A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Nature Communications Année : 2021

A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers

Juliette Coignard (1, 2, 3, 4) , Michael Lush , Jonathan Beesley , Tracy O'Mara , Joe Dennis , Jonathan Tyrer , Daniel Barnes , Lesley Mcguffog , Goska Leslie , Manjeet Bolla , Muriel Adank , Simona Agata , Thomas Ahearn , Kristiina Aittomäki , Irene Andrulis , Hoda Anton-Culver , Volker Arndt , Norbert Arnold , Kristan Aronson , Banu Arun , Annelie Augustinsson , Jacopo Azzollini , Daniel Barrowdale , Caroline Baynes , Heiko Becher , Marina Bermisheva , Leslie Bernstein , Katarzyna Białkowska , Carl Blomqvist , Stig Bojesen , Bernardo Bonanni , Ake Borg , Hiltrud Brauch , Hermann Brenner , Barbara Burwinkel , Saundra Buys , Trinidad Caldés , Maria Caligo , Daniele Campa , Brian Carter , Jose Castelao , Jenny Chang-Claude , Stephen Chanock , Wendy Chung , Kathleen Claes , Christine Clarke , J Margriet Collée , Don Conroy , Kamila Czene , Mary Daly , Peter Devilee , Orland Diez , Yuan Chun Ding , Susan Domchek , Thilo Dörk , Isabel Dos-Santos-Silva , Alison Dunning , Miriam Dwek , Diana Eccles , a Heather Eliassen , Christoph Engel , Mikael Eriksson , D Gareth Evans , Peter Fasching , Henrik Flyger , Florentia Fostira , Eitan Friedman , Lin Fritschi , Debra Frost , Manuela Gago-Dominguez , Susan Gapstur , Judy Garber , Vanesa Garcia-Barberan , Montserrat García-Closas , José García-Sáenz , Mia Gaudet , Simon Gayther , Andrea Gehrig , Vassilios Georgoulias , Graham Giles , Andrew Godwin , Mark Goldberg , David Goldgar , Anna González-Neira , Mark Greene , Pascal Guénel (4, 5) , Lothar Haeberle , Eric Hahnen , Christopher Haiman , Niclas Håkansson , Per Hall , Ute Hamann , Patricia Harrington , Steven Hart , Wei He , Frans Hogervorst , Antoinette Hollestelle , John Hopper , Darling Horcasitas , Peter Hulick , David Hunter , Evgeny Imyanitov , Agnes Jager , Anna Jakubowska , Paul James , Uffe Birk Jensen , Esther John , Michael Jones , Rudolf Kaaks , Pooja Middha Kapoor , Beth Karlan , Renske Keeman , Elza Khusnutdinova , Johanna Kiiski , Yon-Dschun Ko , Veli-Matti Kosma , Peter Kraft , Allison Kurian , Yael Laitman , Diether Lambrechts , Loic Le Marchand , Jenny Lester , Fabienne Lesueur , Tricia Lindstrom , Adria Lopez-Fernández , Jennifer Loud , Craig Luccarini , Arto Mannermaa , Siranoush Manoukian , Sara Margolin , John Martens , Noura Mebirouk , Alfons Meindl , Austin Miller , Roger Milne , Marco Montagna , Katherine Nathanson , Susan Neuhausen , Heli Nevanlinna , Finn Nielsen , Katie O'Brien , Olufunmilayo Olopade , Janet Olson , Håkan Olsson , Ana Osorio , Laura Ottini , Tjoung-Won Park-Simon , Michael Parsons , Inge Sokilde Pedersen , Beth Peshkin , Paolo Peterlongo , Julian Peto , Paul Pharoah , Kelly-Anne Phillips , Eric Polley , Bruce Poppe , Nadege Presneau , Miquel Angel Pujana , Kevin Punie , Paolo Radice , Johanna Rantala , Muhammad Rashid , Gad Rennert , Hedy Rennert , Mark Robson , Atocha Romero , Maria Rossing , Emmanouil Saloustros , Dale Sandler , Regina Santella , Maren Scheuner , Marjanka Schmidt , Gunnar Schmidt , Christopher Scott , Priyanka Sharma , Penny Soucy , Melissa Southey , John Spinelli , Zoe Steinsnyder , Jennifer Stone , Dominique Stoppa-Lyonnet (2, 6, 7) , Anthony Swerdlow , Rulla Tamimi , William Tapper , Jack Taylor , Mary Beth Terry , Alex Teulé , Darcy Thull , Marc Tischkowitz , Amanda Toland , Diana Torres , Alison Trainer , Thérèse Truong , Nadine Tung , Celine Vachon , Ana Vega , Joseph Vijai , Qin Wang , Barbara Wappenschmidt , Clarice Weinberg , Jeffrey Weitzel , Camilla Wendt , Alicja Wolk , Siddhartha Yadav , Xiaohong Yang , Drakoulis Yannoukakos , Wei Zheng , Argyrios Ziogas , Kristin Zorn , Sue Park , Mads Thomassen , Kenneth Offit , Rita Schmutzler , Fergus Couch , Jacques Simard , Georgia Chenevix-Trench , Douglas Easton , Nadine Andrieu (1, 2, 3) , Antonis Antoniou , Tracy O’mara , Ophélie Bertrand , Sandrine Caputo , Anaïs Dupré , Marine Le Mentec , Muriel Belotti , Anne-Marie Birot , Bruno Buecher , Emmanuelle Fourme , Marion Gauthier-Villars , Lisa Golmard , Claude Houdayer , 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John Kennedy , Mary Porteous , Carole Brewer , Rosemarie Davidson , Louise Izatt , Angela Brady , Julian Barwell , Julian Adlard , Claire Foo , Fiona Lalloo , Lucy Side , Jacqueline Eason , Alex Henderson , Lisa Walker , Rosalind Eeles , Jackie Cook , Katie Snape , Alex Murray , Emma Mccann , J. Margriet Collée , A. Heather Eliassen , D. Gareth Evans , Stephen Fox , Ian Campbell , Amanda Spurdle , Penny Webb , Anna de Fazio , Margaret Tassell , Judy Kirk , Geoff Lindeman , Melanie Price , Sid Deb , David Bowtell , Annemieke van Der Hout , Ans van den Ouweland , Arjen Mensenkamp , Carolien van Deurzen , Carolien Kets , Caroline Seynaeve , Christi van Asperen , Cora Aalfs , Encarna Gómez Garcia , Flora van Leeuwen , G. de Bock , Hanne Meijers-Heijboer , Inge Obdeijn , J. Gille , Jan Oosterwijk , Juul Wijnen , Lizet van Der Kolk , Maartje Hooning , Margreet Ausems , Marian Mourits , Marinus Blok , Matti Rookus , Rob van Der Luijt , T. van Cronenburg , Carmen van Der Pol , Nicola Russell , Sabine Siesling , Lucy Overbeek , R. Wijnands , Judith de Lange , Dinny Graham , Mythily Sachchithananthan , Deborah Marsh , Rodney Scott , Robert Baxter , Desmond Yip , Jane Carpenter , Alison Davis , Nirmala Pathmanathan , Peter Simpson
Michael Lush
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Jonathan Beesley
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David Bowtell
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Caroline Seynaeve
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Christi van Asperen
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Cora Aalfs
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Juul Wijnen
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Lizet van Der Kolk
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Maartje Hooning
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Margreet Ausems
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Marian Mourits
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Marinus Blok
  • Fonction : Auteur
Matti Rookus
  • Fonction : Auteur
Rob van Der Luijt
  • Fonction : Auteur
T. van Cronenburg
  • Fonction : Auteur
Carmen van Der Pol
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Nicola Russell
  • Fonction : Auteur
Sabine Siesling
  • Fonction : Auteur
Lucy Overbeek
  • Fonction : Auteur
R. Wijnands
  • Fonction : Auteur
Judith de Lange
  • Fonction : Auteur
Dinny Graham
  • Fonction : Auteur
Mythily Sachchithananthan
  • Fonction : Auteur
Deborah Marsh
  • Fonction : Auteur
Rodney Scott
  • Fonction : Auteur
Robert Baxter
  • Fonction : Auteur
Desmond Yip
  • Fonction : Auteur
Jane Carpenter
  • Fonction : Auteur
Alison Davis
  • Fonction : Auteur
Nirmala Pathmanathan
  • Fonction : Auteur
Peter Simpson
  • Fonction : Auteur

Résumé

Breast cancer (BC) risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers varies by genetic and familial factors. About 50 common variants have been shown to modify BC risk for mutation carriers. All but three, were identified in general population studies. Other mutation carrier-specific susceptibility variants may exist but studies of mutation carriers have so far been underpowered. We conduct a novel case-only genome-wide association study comparing genotype frequencies between 60,212 general population BC cases and 13,007 cases with BRCA1 or BRCA2 mutations. We identify robust novel associations for 2 variants with BC for BRCA1 and 3 for BRCA2 mutation carriers, P < 10 −8 , at 5 loci, which are not associated with risk in the general population. They include rs60882887 at 11p11.2 where MADD , SP11 and EIF1 , genes previously implicated in BC biology, are predicted as potential targets. These findings will contribute towards customising BC polygenic risk scores for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.
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Citer

Juliette Coignard, Michael Lush, Jonathan Beesley, Tracy O'Mara, Joe Dennis, et al.. A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers. Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.1078. ⟨10.1038/s41467-020-20496-3⟩. ⟨hal-03660355⟩
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