La recherche historique est toujours confrontée à l'incertitude en raison de l'incomplétude de notre connaissance du passé. Il est pourtant important de distinguer deux types d'incertitude: l'incertitude historique qui concerne les faits du passé et l'incertitude historiographique qui concerne l'interprétation de ces faits. En histoire numérique, les deux types représentent des défis majeurs pour la construction de modèles computationnels, car les cadres de modélisation computationnels actuels ne sont pas bien adaptés à l'incertitude habituellement rencontrée dans la recherche historique. Nous argumentons que la gestion de l'incertitude historiographique, étroitement liée aux récits historiques et aux modèles causaux, est indispensable pour la construction de modèles historiographiques computationnels.