LinkRbrain : Multi-scale data integrator of the brain - Archive ouverte HAL
Logiciel Année : 2021

LinkRbrain : Multi-scale data integrator of the brain

LinkRbrain : Intégrateur multi-échelle des données sur le cerveau

Résumé

LinkRbrain is an open-access web platform designed for the integration, documentation, prediction, and visualization of data and literature related to the human brain. It amalgamates cognitive, pathological, transcriptomic, structural, and anatomical knowledge of brain functions. The LinkRbrain platform is accessible to the entire community through an open website, with a basic version available at www.LinkRbrain.org and a premium version at www.cpp.linkrbrain.org. In the premium version, we have processed 14,000 scientific papers and transcriptomic data of 21,000 genes from the Allen Brain Institute (ABI). The platform (1) aggregates information from multiple databases and (2) integrates these multi-scale data into a common framework, allowing each brain region to be characterized by a cognitive profile, a transcriptomic profile, and a neuroanatomical marker. LinkRbrain provides brain mapping and relational graphs by leveraging current knowledge available in databases on brain activity, transcriptomics, and cognitive functions.
LinkRbrain est une plateforme web en libre accès conçue pour l'intégration, la documentation, la prédiction et la visualisation des données et de la littérature liées au cerveau humain. Elle amalgame les connaissances cognitives, pathologiques, transcriptomiques, structurelles et anatomiques des fonctions cérébrales. La plateforme LinkRbrain est accessible à toute la communauté via un site web ouvert, avec une version de base disponible sur www.LinkRbrain.org et une version premium sur www.cpp.linkrbrain.org. Dans la version premium, nous avons traité 14 000 articles scientifiques et les données transcriptomiques de 21 000 gènes de l'Allen Brain Institute (ABI). La plateforme (1) agrège des informations provenant de plusieurs bases de données et (2) intègre ces données multi-échelles dans un cadre commun, permettant ainsi de caractériser chaque région du cerveau par un profil cognitif, un profil transcriptomique et un marqueur neuroanatomique. LinkRbrain fournit une cartographie du cerveau et des graphiques relationnels en exploitant les connaissances actuelles disponibles dans les bases de données sur l'activité cérébrale, la transcriptomique et les fonctions cognitives.
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