Penetrance estimation of Alzheimer disease in SORL1 loss-of-function variant carriers using a family-based strategy and stratification by APOE genotypes
Catherine Schramm
(1, 2)
,
Camille Charbonnier
(1)
,
Aline Zaréa
(3)
,
Morgane Lacour
(4)
,
David Wallon
(3)
,
Daniela Andriuta
(5, 6, 7)
,
Pierre Anthony
,
Sophie Auriacombe
(8)
,
Anna-Chloé Balageas
(9)
,
Guillaume Ballan
(10)
,
Mélanie Barbay
(5, 6, 7)
,
Emilie Beaufils
(9)
,
Yannick Béjot
(11, 12, 13, 14, 15, 16, 17)
,
Serge Belliard
(18)
,
Marie Benaiteau
(19)
,
Karim Bennys
(20)
,
Frédéric Blanc
(21, 22, 23)
,
Stéphanie Bombois
(24)
,
Claire Boutoleau Bretonnière
(25)
,
Pierre Branger
(26)
,
Jasmine Carlier
(4)
,
Leslie Cartz-Piver
(27)
,
Pascaline Cassagnaud
,
Giovanni Castelnovo
,
Christine Champion
,
Annabelle Chaussenot
,
Mathieu Ceccaldi
,
Valérie Chauviré
,
Yaohua Chen
,
Julien Cogez
,
Emmanuel Cognat
,
Fabienne Contegal-Callier
,
Lea Corneille
,
Philippe Couratier
,
Hélène Courtemanche
,
Benjamin Cretin
,
Charlotte Crinquette
,
Bernard Croisille
,
Benjamin Dauriat
,
Sophie Dautricourt
,
Vincent de la Sayette
,
Astrid de Liège
,
Marie de Verdal
,
Didier Deffond
,
Emmanuelle Génin
(28)
,
Benoit Delpont
,
Florence Demurger
,
Vincent Deramecourt
,
Céline Derollez
,
Mira Didic
,
Giulia Diemert
,
Elsa Dionet
,
Philippe Diraison
,
Aude Doan
,
Martine Doco Fenzy
,
Boris Dufournet
,
Julien Dumurgier
,
Hélène Durand
,
Anaïs Dutray
,
Frédérique Etcharry-Bouyx
,
Maïté Formaglio
,
Audrey Gabelle
,
Anne Gainche-Salmon
,
Jean-Claude Getenet
,
Emmanuelle Ginglinger
,
Olivier Godefroy
(5, 6, 7)
,
Mathilde Graber
,
Chloé Gregoire
,
Stephan Grimaldi
,
Julien Gueniat
,
Claude Gueriot
,
Sophie Haffen
,
Lorraine Hamelin
,
Didier Hannequin
,
Cezara Hanta
,
Clémence Hardy
,
Geoffroy Hautecloque
,
Camille Heitz
,
Claire Hourregue
,
Thérèse Jonveaux
,
Snejana Jurici
,
Catia Khoumri
,
Lejla Koric
,
Pierre Krolak-Salmon
,
Pierre Labauge
,
Morgane Lacour
,
Julien Lagarde
,
Hélène-Marie Lanoiselée
,
Brice Laurens
,
Isabelle Le Ber
,
Gwenaël Le Guyader
,
Amélie Leblanc
,
Thibaud Lebouvier
,
Anaïs Lippi
,
Marie-Anne Mackowiak
,
Eloi Magnin
,
Cecilia Marelli
,
Olivier Martinaud
,
Aurélien Maureille
,
Emilie Milongo-Rigal
,
Sophie Mohr
,
Hélène Mollion
,
Olivier Moreaud
,
Alexandre Morin
,
Gaël Nicolas
,
Julia Nivelle
,
Camille Noiray
,
Elisabeth Ollagnon-Roman
,
Claire Paquet
,
Jérémie Pariente
,
Florence Pasquier
,
Alexandre Perron
,
Nathalie Philippi
,
Virginie Pichon
,
Vincent Planche
,
Céline Poirsier
,
Marie Rafiq
,
Pauline Rod-Olivieri
,
Adeline Rollin-Sillaire
,
Carole Roué-Jagot
,
Dario Saracino
,
Marie Sarazin
,
Mathilde Sauvée
,
François Sellal
,
Lila Sirven Villaros
,
Christel Thauvin
,
Camille Tisserand
,
Christophe Tomasino
,
Cédric Turpinat
,
Laurène van Damme
,
Olivier Vercruysse
,
Alice Voilly
,
Nathalie Wagemann
,
David Wallon
,
Aline Zarea
,
Anne Boland
,
Jean-François Deleuze
,
Robert Olaso
,
Shahzad Ahmad
,
Philippe Amouyel
,
Claudine Berr
,
Anne Boland
,
Paola Bossu
,
Femke Bouwman
,
Jose Bras
,
Dominique Campion
,
Camille Charbonnier
,
Jordi Clarimon
,
Antonio Daniele
,
Jean-François Dartigues
,
Stéphanie Debette
,
Jean-François Deleuze
,
Nicola Denning
,
Oriol Dols-Icardo
,
Nick Fox
,
Daniela Galimberti
,
Hans Gille
,
Benjamin Grenier-Boley
,
Detelina Grozeva
,
Rita Guerreiro
,
John Hardy
,
Clive Holmes
,
Henne Holstege
,
Marc Hulsman
,
Holger Hummerich
,
M. Arfan Ikram
,
M. Kamran Ikram
,
Iris Jansen
,
Amit Kawalia
,
Robert Kraaij
,
Jean-Charles Lambert
,
Marc Lathrop
,
Afina Lemstra
,
Alberto Lleo
,
Lauren Luckcuck
,
Marcel Mannens
,
Rachel Marshall
,
Carlo Masullo
,
Simon Mead
,
Patrizia Mecocci
,
Alun Meggy
,
Merel Mol
,
Kevin Morgan
,
Benedetta Nacmias
,
Gaël Nicolas
,
Penny Norsworthy
,
Florence Pasquier
,
Pau Pastor
,
Olivier Quenez
,
Alfredo Ramirez
,
Rachel Raybould
,
Richard Redon
,
Marcel Reinders
,
Anne-Claire Richard
,
Steffi Riedel-Heller
,
Fernando Rivadeneira
,
Stéphane Rousseau
,
Natalie Ryan
,
Salha Saad
,
Pascual Sanchez-Juan
,
Philip Scheltens
,
Jonathan Schott
,
Davide Seripa
,
Daoud Sie
,
Rebecca Sims
,
Erik Sistermans
,
Sandro Sorbi
,
Resie van Spaendonk
,
Gianfranco Spalleta
,
Nicćolo Tesi
,
Betty Tijms
,
André Uitterlinden
,
Wiesje van der Flier
,
Sven van der Lee
,
Cornelia van Duijn
,
Jeroen van Rooij
,
John van Swieten
,
Pieter de Visser
,
Michael Wagner
,
David Wallon
,
Julie Williams
,
Aline Zarea
,
Flora Alarcon
(29)
,
Dominique Campion
,
Grégory Nuel
,
Gaël Nicolas
1
GPMCND -
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques
2 CHU Rouen
3 Service de neurologie [Rouen]
4 UNIROUEN UFR Santé - UNIROUEN - UFR Santé
5 CHU Amiens-Picardie
6 LNFP - Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559
7 CNRMAJ - Centre national de référence pour les malades Alzheimer jeunes
8 IMN - Institut des Maladies Neurodégénératives [Bordeaux]
9 CHU Trousseau [Tours]
10 CHCB - Centre Hospitalier de la Côte Basque
11 UB - Université de Bourgogne
12 Université Lille Nord (France)
13 AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris]
14 CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153) - Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité
15 Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France]
16 EPOPé [CRESS - U1153 / UMR_A 1125] - Obstetrical, Perinatal and Pediatric Epidemiology | Épidémiologie Obstétricale, Périnatale et Pédiatrique
17 Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité
18 Service de Neurologie [CHU Rennes]
19 Département Neurologie [CHU Toulouse]
20 Département de neurologie [Montpellier]
21 CHU Strasbourg - Centre Hospitalier Universitaire [Strasbourg]
22 ICube - Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie
23 CMRR Strasbourg - Centre Mémoire Ressources et Recherche [Strasbourg]
24 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
25 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
26 Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen]
27 EpiMaCT - Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale
28 GGB - Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078)
29 MAP5 - UMR 8145 - Mathématiques Appliquées Paris 5
2 CHU Rouen
3 Service de neurologie [Rouen]
4 UNIROUEN UFR Santé - UNIROUEN - UFR Santé
5 CHU Amiens-Picardie
6 LNFP - Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559
7 CNRMAJ - Centre national de référence pour les malades Alzheimer jeunes
8 IMN - Institut des Maladies Neurodégénératives [Bordeaux]
9 CHU Trousseau [Tours]
10 CHCB - Centre Hospitalier de la Côte Basque
11 UB - Université de Bourgogne
12 Université Lille Nord (France)
13 AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris]
14 CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153) - Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité
15 Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France]
16 EPOPé [CRESS - U1153 / UMR_A 1125] - Obstetrical, Perinatal and Pediatric Epidemiology | Épidémiologie Obstétricale, Périnatale et Pédiatrique
17 Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité
18 Service de Neurologie [CHU Rennes]
19 Département Neurologie [CHU Toulouse]
20 Département de neurologie [Montpellier]
21 CHU Strasbourg - Centre Hospitalier Universitaire [Strasbourg]
22 ICube - Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie
23 CMRR Strasbourg - Centre Mémoire Ressources et Recherche [Strasbourg]
24 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
25 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
26 Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen]
27 EpiMaCT - Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale
28 GGB - Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078)
29 MAP5 - UMR 8145 - Mathématiques Appliquées Paris 5
Catherine Schramm
- Fonction : Auteur
- PersonId : 776184
- ORCID : 0000-0002-1185-8809
Camille Charbonnier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1223285
- ORCID : 0000-0003-1172-0196
- IdRef : 170104796
Daniela Andriuta
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 1146423
- ORCID : 0000-0002-1191-7178
- IdRef : 181377853
Pierre Anthony
- Fonction : Auteur
Mélanie Barbay
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 1155750
- ORCID : 0000-0002-7016-7741
- IdRef : 190059109
Yannick Béjot
- Fonction : Auteur
Claire Boutoleau Bretonnière
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1290711
- IdRef : 073681458
Pascaline Cassagnaud
- Fonction : Auteur
Giovanni Castelnovo
- Fonction : Auteur
Christine Champion
- Fonction : Auteur
Annabelle Chaussenot
- Fonction : Auteur
Mathieu Ceccaldi
- Fonction : Auteur
Valérie Chauviré
- Fonction : Auteur
Yaohua Chen
- Fonction : Auteur
Julien Cogez
- Fonction : Auteur
Emmanuel Cognat
- Fonction : Auteur
Fabienne Contegal-Callier
- Fonction : Auteur
Lea Corneille
- Fonction : Auteur
Philippe Couratier
- Fonction : Auteur
Hélène Courtemanche
- Fonction : Auteur
Benjamin Cretin
- Fonction : Auteur
Charlotte Crinquette
- Fonction : Auteur
Bernard Croisille
- Fonction : Auteur
Benjamin Dauriat
- Fonction : Auteur
Sophie Dautricourt
- Fonction : Auteur
Vincent de la Sayette
- Fonction : Auteur
Astrid de Liège
- Fonction : Auteur
Marie de Verdal
- Fonction : Auteur
Didier Deffond
- Fonction : Auteur
Emmanuelle Génin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 181372
- IdHAL : emmanuelle-genin
- ORCID : 0000-0003-4117-2813
- IdRef : 114211302
Benoit Delpont
- Fonction : Auteur
Florence Demurger
- Fonction : Auteur
Vincent Deramecourt
- Fonction : Auteur
Céline Derollez
- Fonction : Auteur
Mira Didic
- Fonction : Auteur
Giulia Diemert
- Fonction : Auteur
Elsa Dionet
- Fonction : Auteur
Philippe Diraison
- Fonction : Auteur
Aude Doan
- Fonction : Auteur
Martine Doco Fenzy
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1115002
- ORCID : 0000-0001-7429-6201
- IdRef : 075681404
Boris Dufournet
- Fonction : Auteur
Julien Dumurgier
- Fonction : Auteur
Hélène Durand
- Fonction : Auteur
Anaïs Dutray
- Fonction : Auteur
Frédérique Etcharry-Bouyx
- Fonction : Auteur
- PersonId : 992844
Maïté Formaglio
- Fonction : Auteur
Audrey Gabelle
- Fonction : Auteur
Anne Gainche-Salmon
- Fonction : Auteur
Jean-Claude Getenet
- Fonction : Auteur
Emmanuelle Ginglinger
- Fonction : Auteur
Olivier Godefroy
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 901333
- ORCID : 0000-0001-6789-6620
- IdRef : 068994737
Mathilde Graber
- Fonction : Auteur
Chloé Gregoire
- Fonction : Auteur
Stephan Grimaldi
- Fonction : Auteur
Julien Gueniat
- Fonction : Auteur
Claude Gueriot
- Fonction : Auteur
Sophie Haffen
- Fonction : Auteur
Lorraine Hamelin
- Fonction : Auteur
Didier Hannequin
- Fonction : Auteur
Cezara Hanta
- Fonction : Auteur
Clémence Hardy
- Fonction : Auteur
Geoffroy Hautecloque
- Fonction : Auteur
Camille Heitz
- Fonction : Auteur
Claire Hourregue
- Fonction : Auteur
Thérèse Jonveaux
- Fonction : Auteur
Snejana Jurici
- Fonction : Auteur
Catia Khoumri
- Fonction : Auteur
Lejla Koric
- Fonction : Auteur
Pierre Krolak-Salmon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 920058
Pierre Labauge
- Fonction : Auteur
Morgane Lacour
- Fonction : Auteur
Julien Lagarde
- Fonction : Auteur
Hélène-Marie Lanoiselée
- Fonction : Auteur
Brice Laurens
- Fonction : Auteur
Isabelle Le Ber
- Fonction : Auteur
Gwenaël Le Guyader
- Fonction : Auteur
Amélie Leblanc
- Fonction : Auteur
Thibaud Lebouvier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 754049
- IdHAL : thibaud-lebouvier
- ORCID : 0000-0002-6630-394X
- IdRef : 177112190
Anaïs Lippi
- Fonction : Auteur
Marie-Anne Mackowiak
- Fonction : Auteur
Eloi Magnin
- Fonction : Auteur
Cecilia Marelli
- Fonction : Auteur
Olivier Martinaud
- Fonction : Auteur
Aurélien Maureille
- Fonction : Auteur
Emilie Milongo-Rigal
- Fonction : Auteur
Sophie Mohr
- Fonction : Auteur
Hélène Mollion
- Fonction : Auteur
Olivier Moreaud
- Fonction : Auteur
Alexandre Morin
- Fonction : Auteur
Gaël Nicolas
- Fonction : Auteur
Julia Nivelle
- Fonction : Auteur
Camille Noiray
- Fonction : Auteur
Elisabeth Ollagnon-Roman
- Fonction : Auteur
Claire Paquet
- Fonction : Auteur
Jérémie Pariente
- Fonction : Auteur
- PersonId : 960621
- ORCID : 0000-0002-9850-296X
- IdRef : 05673736X
Florence Pasquier
- Fonction : Auteur
Alexandre Perron
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1146513
- ORCID : 0000-0002-4281-3339
- IdRef : 241693675
Nathalie Philippi
- Fonction : Auteur
Virginie Pichon
- Fonction : Auteur
Vincent Planche
- Fonction : Auteur
Céline Poirsier
- Fonction : Auteur
Marie Rafiq
- Fonction : Auteur
Pauline Rod-Olivieri
- Fonction : Auteur
Adeline Rollin-Sillaire
- Fonction : Auteur
Carole Roué-Jagot
- Fonction : Auteur
Dario Saracino
- Fonction : Auteur
Marie Sarazin
- Fonction : Auteur
Mathilde Sauvée
- Fonction : Auteur
François Sellal
- Fonction : Auteur
Lila Sirven Villaros
- Fonction : Auteur
Christel Thauvin
- Fonction : Auteur
Camille Tisserand
- Fonction : Auteur
Christophe Tomasino
- Fonction : Auteur
Cédric Turpinat
- Fonction : Auteur
Laurène van Damme
- Fonction : Auteur
Olivier Vercruysse
- Fonction : Auteur
Alice Voilly
- Fonction : Auteur
Nathalie Wagemann
- Fonction : Auteur
David Wallon
- Fonction : Auteur
Aline Zarea
- Fonction : Auteur
Anne Boland
- Fonction : Auteur
Jean-François Deleuze
- Fonction : Auteur
Robert Olaso
- Fonction : Auteur
Shahzad Ahmad
- Fonction : Auteur
Philippe Amouyel
- Fonction : Auteur
Claudine Berr
- Fonction : Auteur
Anne Boland
- Fonction : Auteur
Paola Bossu
- Fonction : Auteur
Femke Bouwman
- Fonction : Auteur
Jose Bras
- Fonction : Auteur
Dominique Campion
- Fonction : Auteur
Camille Charbonnier
- Fonction : Auteur
Jordi Clarimon
- Fonction : Auteur
Antonio Daniele
- Fonction : Auteur
Jean-François Dartigues
- Fonction : Auteur
Stéphanie Debette
- Fonction : Auteur
Jean-François Deleuze
- Fonction : Auteur
Nicola Denning
- Fonction : Auteur
Oriol Dols-Icardo
- Fonction : Auteur
Nick Fox
- Fonction : Auteur
Daniela Galimberti
- Fonction : Auteur
Hans Gille
- Fonction : Auteur
Benjamin Grenier-Boley
- Fonction : Auteur
Detelina Grozeva
- Fonction : Auteur
Rita Guerreiro
- Fonction : Auteur
John Hardy
- Fonction : Auteur
Clive Holmes
- Fonction : Auteur
Henne Holstege
- Fonction : Auteur
Marc Hulsman
- Fonction : Auteur
Holger Hummerich
- Fonction : Auteur
M. Arfan Ikram
- Fonction : Auteur
M. Kamran Ikram
- Fonction : Auteur
Iris Jansen
- Fonction : Auteur
Amit Kawalia
- Fonction : Auteur
Robert Kraaij
- Fonction : Auteur
Jean-Charles Lambert
- Fonction : Auteur
Marc Lathrop
- Fonction : Auteur
Afina Lemstra
- Fonction : Auteur
Alberto Lleo
- Fonction : Auteur
Lauren Luckcuck
- Fonction : Auteur
Marcel Mannens
- Fonction : Auteur
Rachel Marshall
- Fonction : Auteur
Carlo Masullo
- Fonction : Auteur
Simon Mead
- Fonction : Auteur
Patrizia Mecocci
- Fonction : Auteur
Alun Meggy
- Fonction : Auteur
Merel Mol
- Fonction : Auteur
Kevin Morgan
- Fonction : Auteur
Benedetta Nacmias
- Fonction : Auteur
Gaël Nicolas
- Fonction : Auteur
Penny Norsworthy
- Fonction : Auteur
Florence Pasquier
- Fonction : Auteur
Pau Pastor
- Fonction : Auteur
Olivier Quenez
- Fonction : Auteur
Alfredo Ramirez
- Fonction : Auteur
Rachel Raybould
- Fonction : Auteur
Richard Redon
- Fonction : Auteur
Marcel Reinders
- Fonction : Auteur
Anne-Claire Richard
- Fonction : Auteur
Steffi Riedel-Heller
- Fonction : Auteur
Fernando Rivadeneira
- Fonction : Auteur
Stéphane Rousseau
- Fonction : Auteur
Natalie Ryan
- Fonction : Auteur
Salha Saad
- Fonction : Auteur
Pascual Sanchez-Juan
- Fonction : Auteur
Philip Scheltens
- Fonction : Auteur
Jonathan Schott
- Fonction : Auteur
Davide Seripa
- Fonction : Auteur
Daoud Sie
- Fonction : Auteur
Rebecca Sims
- Fonction : Auteur
Erik Sistermans
- Fonction : Auteur
Sandro Sorbi
- Fonction : Auteur
Resie van Spaendonk
- Fonction : Auteur
Gianfranco Spalleta
- Fonction : Auteur
Nicćolo Tesi
- Fonction : Auteur
Betty Tijms
- Fonction : Auteur
André Uitterlinden
- Fonction : Auteur
Wiesje van der Flier
- Fonction : Auteur
Sven van der Lee
- Fonction : Auteur
Cornelia van Duijn
- Fonction : Auteur
Jeroen van Rooij
- Fonction : Auteur
John van Swieten
- Fonction : Auteur
Pieter de Visser
- Fonction : Auteur
Michael Wagner
- Fonction : Auteur
David Wallon
- Fonction : Auteur
Julie Williams
- Fonction : Auteur
Aline Zarea
- Fonction : Auteur
Dominique Campion
- Fonction : Auteur
Grégory Nuel
- Fonction : Auteur
Gaël Nicolas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178691
- IdHAL : gael-nicolas1
- ORCID : 0000-0001-9391-7800
- IdRef : 165828412
Résumé
Abstract Background Alzheimer disease (AD) is a common complex disorder with a high genetic component. Loss-of-function (LoF) SORL1 variants are one of the strongest AD genetic risk factors. Estimating their age-related penetrance is essential before putative use for genetic counseling or preventive trials. However, relative rarity and co-occurrence with the main AD risk factor, APOE -ε4, make such estimations difficult. Methods We proposed to estimate the age-related penetrance of SORL1 -LoF variants through a survival framework by estimating the conditional instantaneous risk combining (i) a baseline for non-carriers of SORL1- LoF variants, stratified by APOE-ε4 , derived from the Rotterdam study ( N = 12,255), and (ii) an age-dependent proportional hazard effect for SORL1- LoF variants estimated from 27 extended pedigrees (including 307 relatives ≥ 40 years old, 45 of them having genotyping information) recruited from the French reference center for young Alzheimer patients. We embedded this model into an expectation-maximization algorithm to accommodate for missing genotypes. To correct for ascertainment bias, proband phenotypes were omitted. Then, we assessed if our penetrance curves were concordant with age distributions of APOE -ε4-stratified SORL1- LoF variant carriers detected among sequencing data of 13,007 cases and 10,182 controls from European and American case-control study consortia. Results SORL1- LoF variants penetrance curves reached 100% (95% confidence interval [99–100%]) by age 70 among APOE -ε4ε4 carriers only, compared with 56% [40–72%] and 37% [26–51%] in ε4 heterozygous carriers and ε4 non-carriers, respectively. These estimates were fully consistent with observed age distributions of SORL1- LoF variant carriers in case-control study data. Conclusions We conclude that SORL1- LoF variants should be interpreted in light of APOE genotypes for future clinical applications.
Origine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
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