Facilitating CG Simulations with MAD: The MArtini Database Server - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Journal of Chemical Information and Modeling Année : 2023

Facilitating CG Simulations with MAD: The MArtini Database Server

Cécile Hilpert
  • Fonction : Auteur
Louis Beranger
  • Fonction : Auteur
Petteri A Vainikka
  • Fonction : Auteur
Vincent Nieto
  • Fonction : Auteur
Siewert J Marrink
  • Fonction : Auteur
Luca Monticelli
  • Fonction : Auteur
Guillaume Launay
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1118543

Résumé

The MArtini Database (MAD-www.mad.ibcp.fr) is a web server designed for the sharing structures and topologies of molecules parameterized with the Martini coarsegrained (CG) force field. MAD can also convert atomistic structures into CG structures and prepare complex systems (including proteins, lipids etc.) for molecular dynamics (MD) simulations at the CG level. It is dedicated to the generation of input files for Martini 3, the most recent version of this popular CG force field. Specifically, the
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2022.08.03.502585v2.full.pdf (2.86 Mo) Télécharger le fichier
Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-04296717 , version 1 (20-11-2023)

Identifiants

Citer

Cécile Hilpert, Louis Beranger, Paulo C T Souza, Petteri A Vainikka, Vincent Nieto, et al.. Facilitating CG Simulations with MAD: The MArtini Database Server. Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, 63 (3), pp.702-710. ⟨10.1021/acs.jcim.2c01375⟩. ⟨hal-04296717⟩
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