨10.1016/j.gim.2024.101082⟩. ⟨hal-04470892⟩
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