Le tractus respiratoire de l'Homme est colonisé par des micro-organismes qui composent le microbiote respiratoire. Ce microbiote possède un rôle majeur de protection de l'hôte contre la survenue d'infections microbiennes. La dynamique de ce microbiote est régie par la respiration et le système immunitaire. Un déséquilibre de ces communautés microbiennes semble impliqué dans la survenue de pathologies respiratoires comme l'asthme. Cette pathologie qui touche environ 25% des nourrissons, se caractérise par des profils cliniques et biologiques variés et sa physiopathologie suggère une atteinte de microbiote, associée à une inflammation. L'objectif du projet Microbiosthme est de déterminer la composition globale du microbiome respiratoire de nourrissons atteints d'asthme sévère, de suivre son évolution au cours du temps et d'évaluer l'implication du système immunitaire. La cohorte sera composée de 100 patients suivis aux CHU de Rouen et Caen, dont les prélèvements permettront de caractériser les microbiomes respiratoires via une approche métatranscriptomique. La potentielle contribution de l'activation immunitaire sera également évaluée. Les résultats de ce projet original permettront d'envisager une meilleure prise en charge des patients et la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques. Le projet original que constitue « Microbiosthme » permettra d'établir la nature des potentielles dysbioses, l'interrelation des différents microbiomes du tractus respiratoire et le potentiel rôle du système immunitaire dans la pathogénèse de l'asthme sévère chez les nourrissons. L'exploration et la compréhension de ces données ayant pour objectif une meilleure prise en charge à terme des patients et la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques.