Le chaos croissant de la génomique des populations des bacilles de la tuberculose à l'ère des big data - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2022

Le chaos croissant de la génomique des populations des bacilles de la tuberculose à l'ère des big data

Résumé

Le séquençage toujours plus important de souches de Mycobacterium tuberculosis (plus de 100000 génomes sont actuellement disponibles) devrait en théorie nous permettre une meilleure connaissance des diverses lignées existantes de cette bactérie, qui à l'heure du séquençage haut débit se définissent dorénavant en termes de mutations génomiques. Cependant, les propositions de lignées se suivent (Coll, puis Napier et Freschi, au cours des cinq dernières années), mais ne se ressemblent pas. Plus exactement, ces définitions proposées sont incompatibles entre elles quand on regarde dans les détails, et certaines deviennent inutilisables car trop complexes. Enfin, de nombreuses définitions de lignées proposées s'avèrent après coup erronées, quand on les applique à de nouveaux génomes séquencés. Le but de cette communication est de faire état de ce désordre dans la nomenclature, et d'appeler à un travail en profondeur permettant d'obtenir enfin une norme solide pour l'établissement des lignées chez M.tuberculosis.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-03812998 , version 1 (13-10-2022)

Identifiants

  • HAL Id : hal-03812998 , version 1

Citer

Christophe Sola, Christophe Guyeux, Gaëtan Senelle. Le chaos croissant de la génomique des populations des bacilles de la tuberculose à l'ère des big data. SFM Mycodays, Jun 2022, Lyon, France. ⟨hal-03812998⟩
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