Plan d'expérience pour identifier des antagonistes microbiens de Plasmopara viticola, un agent pathogène foliaire majeur de la vigne cultivée (Vitis vinifera L.) - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Poster De Conférence Année : 2022

Experimental design to identify microbial antagonists of Plasmopara viticola, a major foliar pathogen of cultivated grapevine vine (Vitis vinifera L.)

Plan d'expérience pour identifier des antagonistes microbiens de Plasmopara viticola, un agent pathogène foliaire majeur de la vigne cultivée (Vitis vinifera L.)

Résumé

Viticulture represents only 3% of the useful agricultural surface in France but is a major user of phytosanitary products. The VITAE research program (2020-26) will combine several approaches to reduce the use of these products. One of these approaches is the development of microbial biocontrol of the major foliar disease downy mildew, caused by Plasmopara viticola. In order to identify the microorganisms naturally present in vineyards that could be antagonists of the pathogens, we will select pairs of plots differing significantly in frequency and intensity of downy mildew symptoms in several French regions. A sampling campaign of vine leaves and surface soil will then be carried out in spring, before the first fungicide treatments, in order to capture respectively the microbiota present on the leaves at the arrival of the first zoospores and the microbiota likely to be in contact with the oospores. This sampling campaign will allow us to identify microorganisms that could interfere with the asexual (leaf microbiota) and/or sexual (soil microbiota) stages of P. viticola. We will use metabarcoding approaches and differential abundance analyses to detect bacterial and fungal taxa significantly associated with "healthy" plots. A key step in this project will be to select pairs of plots that differ significantly in the frequency and intensity of downy mildew symptoms, all things being as similar as possible. To select the plots, we will use long-term epidemiological surveys conducted in France on untreated vineyard plots provided by the Institut Français de la Vigne et du Vin (IFV). This poster presents the method used to select the plot pairs and the geographical map of the plots in which the sampling campaigns will be conducted.
La viticulture ne représente que 3% de la surface agricole utile en France mais est un utilisateur important de produits phytosanitaires. Le programme de recherche VITAE (2020-26) combinera plusieurs approches pour réduire l'utilisation de ces produits. Une de ces approches est le développement du biocontrôle microbien de la maladie foliaire majeure qu'est le mildiou, causée par Plasmopara viticola. Afin d'identifier les micro-organismes naturellement présents dans les vignobles qui pourraient être des antagonistes des pathogènes, nous sélectionnerons des paires de parcelles différant significativement en fréquence et en intensité des symptômes du mildiou dans plusieurs régions françaises. Une campagne d'échantillonnage des feuilles de vigne et du sol de surface sera ensuite réalisée au printemps, avant les premiers traitements fongicides, afin de capturer respectivement le microbiote présent sur les feuilles à l'arrivée des premières zoospores et le microbiote susceptible d'être en contact avec les oospores. Cette campagne d'échantillonnage nous permettra d'identifier les microorganismes qui pourraient interférer avec les stades asexués (microbiote foliaire) et/ou sexués (microbiote du sol) de P. viticola. Nous utiliserons des approches de métabarcodage et des analyses d'abondance différentielle pour détecter les taxons bactériens et fongiques significativement associés aux parcelles " saines ". Une étape clé de ce projet consistera à sélectionner des paires de parcelles qui diffèrent significativement dans la fréquence et l'intensité des symptômes du mildiou, toutes choses étant aussi similaires que possible. Pour sélectionner les parcelles, nous utiliserons des enquêtes épidémiologiques à long terme menées en France sur les parcelles de vignes non traitées fournies par l'Institut Français de la Vigne et du Vin (IFV). Ce poster présente la méthode utilisée pour sélectionner les paires de parcelles et la carte géographique des parcelles dans lesquelles seront menées les campagnes d'échantillonnage.
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Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-03931589 , version 1 (09-01-2023)

Identifiants

  • HAL Id : hal-03931589 , version 1

Citer

Paola Fournier, Marc Raynal, Christian Debord, François Delmotte, Laurent Deliere, et al.. Plan d'expérience pour identifier des antagonistes microbiens de Plasmopara viticola, un agent pathogène foliaire majeur de la vigne cultivée (Vitis vinifera L.). 13èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie d'Aussois 2022, Sep 2022, Aussois, France. ⟨hal-03931589⟩
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