The FLUXNET2015 dataset and the ONEFlux processing pipeline for eddy covariance data - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue (Data Paper) Scientific Data Année : 2020

The FLUXNET2015 dataset and the ONEFlux processing pipeline for eddy covariance data

Gilberto Pastorello (1) , Carlo Trotta (2) , Eleonora Canfora (2) , Housen Chu (1) , Danielle Christianson (1) , You-Wei Cheah (1) , Cristina Poindexter (3) , Jiquan Chen (4) , Abdelrahman Elbashandy (1) , Marty Humphrey (5) , Peter Isaac , Diego Polidori (2) , Markus Reichstein (6) , Alessio Ribeca (2) , Catharine van Ingen (1) , Nicolas Vuichard (7) , Leiming Zhang (8) , Brian Amiro (9) , Christof Ammann (10) , M. Altaf Arain (11) , Jonas Ardö (12) , Timothy Arkebauer (13) , Stefan Arndt (14) , Nicola Arriga (15) , Marc Aubinet (16) , Mika Aurela (17) , Dennis Baldocchi (18) , Alan Barr (19) , Eric Beamesderfer (11) , Luca Belelli Marchesini (20) , Onil Bergeron , Jason Beringer (21) , Christian Bernhofer (22) , Daniel Berveiller (23) , Dave Billesbach (13) , Thomas Andrew Black (24) , Peter Blanken (25) , Gil Bohrer (26) , Julia Boike (27) , Paul Bolstad (28) , Damien Bonal (29) , Jean-Marc Bonnefond (30) , David Bowling (31) , Rosvel Bracho (32) , Jason Brodeur (11) , Christian Brümmer (33) , Nina Buchmann (34) , Benoit Burban (35) , Sean Burns (25) , Pauline Buysse (36) , Peter Cale , Mauro Cavagna (37) , Pierre Cellier (36) , Shiping Chen (8) , Isaac Chini (37) , Torben Christensen (38) , James Cleverly (39) , Alessio Collalti (40) , Claudia Consalvo , Bruce Cook (41) , David Cook (42) , Carole Coursolle (43) , Edoardo Cremonese , Peter Curtis (26) , Ettore D’andrea (40) , Humberto da Rocha (44) , Xiaoqin Dai (8) , Kenneth Davis (45) , Bruno De Cinti (40) , Agnes De Grandcourt (46) , Anne De Ligne (16) , Raimundo de Oliveira , Nicolas Delpierre (23) , Ankur Desai (47) , Carlos Marcelo Di Bella , Paul Di Tommasi (40) , Han Dolman (48) , Francisco Domingo (49) , Gang Dong (50) , Sabina Dore , Pierpaolo Duce (40) , Eric Dufrêne (23) , Allison Dunn (51) , Jiří Dušek (52) , Derek Eamus , Uwe Eichelmann , Hatim Abdalla M. Elkhidir , Werner Eugster , Cacilia Ewenz , Brent Ewers , Daniela Famulari , Silvano Fares , Iris Feigenwinter , Andrew Feitz , Rasmus Fensholt , Gianluca Filippa , Marc Fischer , John Frank , Marta Galvagno , Mana Gharun , Damiano Gianelle , Bert Gielen , Beniamino Gioli , Anatoly Gitelson , Ignacio Goded , Mathias Goeckede , Allen Goldstein , Christopher Gough , Michael Goulden , Alexander Graf , Anne Griebel , Carsten Gruening , Thomas Grünwald , Albin Hammerle , Shijie Han , Xingguo Han , Birger Ulf Hansen , Chad Hanson , Juha Hatakka , Yongtao He , Markus Hehn , Bernard Heinesch , Nina Hinko-Najera , Lukas Hörtnagl , Lindsay Hutley , Andreas Ibrom , Hiroki Ikawa , Marcin Jackowicz-Korczynski , Dalibor Janouš , Wilma Jans , Rachhpal Jassal , Shicheng Jiang , Tomomichi Kato , Myroslava Khomik , Janina Klatt , Alexander Knohl , Sara Knox , Hideki Kobayashi , Georgia Koerber , Olaf Kolle , Yoshiko Kosugi , Ayumi Kotani , Andrew Kowalski , Bart Kruijt , Julia Kurbatova , Werner Kutsch , Hyojung Kwon , Samuli Launiainen , Tuomas Laurila , Bev Law , Ray Leuning , Yingnian Li , Michael Liddell , Jean-Marc Limousin (53) , Marryanna Lion , Adam Liska , Annalea Lohila , Ana López-Ballesteros , Efrén López-Blanco , Benjamin Loubet , Denis Loustau (30) , Antje Lucas-Moffat , Johannes Lüers , Siyan Ma , Craig Macfarlane , Vincenzo Magliulo , Regine Maier , Ivan Mammarella , Giovanni Manca , Barbara Marcolla , Hank Margolis , Serena Marras , William Massman , Mikhail Mastepanov , Roser Matamala , Jaclyn Hatala Matthes , Francesco Mazzenga , Harry Mccaughey , Ian Mchugh , Andrew Mcmillan , Lutz Merbold , Wayne Meyer , Tilden Meyers , Scott Miller , Stefano Minerbi , Uta Moderow , Russell Monson , Leonardo Montagnani , Caitlin Moore , Eddy Moors , Virginie Moreaux (30) , Christine Moureaux , J. William Munger , Taro Nakai , Johan Neirynck , Zoran Nesic , Giacomo Nicolini , Asko Noormets , Matthew Northwood , Marcelo Nosetto , Yann Nouvellon , Kimberly Novick , Walter Oechel , Jørgen Eivind Olesen , Jean-Marc Ourcival , Shirley Papuga , Frans-Jan Parmentier , Eugenie Paul-Limoges , Marian Pavelka , Matthias Peichl , Elise Pendall , Richard Phillips , Kim Pilegaard , Norbert Pirk , Gabriela Posse , Thomas Powell , Heiko Prasse , Suzanne Prober , Serge Rambal (53) , Üllar Rannik , Naama Raz-Yaseef , Corinna Rebmann , David Reed , Victor Resco De Dios , Natalia Restrepo-Coupe , Borja Reverter , Marilyn Roland , Simone Sabbatini , Torsten Sachs , Scott Saleska , Enrique Sánchez-Cañete , Zulia Sanchez-Mejia , Hans Peter Schmid , Marius Schmidt , Karl Schneider , Frederik Schrader , Ivan Schroder , Russell Scott , Pavel Sedlák , Penélope Serrano-Ortíz , Changliang Shao , Peili Shi , Ivan Shironya , Lukas Siebicke , Ladislav Šigut , Richard Silberstein , Costantino Sirca , Donatella Spano , Rainer Steinbrecher , Robert Stevens , Cove Sturtevant , Andy Suyker , Torbern Tagesson , Satoru Takanashi , Yanhong Tang , Nigel Tapper , Jonathan Thom , Michele Tomassucci , Juha-Pekka Tuovinen , Shawn Urbanski , Riccardo Valentini , Michiel van der Molen , Eva van Gorsel , Ko van Huissteden , Andrej Varlagin , Joseph Verfaillie , Timo Vesala , Caroline Vincke , Domenico Vitale , Natalia Vygodskaya , Jeffrey Walker , Elizabeth Walter-Shea , Huimin Wang , Robin Weber , Sebastian Westermann , Christian Wille , Steven Wofsy , Georg Wohlfahrt , Sebastian Wolf , William Woodgate , Yuelin Li , Roberto Zampedri , Junhui Zhang , Guoyi Zhou , Donatella Zona , Deb Agarwal , Sebastien Biraud , Margaret Torn , Dario Papale
1 LBNL - Lawrence Berkeley National Laboratory [Berkeley]
2 Università degli studi della Tuscia [Viterbo]
3 California State University [Sacramento]
4 Michigan State University System
5 University of Virginia
6 MPI-BGC - Max Planck Institute for Biogeochemistry
7 LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette]
8 CAS - Chinese Academy of Sciences [Beijing]
9 University of Manitoba [Winnipeg]
10 Agroscope
11 McMaster University [Hamilton, Ontario]
12 Skane University Hospital [Lund]
13 University of Nebraska–Lincoln
14 University of Melbourne
15 UA - University of Antwerp
16 Université de Liège
17 FMI - Finnish Meteorological Institute
18 UC Berkeley - University of California [Berkeley]
19 U of S - University of Saskatchewan [Saskatoon, Canada]
20 RUDN University - People's Friendship University of Russia [Moscow] = Rossijskij universitet družby narodov [Moskva]
21 UWA - The University of Western Australia
22 TU Dresden - Technische Universität Dresden = Dresden University of Technology
23 ESE - Ecologie Systématique et Evolution
24 UBC - University of British Columbia
25 University of Colorado [Colorado Springs]
26 OSU - The Ohio State University [Columbus]
27 HU Berlin - Humboldt-Universität zu Berlin = Humboldt University of Berlin = Université Humboldt de Berlin
28 UMN - University of Minnesota System
29 SILVA - SILVA
30 UMR ISPA - Interactions Sol Plante Atmosphère
31 University of Utah
32 UCF - University of Central Florida [Orlando]
33 Institute of Climate-Smart Agriculture
34 D-USYS - Department of Environmental Systems Science [ETH Zürich]
35 UMR ECOFOG - Ecologie des forêts de Guyane
36 ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
37 FEM - Fondazione Edmund Mach - Edmund Mach Foundation [Italie]
38 Aarhus University [Aarhus]
39 UTS - University of Technology Sydney
40 CNR - National Research Council of Italy | Consiglio Nazionale delle Ricerche
41 GSFC - NASA Goddard Space Flight Center
42 ANL - Argonne National Laboratory [Lemont]
43 ULaval - Université Laval [Québec]
44 USP - Universidade de São Paulo = University of São Paulo
45 Penn State - Pennsylvania State University
46 UMR Eco&Sols - Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes
47 University of Wisconsin-Madison
48 VU - Vrije Universiteit Amsterdam [Amsterdam]
49 CSIC - Centro de Investigaciones Biológicas
50 SXU - Shanxi University
51 Worcester State University [Worcester]
52 CAS - Czech Academy of Sciences [Prague]
53 CEFE - Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
Jiquan Chen
Peter Isaac
  • Fonction : Auteur
Brian Amiro
Christof Ammann
M. Altaf Arain
Jonas Ardö
Stefan Arndt
Mika Aurela
Onil Bergeron
  • Fonction : Auteur
Jason Beringer
Daniel Berveiller
Peter Blanken
Gil Bohrer
Damien Bonal
David Bowling
Jason Brodeur
Benoit Burban
Sean Burns
Peter Cale
  • Fonction : Auteur
Torben Christensen
James Cleverly
Claudia Consalvo
  • Fonction : Auteur
David Cook
Carole Coursolle
Edoardo Cremonese
Raimundo de Oliveira
Nicolas Delpierre
Ankur Desai
Carlos Marcelo Di Bella
  • Fonction : Auteur
Han Dolman
Francisco Domingo
Gang Dong
  • Fonction : Auteur
Sabina Dore
Allison Dunn
Derek Eamus
Uwe Eichelmann
  • Fonction : Auteur
Hatim Abdalla M. Elkhidir
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Werner Eugster
Cacilia Ewenz
Brent Ewers
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Daniela Famulari
Silvano Fares
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Iris Feigenwinter
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Andrew Feitz
Rasmus Fensholt
Gianluca Filippa
Marc Fischer
John Frank
Marta Galvagno
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Mana Gharun
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Damiano Gianelle
Bert Gielen
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Beniamino Gioli
Anatoly Gitelson
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Ignacio Goded
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Mathias Goeckede
Allen Goldstein
Christopher Gough
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Michael Goulden
Alexander Graf
Anne Griebel
Carsten Gruening
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Thomas Grünwald
Albin Hammerle
Shijie Han
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Xingguo Han
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Birger Ulf Hansen
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Chad Hanson
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Juha Hatakka
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Yongtao He
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Markus Hehn
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Bernard Heinesch
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Nina Hinko-Najera
Lukas Hörtnagl
Lindsay Hutley
Andreas Ibrom
Hiroki Ikawa
Marcin Jackowicz-Korczynski
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Dalibor Janouš
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Wilma Jans
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Rachhpal Jassal
Shicheng Jiang
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Tomomichi Kato
Myroslava Khomik
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Janina Klatt
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Alexander Knohl
Sara Knox
Hideki Kobayashi
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Georgia Koerber
Olaf Kolle
Yoshiko Kosugi
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Ayumi Kotani
Andrew Kowalski
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Bart Kruijt
Julia Kurbatova
Werner Kutsch
Hyojung Kwon
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Samuli Launiainen
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Tuomas Laurila
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Bev Law
Ray Leuning
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Michael Liddell
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Marryanna Lion
Adam Liska
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Annalea Lohila
Ana López-Ballesteros
Efrén López-Blanco
Benjamin Loubet
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Denis Loustau
Antje Lucas-Moffat
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Johannes Lüers
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Siyan Ma
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Craig Macfarlane
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Vincenzo Magliulo
Regine Maier
Ivan Mammarella
Giovanni Manca
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Barbara Marcolla
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Hank Margolis
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Serena Marras
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William Massman
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Mikhail Mastepanov
Roser Matamala
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Jaclyn Hatala Matthes
Francesco Mazzenga
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Harry Mccaughey
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Andrew Mcmillan
Lutz Merbold
Wayne Meyer
Tilden Meyers
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Scott Miller
Stefano Minerbi
Uta Moderow
Russell Monson
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Leonardo Montagnani
Caitlin Moore
Eddy Moors
Christine Moureaux
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J. William Munger
Taro Nakai
Johan Neirynck
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Zoran Nesic
Giacomo Nicolini
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Asko Noormets
Matthew Northwood
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Marcelo Nosetto
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Yann Nouvellon
Kimberly Novick
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Walter Oechel
Jørgen Eivind Olesen
Jean-Marc Ourcival
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Shirley Papuga
Frans-Jan Parmentier
Eugenie Paul-Limoges
Marian Pavelka
Matthias Peichl
Elise Pendall
Richard Phillips
Kim Pilegaard
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Norbert Pirk
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Gabriela Posse
Thomas Powell
Heiko Prasse
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Suzanne Prober
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Serge Rambal
Üllar Rannik
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Naama Raz-Yaseef
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Corinna Rebmann
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David Reed
Victor Resco De Dios
Natalia Restrepo-Coupe
Borja Reverter
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Simone Sabbatini
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Enrique Sánchez-Cañete
Zulia Sanchez-Mejia
Hans Peter Schmid
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Marius Schmidt
Karl Schneider
Frederik Schrader
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Russell Scott
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Lukas Siebicke
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Richard Silberstein
Costantino Sirca
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Donatella Spano
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Rainer Steinbrecher
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Robert Stevens
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Cove Sturtevant
Andy Suyker
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Nigel Tapper
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Riccardo Valentini
Michiel van der Molen
Eva van Gorsel
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Ko van Huissteden
Andrej Varlagin
Joseph Verfaillie
Timo Vesala
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Domenico Vitale
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Jeffrey Walker
Elizabeth Walter-Shea
Huimin Wang
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Robin Weber
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Sebastian Westermann
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Christian Wille
Steven Wofsy
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Georg Wohlfahrt
Sebastian Wolf
William Woodgate
Yuelin Li
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Roberto Zampedri
  • Fonction : Auteur
Junhui Zhang
  • Fonction : Auteur
Guoyi Zhou
Donatella Zona
Deb Agarwal
  • Fonction : Auteur
Sebastien Biraud
Margaret Torn
  • Fonction : Auteur
Dario Papale

Résumé

The FLUXNET2015 dataset provides ecosystem-scale data on CO 2 , water, and energy exchange between the biosphere and the atmosphere, and other meteorological and biological measurements, from 212 sites around the globe (over 1500 site-years, up to and including year 2014). These sites, independently managed and operated, voluntarily contributed their data to create global datasets. Data were quality controlled and processed using uniform methods, to improve consistency and intercomparability across sites. The dataset is already being used in a number of applications, including ecophysiology studies, remote sensing studies, and development of ecosystem and Earth system models. FLUXNET2015 includes derived-data products, such as gap-filled time series, ecosystem respiration and photosynthetic uptake estimates, estimation of uncertainties, and metadata about the measurements, presented for the first time in this paper. In addition, 206 of these sites are for the first time distributed under a Creative Commons (CC-BY 4.0) license. This paper details this enhanced dataset and the processing methods, now made available as open-source codes, making the dataset more accessible, transparent, and reproducible.
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Pastorello et a. 2020 s41597-020-0534-3-1.pdf (2.68 Mo) Télécharger le fichier
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hal-03778635 , version 1 (16-09-2022)

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Citer

Gilberto Pastorello, Carlo Trotta, Eleonora Canfora, Housen Chu, Danielle Christianson, et al.. The FLUXNET2015 dataset and the ONEFlux processing pipeline for eddy covariance data. Scientific Data , 2020, 7 (1), pp.1-27. ⟨10.1038/s41597-020-0534-3⟩. ⟨hal-03778635⟩
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