Disease model discovery from 3,328 gene knockouts by The International Mouse Phenotyping Consortium
Terrence Meehan
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Nathalie Conte
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David West
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Julius Jacobsen
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Jeremy Mason
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Jonathan Warren
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Chao Chen
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Ilinca Tudose
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Mike Relac
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Peter Matthews
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Natasha Karp
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Luis Santos
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Tanja Fiegel
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Natalie Ring
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Henrik Westerberg
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Simon Greenaway
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Duncan Sneddon
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Hugh Morgan
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Gemma Codner
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Michelle Stewart
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James Brown
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Neil Horner
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Consortium International Mouse Phenotyping
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Melissa Haendel
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Nicole Washington
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Christopher Mungall
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Corey Reynolds
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Juan Gallegos
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Valerie Gailus-Durner
,
Tania Sorg-Guss
(1, 2)
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Guillaume Pavlovic
(1, 2)
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Lynette Bower
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Mark Moore
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Iva Morse
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Xiang Gao
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Glauco Tocchini-Valentini
,
Yuichi Obata
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Soo Cho
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Je Seong
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John Seavitt
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Arthur Beaudet
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Mary Dickinson
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Yann Herault
(1, 2)
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Wolfgang Wurst
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Martin de Angelis
,
K Lloyd
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Ann Flenniken
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Lauryl Nutter
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Susan Newbigging
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Colin Mckerlie
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Monica Justice
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Stephen Murray
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Karen Svenson
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Robert Braun
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Jacqueline White
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Allan Bradley
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Paul Flicek
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Sara Wells
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William Skarnes
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David Adams
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Helen Parkinson
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Ann Mallon
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Steve Brown
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Damian Smedley
Terrence Meehan
- Fonction : Auteur
Nathalie Conte
- Fonction : Auteur
David West
- Fonction : Auteur
Julius Jacobsen
- Fonction : Auteur
Jeremy Mason
- Fonction : Auteur
- PersonId : 765082
- ORCID : 0000-0002-2796-5123
Jonathan Warren
- Fonction : Auteur
Chao Chen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 868123
- ORCID : 0000-0003-2094-9734
Ilinca Tudose
- Fonction : Auteur
Mike Relac
- Fonction : Auteur
Peter Matthews
- Fonction : Auteur
Natasha Karp
- Fonction : Auteur
Luis Santos
- Fonction : Auteur
Tanja Fiegel
- Fonction : Auteur
Natalie Ring
- Fonction : Auteur
Henrik Westerberg
- Fonction : Auteur
Simon Greenaway
- Fonction : Auteur
Duncan Sneddon
- Fonction : Auteur
Hugh Morgan
- Fonction : Auteur
Gemma Codner
- Fonction : Auteur
Michelle Stewart
- Fonction : Auteur
James Brown
- Fonction : Auteur
Neil Horner
- Fonction : Auteur
Consortium International Mouse Phenotyping
- Fonction : Auteur
Melissa Haendel
- Fonction : Auteur
Nicole Washington
- Fonction : Auteur
Christopher Mungall
- Fonction : Auteur
Corey Reynolds
- Fonction : Auteur
Juan Gallegos
- Fonction : Auteur
Valerie Gailus-Durner
- Fonction : Auteur
Tania Sorg-Guss
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1112659
Guillaume Pavlovic
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1117839
Lynette Bower
- Fonction : Auteur
Mark Moore
- Fonction : Auteur
Iva Morse
- Fonction : Auteur
Xiang Gao
- Fonction : Auteur
- PersonId : 760790
- ORCID : 0000-0002-8819-1571
Glauco Tocchini-Valentini
- Fonction : Auteur
Yuichi Obata
- Fonction : Auteur
Soo Cho
- Fonction : Auteur
Je Seong
- Fonction : Auteur
John Seavitt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797882
- ORCID : 0000-0003-3209-3187
Arthur Beaudet
- Fonction : Auteur
Mary Dickinson
- Fonction : Auteur
Yann Herault
- Fonction : Auteur
- PersonId : 741744
- IdHAL : yann-herault
- ORCID : 0000-0001-7049-6900
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Wolfgang Wurst
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758949
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Martin de Angelis
- Fonction : Auteur
K Lloyd
- Fonction : Auteur
Ann Flenniken
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797880
- ORCID : 0000-0003-1892-6154
Lauryl Nutter
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797881
- ORCID : 0000-0001-9619-146X
Susan Newbigging
- Fonction : Auteur
Colin Mckerlie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797879
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Monica Justice
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Stephen Murray
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Karen Svenson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797884
- ORCID : 0000-0002-7928-1911
Robert Braun
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797885
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Jacqueline White
- Fonction : Auteur
- PersonId : 804735
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Allan Bradley
- Fonction : Auteur
Paul Flicek
- Fonction : Auteur
- PersonId : 769433
- ORCID : 0000-0002-3897-7955
Sara Wells
- Fonction : Auteur
- PersonId : 764221
- ORCID : 0000-0002-0572-0600
William Skarnes
- Fonction : Auteur
David Adams
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758522
- ORCID : 0000-0002-8722-4108
Helen Parkinson
- Fonction : Auteur
Ann Mallon
- Fonction : Auteur
Steve Brown
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797886
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Damian Smedley
- Fonction : Auteur
Résumé
Although next-generation sequencing has revolutionized the ability to associate variants with human diseases, diagnostic rates and development of new therapies are still limited by a lack of knowledge of the functions and pathobiological mechanisms of most genes. To address this challenge, the International Mouse Phenotyping Consortium is creating a genome- and phenome-wide catalog of gene function by characterizing new knockout-mouse strains across diverse biological systems through a broad set of standardized phenotyping tests. All mice will be readily available to the biomedical community. Analyzing the first 3,328 genes identified models for 360 diseases, including the first models, to our knowledge, for type C Bernard-Soulier, Bardet-Biedl-5 and Gordon Holmes syndromes. 90% of our phenotype annotations were novel, providing functional evidence for 1,092 genes and candidates in genetically uncharacterized diseases including arrhythmogenic right ventricular dysplasia 3. Finally, we describe our role in variant functional validation with The 100,000 Genomes Project and others.