Rediscovery of Bipalium admarginatum de Beauchamp, 1933 (Platyhelminthes, Tricladida, Geoplanidae) in Malaysia, with molecular characterisation including the mitogenome - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Zootaxa Année : 2023

Rediscovery of Bipalium admarginatum de Beauchamp, 1933 (Platyhelminthes, Tricladida, Geoplanidae) in Malaysia, with molecular characterisation including the mitogenome

Penemuan semula Bipalium admarginatum de Beauchamp, 1933 (Platyhelminthes, Tricladida, Geoplanidae) di Malaysia dengan percirian molekular yang merangkumi mitogenome.

Oi Yoon Michelle Soo
Romain Gastineau
George Verdon
  • Fonction : Auteur
Leigh Winsor

Résumé

We present here the first observation of Bipalium admarginatum de Beauchamp, 1933 since its original description 90 years ago. Three specimens were found on Perhentian Kecil Island, off Terengganu State, Malaysia and photographed in the field, and two were collected. This report thus includes the first colour photographs published for this species, from a locality close to the type-locality, Tioman Island (which is ca. 200 km south of the locality in this study, on the east coast of Peninsula Malaysia). We describe the external morphology and colour pattern of the species, which correspond well to the original description, itself based only on two preserved specimens. We performed an in-depth molecular characterisation of the species, including its complete mitochondrial genome, the 18S sequence and elongation 1-alpha (EF1-α) sequence. In addition, EF1-α sequences were also retrieved for 5 additional geoplanid species. No tRNA-Thr could be detected in the mitogenome of B. admarginatum, a lack already reported in several species of geoplanids, but we found a 13 bp sequence that contains the anticodon loop and seems to be conserved among geoplanids and might thus possibly represent a non-canonical undetected tRNA. We discuss the difficulties encountered in trying to reconstruct the cluster of nuclear ribosomal genes, a problem already mentioned for other Triclads. Three phylogenies, based respectively on all mitochondrial proteins, 18S, and EF1-α, were computed; the position of B. admarginatum within the Bipaliinae was confirmed in each tree, as sister-group to various bipaliine species according to the sequences available for each tree. In the mitochondrial proteins tree, which had high support, B. admarginatum was sister to Bipalium kewense and Diversibipalium multilineatum.
Kajian ini membentangkan pemerhatian pertama Bipalium admarginatum de Beauchamp, 1933 sejak penerbitan asal dari 90 tahun lalu. Tiga spesimen telah dirakam di Pulau Perhentian Kecil, Terengganu, Malaysia, dan dari tiga spesimen ini, dua telah dikumpul untuk kajian selanjutnya. Penemuan ini memaparkan gambar berwarna pertama yang diterbitkan untuk spesies ini yang asalnya telah dijumpai di Pulau Tioman, lokaliti ‘type’ B. admarginatum di Malaysia. Morfologi luaran dan corak warna spesies telah dihuraikan dan pemerhatian ini adalah sepadan dengan spesies dari penerbitan asal, berdasarkan dua spesimen yang telah dikumpul dalam kajian ini. Kami turut menjalankan pencirian molekul bagi spesies, termasuk genom mitokondria lengkap, jujukan 18S dan pemanjangan ‘1 alpha’. Selain itu, jujukan EF1-α juga telah dikumpulkan untuk 5 spesies geoplanid tambahan. Tiada tRNA-Thr yang dikesan dalam mitogenome B. admarginatum yang sebelum ini telah dilaporkan dalam penerbitan beberapa spesies geoplanid. Kami mendapati jujukan 13 bp mengandungi gelung anti-kodon yang nampaknya dipelihara di kalangan geoplanid dan mungkin mewakili tRNA bukan kanonik yang tidak dapat dikesan. Kami turut membincangkan kesukaran yang dihadapi dalam percubaan membina semula kelompok gen ribosom nuklear dan ini adalah satu masalah yang telah diperhatikan di kalangan ‘Triclad’ lain. Tiga filogeni, yang masing-masing berdasarkan semua protein mitokondria, 18S, dan EF1-α, telah dihasilkan. Kedudukan B. admarginatum dalam Famili Bipaliinae telah disahkan dalam setiap pokok filogeni, sebagai kumpulan saudara kepada spesies bipaliine berlainan mengikut jujukan terdahulu untuk setiap pokok filogenetik. Dalam pokok filogeni protein mitokondria yang mempunyai sokongan yang kukuh, B. admarginatum menunjukkan hubungan filogenetik yang dekat dengan B. kewense dan Diversibipalium multilineatum.
Fichier principal
Vignette du fichier
Soo et al. - Bipalium admarginatum Zootaxa2023.pdf (4.45 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Publication financée par une institution

Dates et versions

hal-04087948 , version 1 (03-05-2023)

Licence

Paternité

Identifiants

Citer

Oi Yoon Michelle Soo, Romain Gastineau, George Verdon, Leigh Winsor, Jean-Lou Justine. Rediscovery of Bipalium admarginatum de Beauchamp, 1933 (Platyhelminthes, Tricladida, Geoplanidae) in Malaysia, with molecular characterisation including the mitogenome. Zootaxa, 2023, 5277 (3), pp.585-599. ⟨10.11646/ZOOTAXA.5277.3.11⟩. ⟨hal-04087948⟩
50 Consultations
33 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More