Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Science Année : 2018

Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome

Rudi Appels , Kellye Eversole , Nils Stein , Catherine Feuillet , Beat Keller , Jane Rogers , Curtis Pozniak , Frédéric Choulet , Assaf Distelfeld , Jesse Poland , Gil Ronen , Andrew Sharpe , Omer Barad , Kobi Baruch , Gabriel Keeble-Gagnère , Martin Mascher , Gil Ben-Zvi , Ambre-Aurore Josselin , Axel Himmelbach , François Balfourier , Juan Gutierrez-Gonzalez , Matthew Hayden , Chushin Koh , Gary Muehlbauer , Raj Pasam , Etienne Paux , Philippe Rigault , Josquin Tibbits , Vijay Tiwari , Manuel Spannagl , Daniel Lang , Heidrun Gundlach , Georg Haberer , Klaus Mayer , Danara Ormanbekova , Verena Prade , Hana Šimková , Thomas Wicker , David Swarbreck , Hélène Rimbert , Marius Felder , Nicolas Guilhot , Gemy Kaithakottil , Jens Keilwagen , Philippe Leroy , Thomas Lux , Sven Twardziok , Luca Venturini , Angéla Juhász , Michael Abrouk , Iris Fischer , Cristobal Uauy , Philippa Borrill , Ricardo Ramirez-Gonzalez , Dominique Arnaud , Smahane Chalabi , Boulos Chalhoub , Aron Cory , Raju Datla , Mark Davey , John Jacobs , Stephen Robinson , Burkhard Steuernagel , Fred van Ex , Brande Wulff , Moussa Benhamed , Abdelhafid Bendahmane , Lorenzo Concia , David Latrasse , Jan Bartoš , Arnaud Bellec , Hélène Berges , Jaroslav Doležel , Zeev Frenkel , Bikram Gill , Abraham Korol , Thomas Letellier , Odd-Arne Olsen , Kuldeep Singh , Miroslav Valárik , Edwin van der Vossen , Sonia Vautrin , Song Weining , Tzion Fahima , Vladimir Glikson , Dina Raats , Jarmila Číhalíková , Helena Toegelová , Jan Vrána , Pierre Sourdille , Benoit Darrier , Delfina Barabaschi , Luigi Cattivelli , Pilar Hernandez , Sergio Galvez , Hikmet Budak , Jonathan Jones , Kamil Witek , Guotai Yu , Ian Small , Joanna Melonek , Ruonan Zhou , Tatiana Belova , Kostya Kanyuka , Robert King , Kirby Nilsen , Sean Walkowiak , Richard Cuthbert , Ron Knox , Krysta Wiebe , Daoquan Xiang , Antje Rohde , Timothy Golds , Jana Čížková , Bala Ani Akpinar , Sezgi Biyiklioglu , Liangliang Gao , Amidou N’daiye , Marie Kubaláková , Jan Šafář , Françoise Alfama , Anne-Françoise Adam-Blondon , Raphael Flores , Claire Guerche , Mikaël Loaec , Hadi Quesneville , Janet Condie , Jennifer Ens , Ron Maclachlan , Yifang Tan , Adriana Alberti , Jean-Marc Aury , Valérie Barbe (1) , Arnaud Couloux , Corinne Cruaud , Karine Labadie , Sophie Mangenot , Patrick Wincker , Gaganpreet Kaur , Mingcheng Luo , Sunish Sehgal , Parveen Chhuneja , Om Prakash Gupta , Suruchi Jindal , Parampreet Kaur , Palvi Malik , Priti Sharma , Bharat Yadav , Nagendra Singh , Jitendra Khurana , Chanderkant Chaudhary , Paramjit Khurana , Vinod Kumar , Ajay Mahato , Saloni Mathur , Amitha Sevanthi , Naveen Sharma , Ram Sewak Tomar , Kateřina Holušová , Ondřej Plíhal , Matthew Clark , Darren Heavens , George Kettleborough , Jon Wright , Barbora Balcárková , Yuqin Hu , Elena Salina , Nikolai Ravin , Konstantin Skryabin , Alexey Beletsky , Vitaly Kadnikov , Andrey Mardanov , Michail Nesterov , Andrey Rakitin , Ekaterina Sergeeva , Hirokazu Handa , Hiroyuki Kanamori , Satoshi Katagiri , Fuminori Kobayashi , Shuhei Nasuda , Tsuyoshi Tanaka , Jianzhong Wu , Federica Cattonaro , Min Jiumeng , Karl Kugler , Matthias Pfeifer , Simen Sandve , Xu Xun , Bujie Zhan , Jacqueline Batley , Philipp Bayer , David Edwards , Satomi Hayashi , Zuzana Tulpová , Paul Visendi , Licao Cui , Xianghong Du , Kewei Feng , Xiaojun Nie , Wei Tong , Le Wang
Rudi Appels
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Kellye Eversole
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Nils Stein
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Catherine Feuillet
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Beat Keller
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Jane Rogers
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Curtis Pozniak
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Frédéric Choulet
Assaf Distelfeld
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Xianghong Du
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Kewei Feng
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Xiaojun Nie
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Wei Tong
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Le Wang
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Résumé

Insights from the annotated wheat genome Wheat is one of the major sources of food for much of the world. However, because bread wheat's genome is a large hybrid mix of three separate subgenomes, it has been difficult to produce a high-quality reference sequence. Using recent advances in sequencing, the International Wheat Genome Sequencing Consortium presents an annotated reference genome with a detailed analysis of gene content among subgenomes and the structural organization for all the chromosomes. Examples of quantitative trait mapping and CRISPR-based genome modification show the potential for using this genome in agricultural research and breeding. Ramírez-González et al. exploited the fruits of this endeavor to identify tissue-specific biased gene expression and coexpression networks during development and exposure to stress. These resources will accelerate our understanding of the genetic basis of bread wheat. Science , this issue p. eaar7191 ; see also p. eaar6089

Dates et versions

hal-04331004 , version 1 (08-12-2023)

Identifiants

Citer

Rudi Appels, Kellye Eversole, Nils Stein, Catherine Feuillet, Beat Keller, et al.. Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome. Science, 2018, 361 (6403), ⟨10.1126/science.aar7191⟩. ⟨hal-04331004⟩
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