-La variabilité océanique de sous-mésoéchelle (fronts, filaments, ondes, < 10 km, <1 semaine) joue un rôle potentiellement important dans le fonctionnement physique et biologique de l'Océan, notamment du fait des échanges entre l'océan profond et la surface. Une nouvelle méthode d'observation de cette variabilité consiste à monitorer par géolocalisation acoustique la dérive d'une meute de flotteurs autonomes déployées dans des structures de sous-mésoéchelle d'intérêt. Cette géolocalisation nécessite la résolution d'un problème inverse qui repose sur l'estimation du canal de propagation acoustique sous-marin. Dans cet article, une méthode d'estimation de canal est proposée. Elle repose sur le formalisme du rapport de vraisemblance généralisé multi-familles et est adaptée aux canaux multi-trajets et multi-échelles propres à notre contexte. Ses performances sont validées à l'aide d'un simulateur couplant des modèles océanographiques et acoustiques.