La présente recherche, s'articule autour de pratiques enseignantes au sein du projet interdisciplinaire de Sciences du collège Pailleron (Paris, France). La particularité étudiée est la mise en place par des enseignants de technologie, de PC, de SVT de séances dans toutes les disciplines de sciences (SVT, PC, technologie...) auprès d'élèves de 6ème, de niveaux très hétérogènes. Une phase préliminaire d’entretiens a permis de déceler les difficultés que les enseignants rencontrent dans la réalisation de ces séances. Ils indiquent être démunis face à un vocabulaire parfois technique, aux liens établis entre les activités ou les notions lorsque la séance a été élaborée par un enseignant d’une autre discipline. Cette étude a permis de comprendre le fonctionnement de ce projet, de recenser les outils élaborés, d'aborder les difficultés rencontrées. Nous avons pu observer et analyser des difficultés dans la caractérisation des savoirs au sein d’une séance de SVT à travers l’utilisation du cadre théorique PCK (Pedagogical Content of Knowledge et de la TACD (Théorie de l’Action Conjointe en Didactique). L’analyse de ces données servant à modéliser des outils efficients permettant de pallier à ces difficultés.