A brief history of visualizing membrane systems in molecular dynamics simulations
Brève histoire de la visualisation des systèmes membranaires dans les simulations de dynamique moléculaire
Résumé
Understanding lipid dynamics and function, from the level of single, isolated molecules to large assemblies, is more than ever an intensive area of research. The interactions of lipids with other molecules, particularly membrane proteins, are now extensively studied. With advances in the development of force fields for molecular dynamics simulations (MD) and increases in computational resources, the creation of realistic and complex membrane systems is now common. In this perspective, we will review four decades of the history of molecular dynamics simulations applied to membranes and lipids through the prism of molecular graphics.
Comprendre la dynamique et la fonction des lipides, du niveau de molécules isolées simples aux grands assemblages, est plus que jamais un domaine de recherche intensif. Les interactions des lipides avec d'autres molécules, en particulier les protéines membranaires, sont maintenant largement étudiées. Avec les progrès dans le développement de champs de force pour les simulations de dynamique moléculaire (MD) et l'augmentation des ressources de calcul, la création de systèmes membranaires réalistes et complexes est maintenant courante. Dans cette perspective, nous passerons en revue quatre décennies de l'histoire des simulations de dynamique moléculaire appliquées aux membranes et aux lipides à travers le prisme des graphiques moléculaires.
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