Palaeogenomics of Upper Palaeolithic to Neolithic European hunter-gatherers - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Nature Année : 2023

Palaeogenomics of Upper Palaeolithic to Neolithic European hunter-gatherers

Cosimo Posth (1, 2) , He Yu (2, 3) , Ayshin Ghalichi (2) , Hélène Rougier (2, 4) , Isabelle Crevecoeur (5) , Yilei Huang (2) , Harald Ringbauer (2) , Adam B Rohrlach (2, 6) , Kathrin Nägele (2) , Vanessa Villalba-Mouco (2, 7) , Rita Radzeviciute (2, 8) , Tiago Ferraz (2) , Alexander Stoessel (2, 9) , Rezeda Tukhbatova (2, 10) , Dorothée G Drucker (1) , Martina Lari (11) , Alessandra Modi (11) , Stefania Vai (11) , Tina Saupe (12) , Christiana L Scheib (12, 13) , Giulio Catalano (14) , Luca Pagani (12, 15) , Sahra Talamo (16, 2) , Helen Fewlass (2) , Laurent Klaric (17) , André Morala (5) , Mathieu Rué (18, 19) , Stéphane Madelaine (5) , Laurent Crépin (20) , Jean-Baptiste Caverne (21) , Emmy Bocaege (22) , Stefano Ricci (23) , Francesco Boschin (23) , Priscilla Bayle (5) , Bruno Maureille (5) , Foni Le Brun-Ricalens (24) , Jean-Guillaume Bordes (5) , Gregorio Oxilia (16) , Eugenio Bortolini (16, 25) , Olivier Bignon-Lau (17) , Grégory Debout (17) , Michel Orliac (17) , Antoine Zazzo (26) , Vitale Sparacello (27) , Elisabetta Starnini (28) , Luca Sineo (14) , Johannes van der Plicht (29) , Laure Pecqueur (30, 21) , Gildas Merceron (31) , Géraldine Garcia (31) , Jean-Michel Leuvrey , Coralie Bay Garcia , Asier Gómez-Olivencia (32, 33) , Marta Połtowicz-Bobak (34) , Dariusz Bobak , Mona Le Luyer (35, 36, 5) , Paul Storm (29) , Claudia Hoffmann , Jacek Kabaciński (37) , Tatiana Filimonova , Svetlana Shnaider (38) , Natalia Berezina (39) , Borja González-Rabanal (40) , Manuel R González Morales (41) , Ana B Marín-Arroyo (40) , Belén López (42) , Carmen Alonso-Llamazares (42) , Annamaria Ronchitelli (23) , Caroline Polet (43) , Ivan Jadin (43) , Nicolas Cauwe , Joaquim Soler (44) , Neus Coromina (44) , Isaac Rufí (44) , Richard Cottiaux (45) , Geoffrey Clark (46) , Lawrence G Straus (47) , Marie-Anne Julien (20) , Silvia Renhart , Dorothea Talaa , Stefano Benazzi (16) , Matteo Romandini (16, 48) , Luc Amkreutz (49) , Hervé Bocherens (1) , Christoph Wißing (1) , Sébastien Villotte (30, 43, 50) , Javier Fernández-López de Pablo (51) , Magdalena Gómez-Puche (51) , Marco Aurelio Esquembre-Bebia , Pierre Bodu (17) , Liesbeth Smits (52) , Bénédicte Souffi (17, 53) , Rimantas Jankauskas (51) , Justina Kozakaitė (51) , Christophe Cupillard (54, 55) , Hartmut Benthien , Kurt Wehrberger , Ralf W Schmitz , Susanne C Feine (1) , Tim Schüler , Corinne Thevenet (45) , Dan Grigorescu (56) , Friedrich Lüth (57) , Andreas Kotula , Henny Piezonka (58) , Franz Schopper , Jiří Svoboda (59) , Sandra Sázelová (59) , Andrey Chizhevsky (60) , Aleksandr Khokhlov (61) , Nicholas J Conard (1) , Frédérique Valentin (17) , Katerina Harvati (1, 1) , Patrick Semal (43) , Bettina Jungklaus , Alexander Suvorov (62, 61) , Rick Schulting (63) , Vyacheslav Moiseyev (61) , Kristiina Mannermaa (64) , Alexandra Buzhilova (39) , Thomas Terberger (65) , David Caramelli (11) , Eveline Altena (66) , Wolfgang Haak (2) , Johannes Krause (2)
1 Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
2 Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
3 Peking University [Beijing]
4 CSUN - California State University [Northridge]
5 PACEA - De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
6 University of South Australia [Adelaide]
7 Universidad de Zaragoza = University of Zaragoza [Saragossa University] = Université de Saragosse
8 MPI-SHH - Max Planck Institute for the Science of Human History
9 Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany]
10 KFU - Kazan Federal University
11 UniFI - Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence
12 University of Tartu
13 CAM - University of Cambridge [UK]
14 Università degli studi di Palermo - University of Palermo
15 Unipd - Università degli Studi di Padova = University of Padua
16 UNIBO - Alma Mater Studiorum Università di Bologna = University of Bologna
17 TEMPS - Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
18 Paléotime
19 ASM - Archéologie des Sociétés Méditerranéennes
20 HNHP - Histoire naturelle de l'Homme préhistorique
21 Inrap - Institut national de recherches archéologiques préventives
22 University of Kent [Canterbury]
23 UNISI - Università degli Studi di Siena = University of Siena
24 INRA - Institut national de recherches archéologiques
25 CSIC - Centro de Investigaciones Biológicas
26 AASPE - Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements
27 UniCa - Università degli Studi di Cagliari = University of Cagliari
28 UniPi - University of Pisa [Italy] = Università di Pisa [Italia] = Université de Pise [Italie]
29 University of Groningen [Groningen]
30 EA - Éco-Anthropologie
31 Palevoprim [Poitiers] - Laboratoire de paléontologie, évolution, paléoécosystèmes, paléoprimatologie [UMR 7262]
32 UPV / EHU - Universidad del País Vasco [Espainia] / Euskal Herriko Unibertsitatea [España] = University of the Basque Country [Spain] = Université du pays basque [Espagne]
33 CNM - Centro Nacional de Microbiología [ISCIII, Madrid, Spain]
34 University of Rzeszow
35 Massachusetts General Hospital [Boston]
36 HMS - Harvard Medical School [Boston]
37 PAN - Polska Akademia Nauk = Polish Academy of Sciences = Académie polonaise des sciences
38 SB RAS - Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences
39 MSU - Université d'État Lomonossov de Moscou = Lomonosov Moscow State University
40 UC / UniCan - Universidad de Cantabria [Santander] = University of Cantabria [Spain] = Université de Cantabrie [Espagne]
41 IIIPC - Instituto Internacional de Investigaciones Prehistóricas de Cantrabria [Santander]
42 Universidad de Oviedo = University of Oviedo
43 IRSNB / RBINS - Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique = Royal Belgian Institute of Natural Sciences
44 UdG - Universitat de Girona = University of Girona
45 Trajectoires - UMR 8215
46 ASU - Arizona State University [Tempe]
47 The University of New Mexico [Albuquerque]
48 UniFE - Università degli Studi di Ferrara = University of Ferrara
49 Universiteit Leiden = Leiden University
50 Université de Liège
51 Vilnius University [Vilnius]
52 UvA - University of Amsterdam [Amsterdam] = Universiteit van Amsterdam
53 Inrap, Croissy-Beaubourg - Institut national de recherches archéologiques préventives - Centre de recherches archéologiques de Croissy-Beaubourg
54 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
55 SRA BFC - Service régional de l'archéologie - Bourgogne-Franche-Comté
56 UniBuc - University of Bucharest
57 DAI - German Archaeological Institute
58 CAU - Christian-Albrechts-Universität zu Kiel = Christian-Albrechts University of Kiel = Université Christian-Albrechts de Kiel
59 CAS - Czech Academy of Sciences [Prague]
60 Kazan Scientific Centre of the Russian Academy of Sciences
61 RAS - Russian Academy of Science
62 RAS - the Russian Academy of Sciences [Moscow, Russia]
63 School of Archaeology [Oxford]
64 Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki
65 Georg-August-University = Georg-August-Universität Göttingen
66 LUMC - Leiden University Medical Center
Cosimo Posth
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
He Yu
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Peking University [Beijing]
Ayshin Ghalichi
  • Fonction : Auteur
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Hélène Rougier
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
California State University [Northridge]
Isabelle Crevecoeur
  • Fonction : Auteur
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
Yilei Huang
  • Fonction : Auteur
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Harald Ringbauer
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Adam B Rohrlach
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
University of South Australia [Adelaide]
Kathrin Nägele
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Vanessa Villalba-Mouco
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Universidad de Zaragoza = University of Zaragoza [Saragossa University] = Université de Saragosse
Rita Radzeviciute
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Max Planck Institute for the Science of Human History
Tiago Ferraz
  • Fonction : Auteur
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Alexander Stoessel
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany]
Rezeda Tukhbatova
  • Fonction : Auteur
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Kazan Federal University
Dorothée G Drucker
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Martina Lari
Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence
Alessandra Modi
Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence
Stefania Vai
Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence
Tina Saupe
  • Fonction : Auteur
University of Tartu
Christiana L Scheib
University of Tartu
University of Cambridge [UK]
Giulio Catalano
  • Fonction : Auteur
Università degli studi di Palermo - University of Palermo
Luca Pagani
  • Fonction : Auteur
University of Tartu
Università degli Studi di Padova = University of Padua
Sahra Talamo
  • Fonction : Auteur
Alma Mater Studiorum Università di Bologna = University of Bologna
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Helen Fewlass
  • Fonction : Auteur
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Laurent Klaric
Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
André Morala
  • Fonction : Auteur
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
Mathieu Rué
Paléotime
Archéologie des Sociétés Méditerranéennes
CV
Stéphane Madelaine
  • Fonction : Auteur
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
Laurent Crépin
  • Fonction : Auteur
Histoire naturelle de l'Homme préhistorique
Jean-Baptiste Caverne
  • Fonction : Auteur
Institut national de recherches archéologiques préventives
Emmy Bocaege
  • Fonction : Auteur
University of Kent [Canterbury]
Stefano Ricci
  • Fonction : Auteur
Università degli Studi di Siena = University of Siena
Francesco Boschin
Università degli Studi di Siena = University of Siena
Priscilla Bayle
  • Fonction : Auteur
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
Bruno Maureille
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
Foni Le Brun-Ricalens
  • Fonction : Auteur
Institut national de recherches archéologiques
Jean-Guillaume Bordes
  • Fonction : Auteur
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
Gregorio Oxilia
  • Fonction : Auteur
Alma Mater Studiorum Università di Bologna = University of Bologna
Eugenio Bortolini
Alma Mater Studiorum Università di Bologna = University of Bologna
Centro de Investigaciones Biológicas
Olivier Bignon-Lau
Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
CV
Grégory Debout
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1346106
  • IdRef : 184277116
Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
Michel Orliac
  • Fonction : Auteur
Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
Antoine Zazzo
  • Fonction : Auteur
Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements
Vitale Sparacello
  • Fonction : Auteur
Università degli Studi di Cagliari = University of Cagliari
Elisabetta Starnini
University of Pisa [Italy] = Università di Pisa [Italia] = Université de Pise [Italie]
Luca Sineo
Università degli studi di Palermo - University of Palermo
Johannes van der Plicht
  • Fonction : Auteur
University of Groningen [Groningen]
Laure Pecqueur
Éco-Anthropologie
Institut national de recherches archéologiques préventives
Gildas Merceron
Laboratoire de paléontologie, évolution, paléoécosystèmes, paléoprimatologie [UMR 7262]
CV
Géraldine Garcia
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 846895
  • IdRef : 174101953
Laboratoire de paléontologie, évolution, paléoécosystèmes, paléoprimatologie [UMR 7262]
Jean-Michel Leuvrey
  • Fonction : Auteur
Coralie Bay Garcia
  • Fonction : Auteur
Asier Gómez-Olivencia
  • Fonction : Auteur
Universidad del País Vasco [Espainia] / Euskal Herriko Unibertsitatea [España] = University of the Basque Country [Spain] = Université du pays basque [Espagne]
Centro Nacional de Microbiología [ISCIII, Madrid, Spain]
Marta Połtowicz-Bobak
University of Rzeszow
Dariusz Bobak
Mona Le Luyer
Massachusetts General Hospital [Boston]
Harvard Medical School [Boston]
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
Paul Storm
  • Fonction : Auteur
University of Groningen [Groningen]
Claudia Hoffmann
  • Fonction : Auteur
Jacek Kabaciński
Polska Akademia Nauk = Polish Academy of Sciences = Académie polonaise des sciences
Tatiana Filimonova
  • Fonction : Auteur
Svetlana Shnaider
  • Fonction : Auteur
Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences
Natalia Berezina
Université d'État Lomonossov de Moscou = Lomonosov Moscow State University
Borja González-Rabanal
Universidad de Cantabria [Santander] = University of Cantabria [Spain] = Université de Cantabrie [Espagne]
Manuel R González Morales
  • Fonction : Auteur
Instituto Internacional de Investigaciones Prehistóricas de Cantrabria [Santander]
Ana B Marín-Arroyo
  • Fonction : Auteur
Universidad de Cantabria [Santander] = University of Cantabria [Spain] = Université de Cantabrie [Espagne]
Belén López
  • Fonction : Auteur
Universidad de Oviedo = University of Oviedo
Carmen Alonso-Llamazares
  • Fonction : Auteur
Universidad de Oviedo = University of Oviedo
Annamaria Ronchitelli
  • Fonction : Auteur
Università degli Studi di Siena = University of Siena
Caroline Polet
  • Fonction : Auteur
Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique = Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Ivan Jadin
  • Fonction : Auteur
Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique = Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Nicolas Cauwe
  • Fonction : Auteur
Joaquim Soler
  • Fonction : Auteur
Universitat de Girona = University of Girona
Neus Coromina
  • Fonction : Auteur
Universitat de Girona = University of Girona
Isaac Rufí
  • Fonction : Auteur
Universitat de Girona = University of Girona
Richard Cottiaux
Trajectoires - UMR 8215
CV
Geoffrey Clark
  • Fonction : Auteur
Arizona State University [Tempe]
Lawrence G Straus
  • Fonction : Auteur
The University of New Mexico [Albuquerque]
Marie-Anne Julien
  • Fonction : Auteur
Histoire naturelle de l'Homme préhistorique
Silvia Renhart
  • Fonction : Auteur
Dorothea Talaa
  • Fonction : Auteur
Stefano Benazzi
Alma Mater Studiorum Università di Bologna = University of Bologna
Matteo Romandini
  • Fonction : Auteur
Alma Mater Studiorum Università di Bologna = University of Bologna
Università degli Studi di Ferrara = University of Ferrara
Luc Amkreutz
Universiteit Leiden = Leiden University
Hervé Bocherens
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Christoph Wißing
  • Fonction : Auteur
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Sébastien Villotte
Éco-Anthropologie
Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique = Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Université de Liège
CV
Javier Fernández-López de Pablo
  • Fonction : Auteur
Vilnius University [Vilnius]
Magdalena Gómez-Puche
  • Fonction : Auteur
Vilnius University [Vilnius]
Marco Aurelio Esquembre-Bebia
  • Fonction : Auteur
Pierre Bodu
Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
CV
Liesbeth Smits
  • Fonction : Auteur
University of Amsterdam [Amsterdam] = Universiteit van Amsterdam
Bénédicte Souffi
Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
Institut national de recherches archéologiques préventives - Centre de recherches archéologiques de Croissy-Beaubourg
Rimantas Jankauskas
Vilnius University [Vilnius]
Justina Kozakaitė
  • Fonction : Auteur
Vilnius University [Vilnius]
Christophe Cupillard
Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
Service régional de l'archéologie - Bourgogne-Franche-Comté
Hartmut Benthien
  • Fonction : Auteur
Kurt Wehrberger
  • Fonction : Auteur
Ralf W Schmitz
  • Fonction : Auteur
Susanne C Feine
  • Fonction : Auteur
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Tim Schüler
  • Fonction : Auteur
Corinne Thevenet
  • Fonction : Auteur
Trajectoires - UMR 8215
Dan Grigorescu
  • Fonction : Auteur
University of Bucharest
Friedrich Lüth
  • Fonction : Auteur
German Archaeological Institute
Andreas Kotula
  • Fonction : Auteur
Henny Piezonka
  • Fonction : Auteur
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel = Christian-Albrechts University of Kiel = Université Christian-Albrechts de Kiel
Franz Schopper
  • Fonction : Auteur
Jiří Svoboda
  • Fonction : Auteur
Czech Academy of Sciences [Prague]
Sandra Sázelová
  • Fonction : Auteur
Czech Academy of Sciences [Prague]
Andrey Chizhevsky
  • Fonction : Auteur
Kazan Scientific Centre of the Russian Academy of Sciences
Aleksandr Khokhlov
  • Fonction : Auteur
Russian Academy of Science
Nicholas J Conard
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Frédérique Valentin
Technologie et Ethnologie des Mondes Préhistoriques
CV
Katerina Harvati
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen
Patrick Semal
  • Fonction : Auteur
Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique = Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Bettina Jungklaus
  • Fonction : Auteur
Alexander Suvorov
  • Fonction : Auteur
the Russian Academy of Sciences [Moscow, Russia]
Russian Academy of Science
Rick Schulting
School of Archaeology [Oxford]
Vyacheslav Moiseyev
  • Fonction : Auteur
Russian Academy of Science
Kristiina Mannermaa
Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki
Alexandra Buzhilova
Université d'État Lomonossov de Moscou = Lomonosov Moscow State University
Thomas Terberger
  • Fonction : Auteur
Georg-August-University = Georg-August-Universität Göttingen
David Caramelli
Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence
Eveline Altena
Leiden University Medical Center
Wolfgang Haak
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]
Johannes Krause
Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig]

Résumé

Modern humans have populated Europe for more than 45,000 years 1,2 . Our knowledge of the genetic relatedness and structure of ancient hunter-gatherers is however limited, owing to the scarceness and poor molecular preservation of human remains from that period 3 . Here we analyse 356 ancient hunter-gatherer genomes, including new genomic data for 116 individuals from 14 countries in western and central Eurasia, spanning between 35,000 and 5,000 years ago. We identify a genetic ancestry profile in individuals associated with Upper Palaeolithic Gravettian assemblages from western Europe that is distinct from contemporaneous groups related to this archaeological culture in central and southern Europe 4 , but resembles that of preceding individuals associated with the Aurignacian culture. This ancestry profile survived during the Last Glacial Maximum (25,000 to 19,000 years ago) in human populations from southwestern Europe associated with the Solutrean culture, and with the following Magdalenian culture that re-expanded northeastward after the Last Glacial Maximum. Conversely, we reveal a genetic turnover in southern Europe suggesting a local replacement of human groups around the time of the Last Glacial Maximum, accompanied by a north-to-south dispersal of populations associated with the Epigravettian culture. From at least 14,000 years ago, an ancestry related to this culture spread from the south across the rest of Europe, largely replacing the Magdalenian-associated gene pool. After a period of limited admixture that spanned the beginning of the Mesolithic, we find genetic interactions between western and eastern European hunter-gatherers, who were also characterized by marked differences in phenotypically relevant variants.

Domaines

Anthropologie biologique Génétique humaine Génétique des populations [q-bio.PE]
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Soumis le : mercredi 11 octobre 2023-11:20:04

Dernière modification le : vendredi 22 novembre 2024-15:44:02

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hal-04106022 , version 1 (11-10-2023)

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Citer

Cosimo Posth, He Yu, Ayshin Ghalichi, Hélène Rougier, Isabelle Crevecoeur, et al.. Palaeogenomics of Upper Palaeolithic to Neolithic European hunter-gatherers. Nature, 2023, 615 (7950), pp.117-126. ⟨10.1038/s41586-023-05726-0⟩. ⟨hal-04106022⟩

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