A genome-wide gene-environment interaction study of breast cancer risk for women of European ancestry - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Breast Cancer Research Année : 2023

A genome-wide gene-environment interaction study of breast cancer risk for women of European ancestry

Pooja Middha , Xiaoliang Wang , Sabine Behrens , Manjeet K. Bolla , Qin Wang , Joe G. Dennis , Kyriaki Michailidou , Thomas U. Ahearn , Irene L.L. Andrulis , Hoda Anton-Culver , Volker Arndt , Kristan J. Aronson , Paul Livermore Auer , Annelie Augustinsson , Thaïs Baert , Laura E.Beane Freeman , Heiko Becher , Matthias Wilhelm Beckmann , Javier J. Benitez , Stig Egil Bojesen , Hiltrud B. Brauch , Hermann Brenner , Angela R. Brooks-Wilson , Daniele Campa , Federico Canzian , Ángel M. Carracedo , Jose Esteban Castelao , Stephen J. Chanock , Georgia Chenevix-Trench , Emilie Cordina-Duverger (1) , Fergus J. Couch , Angela Cox , Simon S. Cross , Kamila Czene , Laure Dossus (2) , Pierre Antoine Dugué , Adriana Heather Eliassen , Mikael Eriksson , D. Gareth R. Evans , Peter Andreas Fasching , Jonine D. Figueroa , Olivia Fletcher , Henrik Lavlund Flyger , Marike Gabrielson , Manuela Gago-Dominguez , Graham G. Giles , Anna González-Neira , Felix Grassmann , Anne L. Grundy , Pascal Guénel (1) , Christopher A. Haiman , Niclas N. Håkansson , Per F.L. Hall , Ute Hamann , Susan E. Hankinson , Elaine F. Harkness , Bernd Holleczek , Reiner Hoppe , John Llewelyn Hopper , Richard S. Houlston , Anthony H. Howell , David John Hunter , Christian I. Ingvar , Karolin Isaksson , Helena C.B. Jernström , Esther M. John , Michael E. Jones , Rudolf J. Kaaks , Renske Keeman , Cari Meinhold Kitahara , Yon Dschun Ko , Stella Koutros , Allison W. Kurian , James Vincent Lacey , Diether Lambrechts , Nicole L. Larson , Susanna C. Larsson , Loïc Le Marchand , Flavio Lejbkowicz , Shuai Li , Martha S. Linet , Jolanta Lissowska , María Elena Peña Martinez , Tabea Maurer , Anna Marie Mulligan , Claire Mulot (3) , Rachel A. Murphy , William G. Newman , Sune Fallgaard Nielsen , Börge Grønne Nordestgaard , Aaron D. Norman , Katie M. O’brien , Janet E. Olson , Alpa V. Patel , Ross L. Prentice , Erika Rees-Punia , Gad Rennert , Valerie Rhenius , Kathryn Jean Ruddy , Dale P. Sandler , Christopher G. Scott , Mitul N. Shah , Xiaoou Shu , Ann Smeets , Melissa Caroline Southey , Jennifer L. Stone , Rulla M. Tamimi , Jack A. Taylor , Lauren R. Teras , Katarzyna Tomczyk , Melissa A. Troester , Thérèse Truong (1) , Celine M. Vachon , Sophia S. Wang , Clarice R. Weinberg , Hans P.M.W. Wildiers , Walter Churchill Willett , Stacey J. Winham , Alicja Wolk , Xiaohong Rose Yang , Pilar Pilar Zamora , Wei Zheng , Argyrios Ziogas , Alison M. Dunning , Paul D.P. Pharoah , Montserrat García-Closas , Marjanka K. Schmidt , Peter P. Kraft , Roger L. Milne , Sara Lindström , Adamo P. Easton , Jenny C. Chang-Claude
Pooja Middha
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Xiaoliang Wang
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Sabine Behrens
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Manjeet K. Bolla
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Qin Wang
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Joe G. Dennis
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Kyriaki Michailidou
Thomas U. Ahearn
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Irene L.L. Andrulis
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Hoda Anton-Culver
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Volker Arndt
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Kristan J. Aronson
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Annelie Augustinsson
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Heiko Becher
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Javier J. Benitez
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Hiltrud B. Brauch
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Hermann Brenner
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Angela R. Brooks-Wilson
Daniele Campa
Federico Canzian
Ángel M. Carracedo
Jose Esteban Castelao
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Christopher A. Haiman
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Sara Lindström
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Adamo P. Easton
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Jenny C. Chang-Claude
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Résumé

Background: Genome-wide studies of gene–environment interactions (G×E) may identify variants associated with disease risk in conjunction with lifestyle/environmental exposures. We conducted a genome-wide G×E analysis of ~ 7.6 million common variants and seven lifestyle/environmental risk factors for breast cancer risk overall and for estrogen receptor positive (ER +) breast cancer. Methods: Analyses were conducted using 72,285 breast cancer cases and 80,354 controls of European ancestry from the Breast Cancer Association Consortium. Gene–environment interactions were evaluated using standard unconditional logistic regression models and likelihood ratio tests for breast cancer risk overall and for ER + breast cancer. Bayesian False Discovery Probability was employed to assess the noteworthiness of each SNP-risk factor pairs. Results: Assuming a 1 × 10–5 prior probability of a true association for each SNP-risk factor pairs and a Bayesian False Discovery Probability < 15%, we identified two independent SNP-risk factor pairs: rs80018847(9p13)-LINGO2 and adult height in association with overall breast cancer risk (ORint = 0.94, 95% CI 0.92–0.96), and rs4770552(13q12)-SPATA13 and age at menarche for ER + breast cancer risk (ORint = 0.91, 95% CI 0.88–0.94). Conclusions: Overall, the contribution of G×E interactions to the heritability of breast cancer is very small. At the population level, multiplicative G×E interactions do not make an important contribution to risk prediction in breast cancer.

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Pooja Middha, Xiaoliang Wang, Sabine Behrens, Manjeet K. Bolla, Qin Wang, et al.. A genome-wide gene-environment interaction study of breast cancer risk for women of European ancestry. Breast Cancer Research, 2023, 25 (1), ⟨10.1186/s13058-023-01691-8⟩. ⟨hal-04190856⟩
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