Meta-analysis of epigenome-wide association studies in newborns and children show widespread sex differences in blood DNA methylation - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Mutation Research - Reviews Année : 2022

Meta-analysis of epigenome-wide association studies in newborns and children show widespread sex differences in blood DNA methylation

Olivia Solomon (1) , Karen Huen (1) , Paul Yousefi (2) , Leanne Küpers (3, 4) , Juan González , Matthew Suderman (2) , Sarah Reese (5) , Christian Page (6, 7) , Olena Gruzieva , Peter Rzehak (8) , Lu Gao , Kelly Bakulski (9) , Alexei Novoloaca (10) , Catherine Allard (11) , Irene Pappa , Maria Llambrich (12) , Marta Vives (13) , Dereje Jima (14) , Tuomas Kvist (15) , Andrea Baccarelli (16) , Cory White , Faisal Rezwan , Gemma Sharp , Gwen Tindula , Anna Bergström , Veit Grote , John Dou , Elena Isaevska , Maria Magnus , Eva Corpeleijn , Patrice Perron , Vincent W.V. Jaddoe , Ellen Nohr , Lea Maitre , Maria Foraster , Cathrine Hoyo , Siri Håberg , Jari Lahti , Dawn Demeo , Hongmei Zhang , Wilfried Karmaus , Inger Kull , Berthold Koletzko , Jason Feinberg , Luigi Gagliardi , Luigi Bouchard , Cecilia Høst Ramlau-Hansen , Henning Tiemeier , Gillian Santorelli , Rachel Maguire , Darina Czamara , Augusto Litonjua , Jean-Paul Langhendries , Michelle Plusquin , Johanna Lepeule , Elisabeth Binder , Elvira Verduci , Terence Dwyer , Ángel Carracedo , Natalia Ferre , Brenda Eskenazi , Manolis Kogevinas , Tim Nawrot , Monica Munthe-Kaas , Zdenko Herceg , Caroline Relton , Erik Melén , Dariusz Gruszfeld , Carrie Breton , M.D. Fallin , Akram Ghantous , Wenche Nystad , Barbara Heude (17) , Harold Snieder , Marie-France Hivert , Janine Felix , Thorkild I.A. Sørensen , Mariona Bustamante , Susan Murphy , Katri Raikkönen , Emily Oken , John Holloway , Syed Hasan Arshad , Stephanie London , Nina Holland
Juan González
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Olena Gruzieva
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Lu Gao
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Irene Pappa
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Cory White
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Faisal Rezwan
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Gemma Sharp
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Gwen Tindula
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Veit Grote
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Elena Isaevska
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Maria Magnus
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Eva Corpeleijn
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Patrice Perron
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Vincent W.V. Jaddoe
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Siri Håberg
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Jari Lahti
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Dawn Demeo
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Wilfried Karmaus
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Inger Kull
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Berthold Koletzko
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Jason Feinberg
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Luigi Gagliardi
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Darina Czamara
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Augusto Litonjua
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Terence Dwyer
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Monica Munthe-Kaas
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Dariusz Gruszfeld
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Carrie Breton
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M.D. Fallin
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Akram Ghantous
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Wenche Nystad
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Harold Snieder
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Marie-France Hivert
Janine Felix
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Thorkild I.A. Sørensen
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Mariona Bustamante
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Susan Murphy
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Katri Raikkönen
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Emily Oken
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John Holloway
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Syed Hasan Arshad
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Stephanie London
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Nina Holland
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Résumé

OBJECTIVE Maternal glycemic dysregulation during pregnancy increases the risk of adverse health outcomes in her offspring, a risk thought to be linearly related to maternal hyperglycemia. It is hypothesized that changes in offspring DNA methylation (DNAm) underline these associations. RESEARCH DESIGN AND METHODS To address this hypothesis, we conducted fixed-effects meta-analyses of epigenome-wide association study (EWAS) results from eight birth cohorts investigating relationships between cord blood DNAm and fetal exposure to maternal glucose (Nmaximum = 3,503), insulin (Nmaximum = 2,062), and area under the curve of glucose (AUCgluc) following oral glucose tolerance tests (Nmaximum = 1,505). We performed lookup analyses for identified cytosine-guanine dinucleotides (CpGs) in independent observational cohorts to examine associations between DNAm and cardiometabolic traits as well as tissue-specific gene expression. RESULTS Greater maternal AUCgluc was associated with lower cord blood DNAm at neighboring CpGs cg26974062 (β [SE] −0.013 [2.1 × 10−3], P value corrected for false discovery rate [PFDR] = 5.1 × 10−3) and cg02988288 (β [SE]−0.013 [2.3 × 10−3], PFDR = 0.031) in TXNIP. These associations were attenuated in women with GDM. Lower blood DNAm at these two CpGs near TXNIP was associated with multiple metabolic traits later in life, including type 2 diabetes. TXNIP DNAm in liver biopsies was associated with hepatic expression of TXNIP. We observed little evidence of associations between either maternal glucose or insulin and cord blood DNAm. CONCLUSIONS Maternal hyperglycemia, as reflected by AUCgluc, was associated with lower cord blood DNAm at TXNIP. Associations between DNAm at these CpGs and metabolic traits in subsequent lookup analyses suggest that these may be candidate loci to investigate in future causal and mediation analyses.

Dates et versions

hal-03935088 , version 1 (11-01-2023)

Identifiants

Citer

Olivia Solomon, Karen Huen, Paul Yousefi, Leanne Küpers, Juan González, et al.. Meta-analysis of epigenome-wide association studies in newborns and children show widespread sex differences in blood DNA methylation. Mutation Research - Reviews, 2022, 789 (3), pp.108415. ⟨10.1016/j.mrrev.2022.108415⟩. ⟨hal-03935088⟩
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