Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Science Année : 2018

Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome

Rudi Appels , Kellye Eversole , Nils Stein , Catherine Feuillet , Beat Keller , Jane Rogers , Curtis Pozniak , Frédéric Choulet , Assaf Distelfeld , Jesse Poland , Gil Ronen , Andrew Sharpe , Omer Barad , Kobi Baruch , Gabriel Keeble-Gagnère , Martin Mascher , Gil Ben-Zvi , Ambre-Aurore Josselin , Axel Himmelbach , François Balfourier , Juan Gutierrez-Gonzalez , Matthew Hayden , Chushin Koh , Gary Muehlbauer , Raj Pasam , Etienne Paux , Philippe Rigault , Josquin Tibbits , Vijay Tiwari , Manuel Spannagl , Daniel Lang , Heidrun Gundlach , Georg Haberer , Klaus Mayer , Danara Ormanbekova , Verena Prade , Hana Šimková , Thomas Wicker , David Swarbreck , Hélène Rimbert , Marius Felder , Nicolas Guilhot , Gemy Kaithakottil , Jens Keilwagen , Philippe Leroy , Thomas Lux , Sven Twardziok , Luca Venturini , Angéla Juhász , Michael Abrouk , Iris Fischer , Cristobal Uauy , Philippa Borrill , Ricardo Ramirez-Gonzalez , Dominique Arnaud , Smahane Chalabi , Boulos Chalhoub , Aron Cory , Raju Datla , Mark Davey , John Jacobs , Stephen Robinson , Burkhard Steuernagel , Fred van Ex , Brande Wulff , Moussa Benhamed , Abdelhafid Bendahmane , Lorenzo Concia , David Latrasse , Jan Bartoš , Arnaud Bellec , Hélène Berges , Jaroslav Doležel , Zeev Frenkel , Bikram Gill , Abraham Korol , Thomas Letellier , Odd-Arne Olsen , Kuldeep Singh , Miroslav Valárik , Edwin van der Vossen , Sonia Vautrin , Song Weining , Tzion Fahima , Vladimir Glikson , Dina Raats , Jarmila Číhalíková , Helena Toegelová , Jan Vrána , Pierre Sourdille , Benoit Darrier , Delfina Barabaschi , Luigi Cattivelli , Pilar Hernandez , Sergio Galvez , Hikmet Budak , Jonathan Jones , Kamil Witek , Guotai Yu , Ian Small , Joanna Melonek , Ruonan Zhou , Tatiana Belova , Kostya Kanyuka , Robert King , Kirby Nilsen , Sean Walkowiak , Richard Cuthbert , Ron Knox , Krysta Wiebe , Daoquan Xiang , Antje Rohde , Timothy Golds , Jana Čížková , Bala Ani Akpinar , Sezgi Biyiklioglu , Liangliang Gao , Amidou N’daiye , Marie Kubaláková , Jan Šafář , Françoise Alfama , Anne-Françoise Adam-Blondon , Raphael Flores , Claire Guerche , Mikaël Loaec , Hadi Quesneville , Janet Condie , Jennifer Ens , Ron Maclachlan , Yifang Tan , Adriana Alberti , Jean-Marc Aury , Valérie Barbe (1) , Arnaud Couloux , Corinne Cruaud , Karine Labadie , Sophie Mangenot , Patrick Wincker , Gaganpreet Kaur , Mingcheng Luo , Sunish Sehgal , Parveen Chhuneja , Om Prakash Gupta , Suruchi Jindal , Parampreet Kaur , Palvi Malik , Priti Sharma , Bharat Yadav , Nagendra Singh , Jitendra Khurana , Chanderkant Chaudhary , Paramjit Khurana , Vinod Kumar , Ajay Mahato , Saloni Mathur , Amitha Sevanthi , Naveen Sharma , Ram Sewak Tomar , Kateřina Holušová , Ondřej Plíhal , Matthew Clark , Darren Heavens , George Kettleborough , Jon Wright , Barbora Balcárková , Yuqin Hu , Elena Salina , Nikolai Ravin , Konstantin Skryabin , Alexey Beletsky , Vitaly Kadnikov , Andrey Mardanov , Michail Nesterov , Andrey Rakitin , Ekaterina Sergeeva , Hirokazu Handa , Hiroyuki Kanamori , Satoshi Katagiri , Fuminori Kobayashi , Shuhei Nasuda , Tsuyoshi Tanaka , Jianzhong Wu , Federica Cattonaro , Min Jiumeng , Karl Kugler , Matthias Pfeifer , Simen Sandve , Xu Xun , Bujie Zhan , Jacqueline Batley , Philipp Bayer , David Edwards , Satomi Hayashi , Zuzana Tulpová , Paul Visendi , Licao Cui , Xianghong Du , Kewei Feng , Xiaojun Nie , Wei Tong , Le Wang
Rudi Appels
  • Fonction : Auteur
Kellye Eversole
  • Fonction : Auteur
Nils Stein
  • Fonction : Auteur
Catherine Feuillet
  • Fonction : Auteur
Beat Keller
  • Fonction : Auteur
Jane Rogers
  • Fonction : Auteur
Curtis Pozniak
  • Fonction : Auteur
Frédéric Choulet
Assaf Distelfeld
  • Fonction : Auteur
Jesse Poland
  • Fonction : Auteur
Gil Ronen
  • Fonction : Auteur
Andrew Sharpe
  • Fonction : Auteur
Omer Barad
  • Fonction : Auteur
Kobi Baruch
  • Fonction : Auteur
Gabriel Keeble-Gagnère
  • Fonction : Auteur
Martin Mascher
  • Fonction : Auteur
Gil Ben-Zvi
  • Fonction : Auteur
Ambre-Aurore Josselin
  • Fonction : Auteur
Axel Himmelbach
  • Fonction : Auteur
François Balfourier
  • Fonction : Auteur
Juan Gutierrez-Gonzalez
  • Fonction : Auteur
Matthew Hayden
  • Fonction : Auteur
Chushin Koh
  • Fonction : Auteur
Gary Muehlbauer
  • Fonction : Auteur
Raj Pasam
  • Fonction : Auteur
Etienne Paux
  • Fonction : Auteur
Philippe Rigault
  • Fonction : Auteur
Josquin Tibbits
  • Fonction : Auteur
Vijay Tiwari
  • Fonction : Auteur
Manuel Spannagl
  • Fonction : Auteur
Daniel Lang
  • Fonction : Auteur
Heidrun Gundlach
  • Fonction : Auteur
Georg Haberer
  • Fonction : Auteur
Klaus Mayer
  • Fonction : Auteur
Danara Ormanbekova
  • Fonction : Auteur
Verena Prade
  • Fonction : Auteur
Hana Šimková
  • Fonction : Auteur
Thomas Wicker
  • Fonction : Auteur
David Swarbreck
  • Fonction : Auteur
Hélène Rimbert
Marius Felder
  • Fonction : Auteur
Nicolas Guilhot
  • Fonction : Auteur
Gemy Kaithakottil
  • Fonction : Auteur
Jens Keilwagen
  • Fonction : Auteur
Philippe Leroy
  • Fonction : Auteur
Thomas Lux
  • Fonction : Auteur
Sven Twardziok
  • Fonction : Auteur
Luca Venturini
  • Fonction : Auteur
Angéla Juhász
  • Fonction : Auteur
Michael Abrouk
  • Fonction : Auteur
Iris Fischer
  • Fonction : Auteur
Cristobal Uauy
  • Fonction : Auteur
Philippa Borrill
  • Fonction : Auteur
Ricardo Ramirez-Gonzalez
  • Fonction : Auteur
Dominique Arnaud
  • Fonction : Auteur
Smahane Chalabi
Boulos Chalhoub
  • Fonction : Auteur
Aron Cory
  • Fonction : Auteur
Raju Datla
  • Fonction : Auteur
Mark Davey
  • Fonction : Auteur
John Jacobs
  • Fonction : Auteur
Stephen Robinson
  • Fonction : Auteur
Burkhard Steuernagel
  • Fonction : Auteur
Fred van Ex
  • Fonction : Auteur
Brande Wulff
  • Fonction : Auteur
Moussa Benhamed
Abdelhafid Bendahmane
Lorenzo Concia
David Latrasse
  • Fonction : Auteur
Jan Bartoš
  • Fonction : Auteur
Arnaud Bellec
Hélène Berges
Jaroslav Doležel
  • Fonction : Auteur
Zeev Frenkel
  • Fonction : Auteur
Bikram Gill
  • Fonction : Auteur
Abraham Korol
  • Fonction : Auteur
Thomas Letellier
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1203739
Odd-Arne Olsen
  • Fonction : Auteur
Kuldeep Singh
  • Fonction : Auteur
Miroslav Valárik
  • Fonction : Auteur
Edwin van der Vossen
  • Fonction : Auteur
Sonia Vautrin
Song Weining
  • Fonction : Auteur
Tzion Fahima
  • Fonction : Auteur
Vladimir Glikson
  • Fonction : Auteur
Dina Raats
  • Fonction : Auteur
Jarmila Číhalíková
  • Fonction : Auteur
Helena Toegelová
  • Fonction : Auteur
Jan Vrána
  • Fonction : Auteur
Pierre Sourdille
Benoit Darrier
  • Fonction : Auteur
Delfina Barabaschi
  • Fonction : Auteur
Luigi Cattivelli
  • Fonction : Auteur
Pilar Hernandez
  • Fonction : Auteur
Sergio Galvez
  • Fonction : Auteur
Hikmet Budak
  • Fonction : Auteur
Jonathan Jones
  • Fonction : Auteur
Kamil Witek
  • Fonction : Auteur
Guotai Yu
  • Fonction : Auteur
Ian Small
  • Fonction : Auteur
Joanna Melonek
  • Fonction : Auteur
Ruonan Zhou
  • Fonction : Auteur
Tatiana Belova
  • Fonction : Auteur
Kostya Kanyuka
  • Fonction : Auteur
Robert King
  • Fonction : Auteur
Kirby Nilsen
  • Fonction : Auteur
Sean Walkowiak
  • Fonction : Auteur
Richard Cuthbert
  • Fonction : Auteur
Ron Knox
  • Fonction : Auteur
Krysta Wiebe
  • Fonction : Auteur
Daoquan Xiang
  • Fonction : Auteur
Antje Rohde
  • Fonction : Auteur
Timothy Golds
  • Fonction : Auteur
Jana Čížková
  • Fonction : Auteur
Bala Ani Akpinar
  • Fonction : Auteur
Sezgi Biyiklioglu
  • Fonction : Auteur
Liangliang Gao
  • Fonction : Auteur
Amidou N’daiye
  • Fonction : Auteur
Marie Kubaláková
  • Fonction : Auteur
Jan Šafář
  • Fonction : Auteur
Françoise Alfama
  • Fonction : Auteur
Anne-Françoise Adam-Blondon
Raphael Flores
Claire Guerche
  • Fonction : Auteur
Mikaël Loaec
  • Fonction : Auteur
Hadi Quesneville
Janet Condie
  • Fonction : Auteur
Jennifer Ens
  • Fonction : Auteur
Ron Maclachlan
  • Fonction : Auteur
Yifang Tan
  • Fonction : Auteur
Adriana Alberti
Jean-Marc Aury
Arnaud Couloux
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 908635
Corinne Cruaud
Karine Labadie
Sophie Mangenot
  • Fonction : Auteur
Patrick Wincker
Gaganpreet Kaur
  • Fonction : Auteur
Mingcheng Luo
  • Fonction : Auteur
Sunish Sehgal
  • Fonction : Auteur
Parveen Chhuneja
  • Fonction : Auteur
Om Prakash Gupta
  • Fonction : Auteur
Suruchi Jindal
  • Fonction : Auteur
Parampreet Kaur
  • Fonction : Auteur
Palvi Malik
  • Fonction : Auteur
Priti Sharma
  • Fonction : Auteur
Bharat Yadav
  • Fonction : Auteur
Nagendra Singh
  • Fonction : Auteur
Jitendra Khurana
  • Fonction : Auteur
Chanderkant Chaudhary
  • Fonction : Auteur
Paramjit Khurana
  • Fonction : Auteur
Vinod Kumar
  • Fonction : Auteur
Ajay Mahato
  • Fonction : Auteur
Saloni Mathur
  • Fonction : Auteur
Amitha Sevanthi
  • Fonction : Auteur
Naveen Sharma
  • Fonction : Auteur
Ram Sewak Tomar
  • Fonction : Auteur
Kateřina Holušová
  • Fonction : Auteur
Ondřej Plíhal
  • Fonction : Auteur
Matthew Clark
  • Fonction : Auteur
Darren Heavens
  • Fonction : Auteur
George Kettleborough
  • Fonction : Auteur
Jon Wright
  • Fonction : Auteur
Barbora Balcárková
  • Fonction : Auteur
Yuqin Hu
  • Fonction : Auteur
Elena Salina
  • Fonction : Auteur
Nikolai Ravin
  • Fonction : Auteur
Konstantin Skryabin
  • Fonction : Auteur
Alexey Beletsky
  • Fonction : Auteur
Vitaly Kadnikov
  • Fonction : Auteur
Andrey Mardanov
  • Fonction : Auteur
Michail Nesterov
  • Fonction : Auteur
Andrey Rakitin
  • Fonction : Auteur
Ekaterina Sergeeva
  • Fonction : Auteur
Hirokazu Handa
  • Fonction : Auteur
Hiroyuki Kanamori
  • Fonction : Auteur
Satoshi Katagiri
  • Fonction : Auteur
Fuminori Kobayashi
  • Fonction : Auteur
Shuhei Nasuda
  • Fonction : Auteur
Tsuyoshi Tanaka
  • Fonction : Auteur
Jianzhong Wu
  • Fonction : Auteur
Federica Cattonaro
  • Fonction : Auteur
Min Jiumeng
  • Fonction : Auteur
Karl Kugler
  • Fonction : Auteur
Matthias Pfeifer
  • Fonction : Auteur
Simen Sandve
  • Fonction : Auteur
Xu Xun
  • Fonction : Auteur
Bujie Zhan
  • Fonction : Auteur
Jacqueline Batley
  • Fonction : Auteur
Philipp Bayer
  • Fonction : Auteur
David Edwards
  • Fonction : Auteur
Satomi Hayashi
  • Fonction : Auteur
Zuzana Tulpová
  • Fonction : Auteur
Paul Visendi
  • Fonction : Auteur
Licao Cui
  • Fonction : Auteur
Xianghong Du
  • Fonction : Auteur
Kewei Feng
  • Fonction : Auteur
Xiaojun Nie
  • Fonction : Auteur
Wei Tong
  • Fonction : Auteur
Le Wang
  • Fonction : Auteur

Résumé

Insights from the annotated wheat genome Wheat is one of the major sources of food for much of the world. However, because bread wheat's genome is a large hybrid mix of three separate subgenomes, it has been difficult to produce a high-quality reference sequence. Using recent advances in sequencing, the International Wheat Genome Sequencing Consortium presents an annotated reference genome with a detailed analysis of gene content among subgenomes and the structural organization for all the chromosomes. Examples of quantitative trait mapping and CRISPR-based genome modification show the potential for using this genome in agricultural research and breeding. Ramírez-González et al. exploited the fruits of this endeavor to identify tissue-specific biased gene expression and coexpression networks during development and exposure to stress. These resources will accelerate our understanding of the genetic basis of bread wheat. Science , this issue p. eaar7191 ; see also p. eaar6089

Dates et versions

hal-04331004 , version 1 (08-12-2023)

Identifiants

Citer

Rudi Appels, Kellye Eversole, Nils Stein, Catherine Feuillet, Beat Keller, et al.. Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome. Science, 2018, 361 (6403), ⟨10.1126/science.aar7191⟩. ⟨hal-04331004⟩
35 Consultations
0 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Mastodon Facebook X LinkedIn More