FANCM missense variants and breast cancer risk: a case-control association study of 75,156 European women
Gisella Figlioli
,
Amandine Billaud
,
Thomas U. Ahearn
,
Natalia Nikolaevna Antonenkova
,
Heiko Becher
,
Matthias Wilhelm Beckmann
,
Sabine Behrens
,
Javier J. Benitez
,
Marina A. Bermisheva
,
Marinus J. Blok
,
Natalia Valerijevna Bogdanova
,
Bernardo Bonanni
,
Barbara Burwinkel
,
Nicola Jane Camp
,
Archie I. Campbell
,
Jose Esteban Castelao
,
Melissa H. Cessna
,
Stephen J. Chanock
,
Kamila Czene
,
Peter P. Devilee
,
Thilo Dörk
,
Christoph Engel
,
Mikael Eriksson
,
Peter Andreas Fasching
,
Jonine D. Figueroa
,
Marike Gabrielson
,
Manuela Gago-Dominguez
,
Montserrat García-Closas
,
Anna González-Neira
,
Felix Grassmann
,
Pascal Guénel
(1)
,
Melanie Gündert
,
Andreas Hadjisavvas
,
Eric T. Hahnen
,
Per F.L. Hall
,
Ute Hamann
,
Patricia A. Harrington
,
Wei He
,
Peter A. Hillemanns
,
Antoinette Hollestelle
,
Maartje Joanneke Hooning
,
Reiner Hoppe
,
Anthony H. Howell
,
Keith Humphreys
,
Agnes Jager
,
Anna Jakubowska
,
Ehl'Za Kh Khusnutdinova
,
Yon Dschun Ko
,
Vessela N. Kristensen
,
Annika Lindblom
,
Jolanta Lissowska
,
Jan A. Lubiński
,
Arto Msci Mannermaa
,
Siranoush Manoukian
,
Sara J. Margolin
,
Dimitris A. Mavroudis
,
William G. Newman
,
Nadia Obi
,
Mihalis I. Panayiotidis
,
Muhammad Usman Rashid
,
Valerie Rhenius
,
Matti A. Rookus
,
Emmanouil Saloustros
,
Elinor J. Sawyer
,
Rita Katharina Schmutzler
,
Mitul N. Shah
,
Reijo K. Sironen
,
Melissa Caroline Southey
,
Maija T. Suvanto
,
Rob A.E.M. Tollenaar
,
Ian P.M. Tomlinson
,
Thérèse Truong
(1)
,
Lizet E. van der Kolk
,
Elke Maria van Veen
,
Barbara Wappenschmidt
,
Xiaohong Rose Yang
,
Manjeet K. Bolla
,
Joe G. Dennis
,
Alison M. Dunning
,
Douglas F. Easton
,
Michael J. Lush
,
Kyriaki Michailidou
,
Paul D.P. Pharoah
,
Qin Wang
,
Muriel A. Adank
,
Marjanka K. Schmidt
,
Irene L. Andrulis
,
Jenny C. Chang-Claude
,
Heli A. Nevanlinna
,
Georgia Chenevix-Trench
,
D. Gareth R. Evans
,
Roger L. Milne
,
Paolo Radice
,
Paolo Peterlongo
Gisella Figlioli
- Fonction : Auteur
Amandine Billaud
- Fonction : Auteur
Thomas U. Ahearn
- Fonction : Auteur
Natalia Nikolaevna Antonenkova
- Fonction : Auteur
Heiko Becher
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Matthias Wilhelm Beckmann
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Sabine Behrens
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Javier J. Benitez
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Marina A. Bermisheva
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Marinus J. Blok
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Natalia Valerijevna Bogdanova
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Bernardo Bonanni
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Barbara Burwinkel
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Nicola Jane Camp
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Jose Esteban Castelao
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Melissa H. Cessna
- Fonction : Auteur
Stephen J. Chanock
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Kamila Czene
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Peter P. Devilee
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Thilo Dörk
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Christoph Engel
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Mikael Eriksson
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Peter Andreas Fasching
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Jonine D. Figueroa
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Marike Gabrielson
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Manuela Gago-Dominguez
- Fonction : Auteur
Montserrat García-Closas
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Anna González-Neira
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Felix Grassmann
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Pascal Guénel
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Melanie Gündert
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Andreas Hadjisavvas
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Eric T. Hahnen
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Per F.L. Hall
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Ute Hamann
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Patricia A. Harrington
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Wei He
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Peter A. Hillemanns
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Antoinette Hollestelle
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Maartje Joanneke Hooning
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Reiner Hoppe
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Anthony H. Howell
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Keith Humphreys
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Agnes Jager
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Anna Jakubowska
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Ehl'Za Kh Khusnutdinova
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Yon Dschun Ko
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Vessela N. Kristensen
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Annika Lindblom
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Jolanta Lissowska
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Jan A. Lubiński
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Arto Msci Mannermaa
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Siranoush Manoukian
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Sara J. Margolin
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Dimitris A. Mavroudis
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William G. Newman
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Nadia Obi
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Mihalis I. Panayiotidis
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Muhammad Usman Rashid
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Valerie Rhenius
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Matti A. Rookus
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Emmanouil Saloustros
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Elinor J. Sawyer
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Rita Katharina Schmutzler
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Mitul N. Shah
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Reijo K. Sironen
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Melissa Caroline Southey
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Maija T. Suvanto
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Lizet E. van der Kolk
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Elke Maria van Veen
- Fonction : Auteur
Barbara Wappenschmidt
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Xiaohong Rose Yang
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Manjeet K. Bolla
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Joe G. Dennis
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Alison M. Dunning
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Douglas F. Easton
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Michael J. Lush
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Kyriaki Michailidou
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Paul D.P. Pharoah
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Qin Wang
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Muriel A. Adank
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Marjanka K. Schmidt
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Irene L. Andrulis
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Jenny C. Chang-Claude
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Heli A. Nevanlinna
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Georgia Chenevix-Trench
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D. Gareth R. Evans
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Roger L. Milne
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Paolo Radice
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Paolo Peterlongo
- Fonction : Auteur
Résumé
Evidence from literature, including the BRIDGES study, indicates that germline protein truncating variants (PTVs) in FANCM confer moderately increased risk of ER-negative and triple-negative breast cancer (TNBC), especially for women with a family history of the disease. Association between FANCM missense variants (MVs) and breast cancer risk has been postulated. In this study, we further used the BRIDGES study to test 689 FANCM MVs for association with breast cancer risk, overall and in ER-negative and TNBC subtypes, in 39,885 cases (7566 selected for family history) and 35,271 controls of European ancestry. Sixteen common MVs were tested individually; the remaining rare 673 MVs were tested by burden analyses considering their position and pathogenicity score. We also conducted a meta-analysis of our results and those from published studies. We did not find evidence for association for any of the 16 variants individually tested. The rare MVs were significantly associated with increased risk of ER-negative breast cancer by burden analysis comparing familial cases to controls (OR = 1.48; 95% CI 1.07-2.04; P = 0.017). Higher ORs were found for the subgroup of MVs located in functional domains or predicted to be pathogenic. The meta-analysis indicated that FANCM MVs overall are associated with breast cancer risk (OR = 1.22; 95% CI 1.08-1.38; P = 0.002). Our results support the definition from previous analyses of FANCM as a moderate-risk breast cancer gene and provide evidence that FANCM MVs could be low/moderate risk factors for ER-negative and TNBC subtypes. Further genetic and functional analyses are necessary to clarify better the increased risks due to FANCM MVs.
Domaines
Sciences du Vivant [q-bio]Format du dépôt | Fichier |
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Type de dépôt | Article dans une revue |
Titre |
en
FANCM missense variants and breast cancer risk: a case-control association study of 75,156 European women
|
Résumé |
en
Evidence from literature, including the BRIDGES study, indicates that germline protein truncating variants (PTVs) in FANCM confer moderately increased risk of ER-negative and triple-negative breast cancer (TNBC), especially for women with a family history of the disease. Association between FANCM missense variants (MVs) and breast cancer risk has been postulated. In this study, we further used the BRIDGES study to test 689 FANCM MVs for association with breast cancer risk, overall and in ER-negative and TNBC subtypes, in 39,885 cases (7566 selected for family history) and 35,271 controls of European ancestry. Sixteen common MVs were tested individually; the remaining rare 673 MVs were tested by burden analyses considering their position and pathogenicity score. We also conducted a meta-analysis of our results and those from published studies. We did not find evidence for association for any of the 16 variants individually tested. The rare MVs were significantly associated with increased risk of ER-negative breast cancer by burden analysis comparing familial cases to controls (OR = 1.48; 95% CI 1.07-2.04; P = 0.017). Higher ORs were found for the subgroup of MVs located in functional domains or predicted to be pathogenic. The meta-analysis indicated that FANCM MVs overall are associated with breast cancer risk (OR = 1.22; 95% CI 1.08-1.38; P = 0.002). Our results support the definition from previous analyses of FANCM as a moderate-risk breast cancer gene and provide evidence that FANCM MVs could be low/moderate risk factors for ER-negative and TNBC subtypes. Further genetic and functional analyses are necessary to clarify better the increased risks due to FANCM MVs.
|
Auteur(s) |
Gisella Figlioli
, Amandine Billaud
, Thomas U. Ahearn
, Natalia Nikolaevna Antonenkova
, Heiko Becher
, Matthias Wilhelm Beckmann
, Sabine Behrens
, Javier J. Benitez
, Marina A. Bermisheva
, Marinus J. Blok
, Natalia Valerijevna Bogdanova
, Bernardo Bonanni
, Barbara Burwinkel
, Nicola Jane Camp
, Archie I. Campbell
, Jose Esteban Castelao
, Melissa H. Cessna
, Stephen J. Chanock
, Kamila Czene
, Peter P. Devilee
, Thilo Dörk
, Christoph Engel
, Mikael Eriksson
, Peter Andreas Fasching
, Jonine D. Figueroa
, Marike Gabrielson
, Manuela Gago-Dominguez
, Montserrat García-Closas
, Anna González-Neira
, Felix Grassmann
, Pascal Guénel
1
, Melanie Gündert
, Andreas Hadjisavvas
, Eric T. Hahnen
, Per F.L. Hall
, Ute Hamann
, Patricia A. Harrington
, Wei He
, Peter A. Hillemanns
, Antoinette Hollestelle
, Maartje Joanneke Hooning
, Reiner Hoppe
, Anthony H. Howell
, Keith Humphreys
, Agnes Jager
, Anna Jakubowska
, Ehl'Za Kh Khusnutdinova
, Yon Dschun Ko
, Vessela N. Kristensen
, Annika Lindblom
, Jolanta Lissowska
, Jan A. Lubiński
, Arto Msci Mannermaa
, Siranoush Manoukian
, Sara J. Margolin
, Dimitris A. Mavroudis
, William G. Newman
, Nadia Obi
, Mihalis I. Panayiotidis
, Muhammad Usman Rashid
, Valerie Rhenius
, Matti A. Rookus
, Emmanouil Saloustros
, Elinor J. Sawyer
, Rita Katharina Schmutzler
, Mitul N. Shah
, Reijo K. Sironen
, Melissa Caroline Southey
, Maija T. Suvanto
, Rob A.E.M. Tollenaar
, Ian P.M. Tomlinson
, Thérèse Truong
1
, Lizet E. van der Kolk
, Elke Maria van Veen
, Barbara Wappenschmidt
, Xiaohong Rose Yang
, Manjeet K. Bolla
, Joe G. Dennis
, Alison M. Dunning
, Douglas F. Easton
, Michael J. Lush
, Kyriaki Michailidou
, Paul D.P. Pharoah
, Qin Wang
, Muriel A. Adank
, Marjanka K. Schmidt
, Irene L. Andrulis
, Jenny C. Chang-Claude
, Heli A. Nevanlinna
, Georgia Chenevix-Trench
, D. Gareth R. Evans
, Roger L. Milne
, Paolo Radice
, Paolo Peterlongo
1
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- France
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Langue du document |
Anglais
|
Nom de la revue |
|
Numéro |
5
|
Volume |
31
|
Page/Identifiant |
578-587
|
Date de publication |
2023
|
Audience |
Internationale
|
Vulgarisation |
Non
|
Comité de lecture |
Oui
|
Domaine(s) |
|
DOI | 10.1038/s41431-022-01257-w |
Pubmed Id | 36707629 |
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