L'historiographie religieuse régionale a longtemps dressé une ligne de partage entre une Alsace catholique et une Alsace protestante au singulier. Cette division étonne pour l'époque moderne quand on sait la pluralité des protestantismes. L'approche comparative entre les cas microhistoriques de Sainte-Marie-aux-Mines, de Bischwiller et du bailliage de Cleebourg veut questionner l'émergence d'une conscience ou d'une perception unitaire des protestants en Alsace dès les XVII^e et XVIII^e siècles. Le pluralisme confessionnel de ces trois espaces est représentatif de la complexité protestante dans la région. L'étude des relations et de la coexistence intraprotestante dans ces lieux souligne comment, malgré une proximité dogmatique, des frontières confessionnelles se dressent entre protestants. Si des ententes et des actions communes semblent émerger timidement dans la seconde moitié du XVIII^e siècle, elles restent circonstanciées en fonction de besoins ou pour la défense des droits confessionnels face aux catholiques. Ces ententes évoquent alors plus une reconnaissance mutuelle entre protestants qu'une fraternité ou une conscience d'unité. Cette dernière s'amorce davantage dans le regard extérieur des autorités sur les protestants d'Alsace à la fin du XVIII^e siècle, sans pour autant gommer les différences internes.