Utilisation du traitement automatique du langage pour le calcul et le suivi d'indicateurs de qualité de la prise en charge du cancer du sein
Résumé
Introduction
L'obtention des certifications qualité impose le recueil d'indicateurs de qualité et de sécurité des soins (IQSS) définis par des groupes d'experts. Notre objectif est de déterminer comment les algorithmes de traitement automatique des langues (TAL) peuvent complémenter les données médico-administratives (PMSI) pour automatiser le calcul des IQSS.
Méthodes
Nous avons identifié dans l'entrepôt de données de santé de l'AP-HP les patientes nouvellement adressées pour un cancer du sein entre 01/2019 et 06/2021. Le PMSI et les comptes-rendus (CR) ont été identifiés en vue du calcul des IQSS publiés par l'Institut national du cancer (INCa) et l’« European Society of Breast Cancer Specialist » (EUSOMA). Différents jeux de données ont été annotés par un oncologue pour développer et valider des algorithmes de TAL basés sur des règles et concernant: le stade pTNM post-opératoire des tumeurs réséquées et le stade métastatique au bilan d'extension initial à partir des CR de pet-scanner (examen de référence dans cette indication).
Résultats
Des 5807 patientes (60,9 ans IQR [50,0-71,9]) suivies jusqu'en 02/2022, 5452 (93,9 %) ont des actes thérapeutiques liés au cancer du sein dans le PMSI dont 3787 (65,2 %) ont au moins une chirurgie, 4991 (85,9 %) ont des CR d'anatomopathologie (CRA) et 4349 (78,1 %) ont des CR de réunions de concertation pluridisciplinaire (RCP). Le score pTNM post-opératoire et le stade métastatique ont pu être extraits pour 2139 et 811 patientes, respectivement. Des 14 IQSS de l'INCa calculés avec les données PMSI seules, 5 concernent des soins possiblement ambulatoires et pourraient être extraites par TAL à partir de CR de RCP. Des 34 IQSS de l'EUSOMA, 11 sont calculables avec les données médico-administratives seules, 7 le deviennent en utilisant les codes ADICAP, les données immunohistochimiques, le stade et la taille de la tumeur, et 3 avec les dates de diagnostic et de traitements (analyse des CR RCP).
Discussion/Conclusion
Le TAL permet d'augmenter le nombre d'indicateurs calculables, comparé au PMSI seul.